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缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞中环状RNA的差异表达及功能预测
1
作者
陈娟
王宁
+3 位作者
夏明明
张国明
罗先琼
马健
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
北大核心
2025年第3期296-307,321,共13页
目的:探究环状RNA(circular RNA,circRNA)在缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞(human retinal microvascular endothelial cells, HRMECs)中的差异表达及其功能,为早产儿视网膜病变(retinopathy of prematurity, ROP)的发病机制提供新...
目的:探究环状RNA(circular RNA,circRNA)在缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞(human retinal microvascular endothelial cells, HRMECs)中的差异表达及其功能,为早产儿视网膜病变(retinopathy of prematurity, ROP)的发病机制提供新见解。方法:分离提取HRMECs,建立ROP细胞缺氧模型,通过全转录组测序分析circRNA差异表达谱;采用qRT-PCR验证8个差异表达circRNA(differentially expressed circular RNA, DE-circRNA),并进行GO和KEGG通路分析;利用生物信息学技术构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果:在正常培养与缺氧诱导之间共有1 714个circRNA呈现差异表达,其中899个上调,815个下调(q<0.05,差异倍数>2)。GO分析结果显示,DE-circRNA主要富集于凋亡信号通路的正调控等生物过程,而KEGG分析结果提示其主要涉及肿瘤相关信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等。circRNA-miRNA-mRNA网络分析结果表明,hsa_circ_0140253可能通过hsa-miR-210-3p/ERFE和hsa-miR-210-3p/PPARGC1A轴在ROP的发生发展中发挥潜在调控作用。结论:本研究揭示了HRMECs缺氧模型中的circRNA差异表达谱,提示hsa_circ_0140253可能通过竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)的机制参与ROP的发生发展。
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关键词
早产儿视网膜病变
缺氧
人视网膜微血管内皮细胞
环状RNA
竞争性内源RNA
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题名
缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞中环状RNA的差异表达及功能预测
1
作者
陈娟
王宁
夏明明
张国明
罗先琼
马健
机构
广州医
科
大学研究生院
深圳市眼
科
医院眼底病
科
广东省妇幼保健院儿童内分泌遗传代谢科
广东省妇幼保健院
妇女
儿童
健康研究所
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
北大核心
2025年第3期296-307,321,共13页
基金
国家自然科学基金项目(82271103)
广东省基础与应用基础研究基金委员会项目(2019A1515011417)
广州市科学技术局2025年度市校(院)企联合资助项目(SL2024A03J01382)。
文摘
目的:探究环状RNA(circular RNA,circRNA)在缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞(human retinal microvascular endothelial cells, HRMECs)中的差异表达及其功能,为早产儿视网膜病变(retinopathy of prematurity, ROP)的发病机制提供新见解。方法:分离提取HRMECs,建立ROP细胞缺氧模型,通过全转录组测序分析circRNA差异表达谱;采用qRT-PCR验证8个差异表达circRNA(differentially expressed circular RNA, DE-circRNA),并进行GO和KEGG通路分析;利用生物信息学技术构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果:在正常培养与缺氧诱导之间共有1 714个circRNA呈现差异表达,其中899个上调,815个下调(q<0.05,差异倍数>2)。GO分析结果显示,DE-circRNA主要富集于凋亡信号通路的正调控等生物过程,而KEGG分析结果提示其主要涉及肿瘤相关信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等。circRNA-miRNA-mRNA网络分析结果表明,hsa_circ_0140253可能通过hsa-miR-210-3p/ERFE和hsa-miR-210-3p/PPARGC1A轴在ROP的发生发展中发挥潜在调控作用。结论:本研究揭示了HRMECs缺氧模型中的circRNA差异表达谱,提示hsa_circ_0140253可能通过竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)的机制参与ROP的发生发展。
关键词
早产儿视网膜病变
缺氧
人视网膜微血管内皮细胞
环状RNA
竞争性内源RNA
Keywords
retinopathy of prematurity
hypoxia
human retinal microvascular endothelial cells
circular RNA
competing endogenous RNA
分类号
R722.6 [医药卫生—儿科]
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题名
作者
出处
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1
缺氧诱导的人视网膜微血管内皮细胞中环状RNA的差异表达及功能预测
陈娟
王宁
夏明明
张国明
罗先琼
马健
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
北大核心
2025
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