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早期鼻咽癌基因甲基化谱的初步构建
被引量：
1
1
作者
叶宇东
王贤斌
邱前辉
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期925-931,共7页
【目的】分析早期鼻咽癌的基因甲基化状态,初步构建早期鼻咽癌的基因甲基化谱。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及炎性增生性鼻咽组织各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片(Nimble Gen)对两组标本进...
【目的】分析早期鼻咽癌的基因甲基化状态,初步构建早期鼻咽癌的基因甲基化谱。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及炎性增生性鼻咽组织各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片(Nimble Gen)对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因。【结果】4例鼻咽癌石蜡标本中均出现甲基化的基因数目为1 134个,而4例炎性增生性鼻咽组织中均出现甲基化的基因有2 091个,4例鼻咽癌标本全部发生甲基化但4例炎性增生性鼻咽组织全未发生甲基化的基因有218个,提示此218个基因可能为早期鼻咽癌患者的甲基化基因谱。另外,4例鼻咽癌标本全未发生甲基化而4例炎性增生性鼻咽组织全部发生甲基化的基因数目为1 558个。【结论】本研究初步构建了早期鼻咽癌的基因甲基化谱,为进一步建立更为精确的甲基化谱奠定了基础,同时也为寻找鼻咽癌新的分子标志物提供了可能。
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关键词
早期鼻咽癌
基因芯片
甲基化谱
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题名
早期鼻咽癌基因甲基化谱的初步构建
被引量：
1
1
作者
叶宇东
王贤斌
邱前辉
机构
南方医科大学研究生
学院
广东省人民医院∥广东省医学科学院耳鼻咽喉头颈外科
出处
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期925-931,共7页
基金
广州市科技计划项目(2011J4300067)
文摘
【目的】分析早期鼻咽癌的基因甲基化状态,初步构建早期鼻咽癌的基因甲基化谱。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及炎性增生性鼻咽组织各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片(Nimble Gen)对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因。【结果】4例鼻咽癌石蜡标本中均出现甲基化的基因数目为1 134个,而4例炎性增生性鼻咽组织中均出现甲基化的基因有2 091个,4例鼻咽癌标本全部发生甲基化但4例炎性增生性鼻咽组织全未发生甲基化的基因有218个,提示此218个基因可能为早期鼻咽癌患者的甲基化基因谱。另外,4例鼻咽癌标本全未发生甲基化而4例炎性增生性鼻咽组织全部发生甲基化的基因数目为1 558个。【结论】本研究初步构建了早期鼻咽癌的基因甲基化谱,为进一步建立更为精确的甲基化谱奠定了基础,同时也为寻找鼻咽癌新的分子标志物提供了可能。
关键词
早期鼻咽癌
基因芯片
甲基化谱
Keywords
early nasopharyngeal carcinoma
microarrays
methylation profile
分类号
R78 [医药卫生—口腔医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
早期鼻咽癌基因甲基化谱的初步构建
叶宇东
王贤斌
邱前辉
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
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