目的:利用网络药理学、分子对接及动物实验探索温阳解毒颗粒对甲型流感病毒感染相关急性肺损伤的作用机制。方法:基于本草组鉴(herbal medicine group review, HERB)数据库收集温阳解毒颗粒活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库预...目的:利用网络药理学、分子对接及动物实验探索温阳解毒颗粒对甲型流感病毒感染相关急性肺损伤的作用机制。方法:基于本草组鉴(herbal medicine group review, HERB)数据库收集温阳解毒颗粒活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测其成分靶点,通过GeneCards、DisGennet、Pharmgkb、CTD数据库检索甲型流感病毒感染疾病靶点,定位交集靶点,采用STRING平台绘制PPI网络图,利用CytoScape 3.9.1软件构建中药-成分-靶点网络,进行基因本体(gene ontology, GO)生物功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路分析,借助AutoDockTools1.5.7软件进行分子对接探索潜在机制,采用甲型流感病毒感染小鼠模型进行药效与机制验证。结果:温阳解毒颗粒治疗急性肺损伤的核心活性成分为橘皮素、夜合花碱、8-甲氧基山奈酚、雷杜辛黃酮醇、诺米林等,核心蛋白靶点为JUN、TP53、SRC、STAT3、EGFR和PIK3CA等。GO分析主要涉及磷酸化、细胞因子介导的信号通路等生物过程,KEGG分析主要涉及磷脂酰肌醇-3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase, PI3K)-Akt等信号通路。分子对接结果表明,关键成分与核心靶点具有良好的结合活性。动物实验验证结果表明,温阳解毒颗粒可减轻甲型流感病毒感染导致的小鼠肺组织病理损伤,抑制肺组织炎症因子白细胞介素6(interleukin 6,IL-6)、白细胞介素1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor α,TNF-α)、干扰素γ(interferon-γ,IFN-γ)的mRNA表达;免疫印迹法(western blot, WB)结果表明,温阳解毒颗粒可抑制PI3K/AKT/NF-κB信号通路相关蛋白的表达。结论:温阳解毒颗粒可能通过夜合花碱、诺米林等成分,抑制PI3K/AKT/NF-κB信号通路从而治疗甲型流感病毒感染相关急性肺损伤。展开更多
目的该研究通过网络药理学和分子对接技术探讨新香冲剂治疗流感的作用机制。方法首先,基于SymMap、PubChem、FAF-Drugs4、TargetNet等网站工具,筛选新香冲剂中的活性成分,预测其靶点。通过GEO数据库获得人类流感疾病靶点。利用Cytosacpe...目的该研究通过网络药理学和分子对接技术探讨新香冲剂治疗流感的作用机制。方法首先,基于SymMap、PubChem、FAF-Drugs4、TargetNet等网站工具,筛选新香冲剂中的活性成分,预测其靶点。通过GEO数据库获得人类流感疾病靶点。利用Cytosacpe3.6.0软件构建中药-成分、成分-靶点、药物-疾病蛋白相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,对网络进行拓扑结构分析,筛选出关键化合物和关键靶点。提取核心子网络,利用DAVID6.8在线工具对核心子网络的靶点做基因本体(Gene Ontology,GO)分析和京东基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。利用分子对接方法分析关键化合物和关键靶点的相互作用关系。结果成分-靶点网络分析得到9种重要的活性化合物,关键化合物为芹菜素(Apigenin)。药物、疾病网络的共同靶点基质金属蛋白酶9(Matrix Metalloproteinase-9,MMP9)是关键靶点。GO分析显示核心子网络与抗炎、调节免疫等多个生物学过程相关。KEGG富集分析得到甲型流感疾病通路。分子对接显示,芹菜素与MMP9可通过氢键结合形成稳定的构象。结论新香冲剂通过抗病毒、抗炎、调节免疫等机制治疗流感,调控宿主细胞MMP9的表达是其发挥作用的途径之一,以上结论有待进一步开展实验验证。展开更多
文摘目的该研究通过网络药理学和分子对接技术探讨新香冲剂治疗流感的作用机制。方法首先,基于SymMap、PubChem、FAF-Drugs4、TargetNet等网站工具,筛选新香冲剂中的活性成分,预测其靶点。通过GEO数据库获得人类流感疾病靶点。利用Cytosacpe3.6.0软件构建中药-成分、成分-靶点、药物-疾病蛋白相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,对网络进行拓扑结构分析,筛选出关键化合物和关键靶点。提取核心子网络,利用DAVID6.8在线工具对核心子网络的靶点做基因本体(Gene Ontology,GO)分析和京东基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。利用分子对接方法分析关键化合物和关键靶点的相互作用关系。结果成分-靶点网络分析得到9种重要的活性化合物,关键化合物为芹菜素(Apigenin)。药物、疾病网络的共同靶点基质金属蛋白酶9(Matrix Metalloproteinase-9,MMP9)是关键靶点。GO分析显示核心子网络与抗炎、调节免疫等多个生物学过程相关。KEGG富集分析得到甲型流感疾病通路。分子对接显示,芹菜素与MMP9可通过氢键结合形成稳定的构象。结论新香冲剂通过抗病毒、抗炎、调节免疫等机制治疗流感,调控宿主细胞MMP9的表达是其发挥作用的途径之一,以上结论有待进一步开展实验验证。
