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用权重基因共表达网络分析识别心脏重构关键节点基因
被引量:
5
1
作者
钟诗龙
伍虹
+7 位作者
杨敏
刘晓颖
郑志伟
林秋雄
符永恒
麦丽萍
周志凌
余细勇
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1358-1362,共5页
目的采用权重基因共表达网络分析方法(WGCNA)挖掘心肌梗死后心脏重构的关键节点基因,并研究其与ACE1和ACE2的关系。方法从NCBI的GEO下载2个心肌梗死后心脏重构的全基因组表达数据GSE7487和GSE738;数据初处理后,用WGCNA构建基因共表达网...
目的采用权重基因共表达网络分析方法(WGCNA)挖掘心肌梗死后心脏重构的关键节点基因,并研究其与ACE1和ACE2的关系。方法从NCBI的GEO下载2个心肌梗死后心脏重构的全基因组表达数据GSE7487和GSE738;数据初处理后,用WGCNA构建基因共表达网络,识别与心脏重构相关的模块与关键节点基因,分析关键节点基因与ACE1和ACE2的关联性;并在心肌梗死后心脏重构大鼠模型中验证它们的关系。结果分析发现在GSE7487,17个模块中有6个模块与心脏重构相关,模块基因富集于16条KEGG信号通路。在GSE738,5个模块与心脏重构相关,模块基因富集于15条KEGG信号通路,其中有10条信号通路与第一组数据结果相同,这些信号通路涉及心肌肥厚病理、氧化磷酸化、代谢等。进一步利用模块内连通性和基因重要性找到了一些心脏重构的关键调控基因,如钙依赖磷酸酶调节子(RCAN1)。RCAN1表达与ACE1表达高度相关,但与ACE2不相关。在动物模型中验证结果与上述结果一致。结论权重基因共表达网络分析方法是一个高效的系统生物学方法,应用本方法发现了心脏重构的关键节点基因,其中RCAN1可能影响ACE1-ACE2在肾素血管紧张素系统中的平衡。
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关键词
权重基因共表达网络分析
心脏重构
关键节点基因
钙依赖磷酸酶调节子
血管紧张素转换酶1
血管紧张素转换酶2
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职称材料
AGT和CYP11B2基因多态性影响福辛普利降压疗效
2
作者
钟诗龙
于汇民
+4 位作者
余细勇
陈纪言
吴樱
林曙光
冯颖青
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期289-290,共2页
血管紧张素转换酶抑制剂(ACEI)福辛普利(fosinopril)是目前临床上的一线抗高血压药物,但其个体反应差异较大。ACEI作用于肾素-血管紧张素-醛固酮系统(RAAS),抑制ACE从而阻断AngⅠ生成AngⅡ。RAAS的关键基因的多态性对降压药的疗...
血管紧张素转换酶抑制剂(ACEI)福辛普利(fosinopril)是目前临床上的一线抗高血压药物,但其个体反应差异较大。ACEI作用于肾素-血管紧张素-醛固酮系统(RAAS),抑制ACE从而阻断AngⅠ生成AngⅡ。RAAS的关键基因的多态性对降压药的疗效具有潜在的预测作用,
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关键词
原发性高血压
血管紧张素原
醛固酮合成酶
多态性
血管紧张素转换酶抑制剂
福辛普利
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职称材料
题名
用权重基因共表达网络分析识别心脏重构关键节点基因
被引量:
5
1
作者
钟诗龙
伍虹
杨敏
刘晓颖
郑志伟
林秋雄
符永恒
麦丽萍
周志凌
余细勇
机构
广东省
人民医院
医学
研究
中心
广东省
心血管病
研究所
广东省医学科学院广东省临床药理研究所
中山大学孙逸仙纪念医院
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1358-1362,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(No81072701
81070103)
+1 种基金
广东省自然科学基金资助项目(No10151008002000002)
广东省中医药局科研课题资助项目(No2010430)
文摘
目的采用权重基因共表达网络分析方法(WGCNA)挖掘心肌梗死后心脏重构的关键节点基因,并研究其与ACE1和ACE2的关系。方法从NCBI的GEO下载2个心肌梗死后心脏重构的全基因组表达数据GSE7487和GSE738;数据初处理后,用WGCNA构建基因共表达网络,识别与心脏重构相关的模块与关键节点基因,分析关键节点基因与ACE1和ACE2的关联性;并在心肌梗死后心脏重构大鼠模型中验证它们的关系。结果分析发现在GSE7487,17个模块中有6个模块与心脏重构相关,模块基因富集于16条KEGG信号通路。在GSE738,5个模块与心脏重构相关,模块基因富集于15条KEGG信号通路,其中有10条信号通路与第一组数据结果相同,这些信号通路涉及心肌肥厚病理、氧化磷酸化、代谢等。进一步利用模块内连通性和基因重要性找到了一些心脏重构的关键调控基因,如钙依赖磷酸酶调节子(RCAN1)。RCAN1表达与ACE1表达高度相关,但与ACE2不相关。在动物模型中验证结果与上述结果一致。结论权重基因共表达网络分析方法是一个高效的系统生物学方法,应用本方法发现了心脏重构的关键节点基因,其中RCAN1可能影响ACE1-ACE2在肾素血管紧张素系统中的平衡。
关键词
权重基因共表达网络分析
心脏重构
关键节点基因
钙依赖磷酸酶调节子
血管紧张素转换酶1
血管紧张素转换酶2
Keywords
weighted gene co-expression network analysis
cardiac remodeling
hub genes
calcium-dependent phosphatase regulon
ACE1
ACE2
分类号
R394.2 [医药卫生—医学遗传学]
R542.220.22 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
AGT和CYP11B2基因多态性影响福辛普利降压疗效
2
作者
钟诗龙
于汇民
余细勇
陈纪言
吴樱
林曙光
冯颖青
机构
广东省
心血管病
研究所
广东省
人民医院
医学
研究
中心
广东省医学科学院广东省临床药理研究所
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期289-290,共2页
基金
广东省自然科学基金资助项目(No10151008002000002)
广东省人民医院引进学科带头人启动基金资助项目(NoY022009127)
文摘
血管紧张素转换酶抑制剂(ACEI)福辛普利(fosinopril)是目前临床上的一线抗高血压药物,但其个体反应差异较大。ACEI作用于肾素-血管紧张素-醛固酮系统(RAAS),抑制ACE从而阻断AngⅠ生成AngⅡ。RAAS的关键基因的多态性对降压药的疗效具有潜在的预测作用,
关键词
原发性高血压
血管紧张素原
醛固酮合成酶
多态性
血管紧张素转换酶抑制剂
福辛普利
Keywords
primary hypertension
angiotensinogen
aldosterone synthase
polymorphism
angiotension-converting enzyme inhibitor
fosinopril
分类号
R394.2 [医药卫生—医学遗传学]
R544.1 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用权重基因共表达网络分析识别心脏重构关键节点基因
钟诗龙
伍虹
杨敏
刘晓颖
郑志伟
林秋雄
符永恒
麦丽萍
周志凌
余细勇
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
AGT和CYP11B2基因多态性影响福辛普利降压疗效
钟诗龙
于汇民
余细勇
陈纪言
吴樱
林曙光
冯颖青
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
0
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已选择
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