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一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP)的建立与优化
被引量：
26
1
作者
杜晓华
王得元
巩振辉
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2006年第9期45-49,54,共6页
了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节，简化其复杂的程序，试验以辣椒为材料，建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性（RSAP），并对其反应体系进行了优化，对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示，RSA...
了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节，简化其复杂的程序，试验以辣椒为材料，建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性（RSAP），并对其反应体系进行了优化，对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示，RSAP技术的引物为2条长度均为18bp的引物，引物的3’端为4～6个碱基的限制性酶切位点序列，接着是12～14个碱基的随机序列，2条引物的限制性位点和随机序列不同；PCR扩增的前5个循环采用35C的退火温度，随后的35个循环采用48℃的退火温度；在25μL反应体系中，模板DNA用量为20ng，Mg^2＋浓度为2．5mmol／L，dNTPs浓度为0．2mmol／L，TaqDNA聚合酶用量为1．5U，2条引物浓度均为600nmol／L;RSAP技术重复性好，适用性广泛，是一种操作简便、产率中等、稳定可靠的DNA标记技术。
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关键词
限制性位点扩增多态性
DNA标记技术
蔬菜育种
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职称材料
用RAPD分析辣椒细胞质雄性不育基因
被引量：
16
2
作者
王得元
王鸣
郑学勤
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期99-101,87,共4页
根据近等基因系分析原理 ,以辣椒细胞质雄性不育系 93 A及其保持系 93 B为材料 ,对辣椒细胞质雄性不育基因及其保持基因开展了RAPD标记研究 ,结果表明 :OPK 1 7550 、OPK 1 7150 0 标记可能与细胞质雄性不育基因相连锁 ,OPH 1 1 2 0 0 0...
根据近等基因系分析原理 ,以辣椒细胞质雄性不育系 93 A及其保持系 93 B为材料 ,对辣椒细胞质雄性不育基因及其保持基因开展了RAPD标记研究 ,结果表明 :OPK 1 7550 、OPK 1 7150 0 标记可能与细胞质雄性不育基因相连锁 ,OPH 1 1 2 0 0 0 标记可能与保持系中的保持基因相连锁。对侯选标记OPK 1 7550 进行了克隆和部分序列分析 ,为利用混合群体分离法 (BSA)对分离群体中的不同单株进行SCAR分析的标记验证工作奠定了基础。
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关键词
雄性不育基因
RAPD分析
辣椒
细胞质雄性不育系
RAPD标记
近等基因系
分析原理
序列分析
验证工作
SCAR
分离群体
混合群体
保持系
分离法
连锁
单株
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职称材料
应用SRAP分子标记评价辣椒自交系的遗传关系
被引量：
10
3
作者
任羽
张银东
+1 位作者
尹俊梅
王得元
《热带作物学报》
CSCD
2008年第1期47-52,共6页
将新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)应用于辣椒自交系的遗传关系的研究,采用30个引物组合对31个辣椒自交系进行扩增,其中有27个引物组合可以获得多态性扩增,显示了较高的多态性。27个引...
将新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)应用于辣椒自交系的遗传关系的研究,采用30个引物组合对31个辣椒自交系进行扩增,其中有27个引物组合可以获得多态性扩增,显示了较高的多态性。27个引物组合共扩增出310个多态性条带,平均每个引物组合产生11.5个多态性条带。31个自交系间的相似系数为0.133～0.997。聚类分析将31个自交系分为:在相似系数D为0.55处,将辣椒的2个变种分开;在相似系数D为0.67处,将辣椒分为4类。结果显示,SRAP是辣椒自交系研究中一种较好标记,其分类结果有助于利用这些自交系进行杂交亲本的选配。
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关键词
辣椒
SRAP
聚类分析
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职称材料
题名
一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP)的建立与优化
被引量：
26
1
作者
杜晓华
王得元
巩振辉
机构
西北农林科技大学园艺
学院
广东省农业科学院蔬菜研究所广东省果蔬新技术研究重点实验室
出处
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2006年第9期45-49,54,共6页
基金
广东省自然科学基金(000162)
广东省农科院院长基金(04-基金-38)
文摘
了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节，简化其复杂的程序，试验以辣椒为材料，建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性（RSAP），并对其反应体系进行了优化，对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示，RSAP技术的引物为2条长度均为18bp的引物，引物的3’端为4～6个碱基的限制性酶切位点序列，接着是12～14个碱基的随机序列，2条引物的限制性位点和随机序列不同；PCR扩增的前5个循环采用35C的退火温度，随后的35个循环采用48℃的退火温度；在25μL反应体系中，模板DNA用量为20ng，Mg^2＋浓度为2．5mmol／L，dNTPs浓度为0．2mmol／L，TaqDNA聚合酶用量为1．5U，2条引物浓度均为600nmol／L;RSAP技术重复性好，适用性广泛，是一种操作简便、产率中等、稳定可靠的DNA标记技术。
关键词
限制性位点扩增多态性
DNA标记技术
蔬菜育种
Keywords
restriction site amplified polymorphism
DNA marker technique
vegetable breeding
分类号
S603.2 [农业科学—园艺学]
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职称材料
题名
用RAPD分析辣椒细胞质雄性不育基因
被引量：
16
2
作者
王得元
王鸣
郑学勤
机构
广东省农业科学院蔬菜研究所广东省果蔬新技术研究重点实验室
西北农林科技大学园艺
学院
热带作物生物
技术
国家
重点
实验室
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第2期99-101,87,共4页
基金
广东省重点科技攻关项目 (A2 0 2 0 2
2 0 0 2A2 0 70 2 0 1)
+2 种基金
广东省自然科学基金 (0 0 0 162 )
广州市重点科技攻关项目 (2 0 0 2Z2 E0 192 )
广东省农业科学院院长基金项目 (0 4-基金 -0 3B)
文摘
根据近等基因系分析原理 ,以辣椒细胞质雄性不育系 93 A及其保持系 93 B为材料 ,对辣椒细胞质雄性不育基因及其保持基因开展了RAPD标记研究 ,结果表明 :OPK 1 7550 、OPK 1 7150 0 标记可能与细胞质雄性不育基因相连锁 ,OPH 1 1 2 0 0 0 标记可能与保持系中的保持基因相连锁。对侯选标记OPK 1 7550 进行了克隆和部分序列分析 ,为利用混合群体分离法 (BSA)对分离群体中的不同单株进行SCAR分析的标记验证工作奠定了基础。
关键词
雄性不育基因
RAPD分析
辣椒
细胞质雄性不育系
RAPD标记
近等基因系
分析原理
序列分析
验证工作
SCAR
分离群体
混合群体
保持系
分离法
连锁
单株
Keywords
Capsicum annuum L
cytoplasm male sterile gene
maintainer gene
candidate RAPD markers
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
应用SRAP分子标记评价辣椒自交系的遗传关系
被引量：
10
3
作者
任羽
张银东
尹俊梅
王得元
机构
中国热带
农业
科学院
热带作物品种资源
研究所
中国热带
农业
科学院
热带作物生物
技术
研究所
广东省
农业
科学院
蔬菜
研究所
/
广东省
果
蔬
新
技术
研究
重点
实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
2008年第1期47-52,共6页
基金
广东省自然科学基金(000162)
广州市重点科技攻关项目(2002Z2-E0192)
广东省农业科学院院长基金项目(2001-基金-08)资助
文摘
将新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)应用于辣椒自交系的遗传关系的研究,采用30个引物组合对31个辣椒自交系进行扩增,其中有27个引物组合可以获得多态性扩增,显示了较高的多态性。27个引物组合共扩增出310个多态性条带,平均每个引物组合产生11.5个多态性条带。31个自交系间的相似系数为0.133～0.997。聚类分析将31个自交系分为:在相似系数D为0.55处,将辣椒的2个变种分开;在相似系数D为0.67处,将辣椒分为4类。结果显示,SRAP是辣椒自交系研究中一种较好标记,其分类结果有助于利用这些自交系进行杂交亲本的选配。
关键词
辣椒
SRAP
聚类分析
Keywords
hot pepper
SRAP
cluster analysis
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP)的建立与优化
杜晓华
王得元
巩振辉
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2006
26
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
用RAPD分析辣椒细胞质雄性不育基因
王得元
王鸣
郑学勤
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
16
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
应用SRAP分子标记评价辣椒自交系的遗传关系
任羽
张银东
尹俊梅
王得元
《热带作物学报》
CSCD
2008
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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