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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的基因型及同源性分析
被引量：
8
1
作者
张伟铮
何慧婵
+3 位作者
许振杰
李松
屈平华
陈茶
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015年第5期391-394,共4页
目的探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药性、基因型和同源性。方法收集临床采集的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌23株,检测其药物敏感性和ESBLs表型,改良Hodge试验确证碳青霉烯酶表型,PCR、DNA测序和BLAST证实基因型,脉冲场电泳(PFGE)分...
目的探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药性、基因型和同源性。方法收集临床采集的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌23株,检测其药物敏感性和ESBLs表型,改良Hodge试验确证碳青霉烯酶表型,PCR、DNA测序和BLAST证实基因型,脉冲场电泳(PFGE)分析产酶菌株同源性。结果 23株肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素完全耐药,其中47.8%来源于痰液标本,主要分布在神经外科重症监护室(NCU)。23株菌ESBLs和改良Hodge试验阳性率分别为21.7%、82.6%,检出SHV-11(22株)、KPC-2(14株)、NDM-1(6株)、VEB(2株)、IMP(1株)、OXA-1(2株)和OXA-10(2株)耐药基因。PFGE将23株菌基因分成A^G 7个带型,其中以A型为主(69.6%,16/23)。结论碳青霉烯酶基因型以KPC-2型及NDM-1型为主,院内存在克隆株流行。
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关键词
肺炎克雷伯菌
耐碳青霉烯类
基因分型
同源性
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职称材料
ITS基因测序分析对89株病原真菌鉴定的应用评价
被引量：
10
2
作者
李营
屈平华
+5 位作者
陈东科
张伟铮
张磊
池艳琳
叶大柠
吴尚为
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015年第11期860-863,共4页
目的探讨内转录间隔区(ITS)基因扩增测序技术在病原真菌鉴定中应用价值。方法应用通用引物ITS1和ITS4对收集的89株真菌(包括酵母菌标准菌株6株,室间质评菌7株,临床分离的酵母样真菌42株和丝状真菌34株)进行PCR扩增和基因测序。测序成功...
目的探讨内转录间隔区(ITS)基因扩增测序技术在病原真菌鉴定中应用价值。方法应用通用引物ITS1和ITS4对收集的89株真菌(包括酵母菌标准菌株6株,室间质评菌7株,临床分离的酵母样真菌42株和丝状真菌34株)进行PCR扩增和基因测序。测序成功的ITS序列在CBS数据库(http://www.cbs.knaw.nl/Collections)进行序列比对,结合Mycobank(http://cn.mycobank.org/)分类信息以获得其菌种鉴定信息。结果 89株不同种类的真菌均成功扩增到ITS靶基因,经测序,89株真菌均获得扩增的全序列。序列比对结果显示,6株酵母菌标准株中,5株鉴定到种,1株鉴定到属;7株室间质评株中,1株酵母菌鉴定到种,6株丝状真菌中2株鉴定到种,1株鉴定到属,3株鉴定到复合群;42株临床分离的酵母样真菌中,39株鉴定到种,3株鉴定到属;34株临床分离的丝状真菌中,10株鉴定到种,18株鉴定到属,6株鉴定为复合群。结论通用引物ITS1和ITS4广谱性强。ITS基因序列扩增和测序分析可快速、有效鉴定临床疑难真菌,但仍存在数据分析过程烦琐和结果解释困难的问题。
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关键词
真菌
内转录间隔区
菌种鉴定
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职称材料
题名
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的基因型及同源性分析
被引量：
8
1
作者
张伟铮
何慧婵
许振杰
李松
屈平华
陈茶
机构
广东省中医院大学城医院检验科
广东
医学院医学
检验
学院
出处
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015年第5期391-394,共4页
基金
国家自然科学基金(31300004)
广东省中医药局科研课题(20132132)
文摘
目的探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药性、基因型和同源性。方法收集临床采集的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌23株,检测其药物敏感性和ESBLs表型,改良Hodge试验确证碳青霉烯酶表型,PCR、DNA测序和BLAST证实基因型,脉冲场电泳(PFGE)分析产酶菌株同源性。结果 23株肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素完全耐药,其中47.8%来源于痰液标本,主要分布在神经外科重症监护室(NCU)。23株菌ESBLs和改良Hodge试验阳性率分别为21.7%、82.6%,检出SHV-11(22株)、KPC-2(14株)、NDM-1(6株)、VEB(2株)、IMP(1株)、OXA-1(2株)和OXA-10(2株)耐药基因。PFGE将23株菌基因分成A^G 7个带型,其中以A型为主(69.6%,16/23)。结论碳青霉烯酶基因型以KPC-2型及NDM-1型为主,院内存在克隆株流行。
关键词
肺炎克雷伯菌
耐碳青霉烯类
基因分型
同源性
Keywords
Klebisella pneumoniae
carbapenems-drug resistance
genotype
homology
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
ITS基因测序分析对89株病原真菌鉴定的应用评价
被引量：
10
2
作者
李营
屈平华
陈东科
张伟铮
张磊
池艳琳
叶大柠
吴尚为
机构
天津医
科
大学
检验
学院
广东省中医院大学城医院检验科
卫生部北京
医院
广州金域医学
检验
中心有限公司
广西
中医
药
大学
第一附属
医院
广州
中医
药
大学
第二临床医学院
出处
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015年第11期860-863,共4页
文摘
目的探讨内转录间隔区(ITS)基因扩增测序技术在病原真菌鉴定中应用价值。方法应用通用引物ITS1和ITS4对收集的89株真菌(包括酵母菌标准菌株6株,室间质评菌7株,临床分离的酵母样真菌42株和丝状真菌34株)进行PCR扩增和基因测序。测序成功的ITS序列在CBS数据库(http://www.cbs.knaw.nl/Collections)进行序列比对,结合Mycobank(http://cn.mycobank.org/)分类信息以获得其菌种鉴定信息。结果 89株不同种类的真菌均成功扩增到ITS靶基因,经测序,89株真菌均获得扩增的全序列。序列比对结果显示,6株酵母菌标准株中,5株鉴定到种,1株鉴定到属;7株室间质评株中,1株酵母菌鉴定到种,6株丝状真菌中2株鉴定到种,1株鉴定到属,3株鉴定到复合群;42株临床分离的酵母样真菌中,39株鉴定到种,3株鉴定到属;34株临床分离的丝状真菌中,10株鉴定到种,18株鉴定到属,6株鉴定为复合群。结论通用引物ITS1和ITS4广谱性强。ITS基因序列扩增和测序分析可快速、有效鉴定临床疑难真菌,但仍存在数据分析过程烦琐和结果解释困难的问题。
关键词
真菌
内转录间隔区
菌种鉴定
Keywords
fungus
internal transcribed spacer
strain identification
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的基因型及同源性分析
张伟铮
何慧婵
许振杰
李松
屈平华
陈茶
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
ITS基因测序分析对89株病原真菌鉴定的应用评价
李营
屈平华
陈东科
张伟铮
张磊
池艳琳
叶大柠
吴尚为
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2015
10
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已选择
0
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