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深圳红树林沉积物可培养细菌多样性及其生物活性筛选
被引量：
5
1
作者
龙梦
樊慧敏
+4 位作者
夏洪丽
汪志文
喻大鹏
夏立群
鲁义善
《广东海洋大学学报》
CAS
北大核心
2022年第6期88-96,共9页
【目的】研究广东深圳红树林沉积物可培养细菌多样性,筛选潜在生物活性菌株及水产病原菌拮抗菌。【方法】采用稀释涂布法分离纯化深圳红树林沉积物中可培养细菌,基于16S rRNA序列分析细菌物种多样性,通过PCR扩增聚酮合酶基因、非核糖体...
【目的】研究广东深圳红树林沉积物可培养细菌多样性,筛选潜在生物活性菌株及水产病原菌拮抗菌。【方法】采用稀释涂布法分离纯化深圳红树林沉积物中可培养细菌,基于16S rRNA序列分析细菌物种多样性,通过PCR扩增聚酮合酶基因、非核糖体肽合成酶基因检测菌株产次级代谢产物潜力,并采用点种法筛选水产病原菌拮抗菌。【结果】获得177株细菌,隶属于4门20属27种,芽孢杆菌属(Bacillus)是优势菌属,6株细菌为潜在新物种,55株细菌的基因组DNA扩增出至少1种生物合成基因,其中有7株细菌对水产病原菌有拮抗活性。【结论】深圳红树林沉积物可培养细菌资源丰富,有应用于活性次级代谢产物发掘和水产病害绿色防控的巨大潜力。
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关键词
红树林沉积物
细菌多样性
拮抗活性
水产病原菌
生物合成基因
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职称材料
大口黑鲈肠道益生菌的分离与鉴定
被引量：
9
2
作者
赵浩航
康旭
+7 位作者
黄子威
温依铭
汪志文
喻大鹏
甘桢
夏洪丽
夏立群
鲁义善
《广东海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期62-68,共7页
【目的】分离鉴定大口黑鲈(Micropterus salmoides)肠道益生菌,评估分离菌用作饲料添加剂的益生潜力。【方法】采集大口黑鲈肠道样本,采用稀释涂布法分离细菌,经16S rRNA序列比对和生化试验鉴定种属,并进行抗逆性能、黏附能力、溶血活...
【目的】分离鉴定大口黑鲈(Micropterus salmoides)肠道益生菌,评估分离菌用作饲料添加剂的益生潜力。【方法】采集大口黑鲈肠道样本,采用稀释涂布法分离细菌,经16S rRNA序列比对和生化试验鉴定种属,并进行抗逆性能、黏附能力、溶血活性和药敏特性等鉴定。【结果】从大口黑鲈肠道分离菌株84株,经测序、blast比对,筛选出3株同源性最高的菌株MS-1、MS-2、MS-3,分别鉴定为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)和贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)。3株分离菌均为γ-溶血,不具有生物膜,疏水性50%~93.3%,自凝集性43.6%~69.2%;可在pH 2.0~12.0环境和5.0 g/L胆盐中存活;经高温处理后仍可生长;3株菌对大多数抗生素敏感。【结论】芽孢杆菌MS-1、MS-2和MS-3抗逆性高,黏附性能及饲料学安全性高,可作为大口黑鲈养殖中潜在益生菌。
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关键词
大口黑鲈
肠道微生物
益生菌
分离与鉴定
芽孢杆菌
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职称材料
尼罗罗非鱼干扰素诱导蛋白44基因克隆及表达分析
被引量：
2
3
作者
翁婷婷
夏立群
黄瑜
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期3548-3557,共10页
【目的】探索干扰素诱导蛋白44基因(ifi44)在尼罗罗非鱼各组织的分布特征及其响应无乳链球菌感染和聚肌胞苷酸[Poly(I∶C)]刺激过程中的表达模式,为进一步揭示ifi44基因在鱼类免疫应答中的作用机制打下基础。【方法】克隆On-ifi44基因...
【目的】探索干扰素诱导蛋白44基因(ifi44)在尼罗罗非鱼各组织的分布特征及其响应无乳链球菌感染和聚肌胞苷酸[Poly(I∶C)]刺激过程中的表达模式,为进一步揭示ifi44基因在鱼类免疫应答中的作用机制打下基础。【方法】克隆On-ifi44基因开放阅读框(ORF),通过ExPASy、TMHMM-2.0、Euk-mPLoc 2.0、SOPMA和SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析,根据单细胞转录组测序结果分析On-ifi44基因在细胞层面的分布情况,并采用实时荧光定量PCR检测On-ifi44基因在尼罗罗非鱼各组织中的表达分布特征及在无乳链球菌感染和Poly(I∶C)刺激后的时序表达情况。【结果】On-ifi44基因ORF序列全长1437 bp,编码478个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为52.7 kD,理论等电点(pI)为4.97。On-ifi44含有1个TLDc_dom结构域(1~157 aa)和1个GTP-bd结构域(197~322 aa),不含跨膜结构域。On-ifi44氨基酸序列与奥利亚罗非鱼ifi44氨基酸序列的相似性为97.94%;基于ifi44氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树也显示On-ifi44氨基酸序列与奥利亚罗罗非鱼ifi44氨基酸序列聚为一支,二者具有较近的亲缘关系。On-ifi44基因在尼罗罗非鱼的肠道、肝脏、鳃、皮肤、脾脏、体肾、胸腺、脑、头肾、肌肉、心脏等11个组织中均有表达,且主要在T细胞亚群表达;经无乳链球菌感染和Poly(I∶C)刺激后,On-ifi44基因在尼罗罗非鱼脾脏、肾脏、头肾和肠道组织中的相对表达量均发生变化,且存在明显的时间依赖性。【结论】On-ifi44含有1个TLDc_dom结构域和1个GTP-bd结构域,进化保守且在不同物种间具有相似的生物学功能;On-ifi44基因在无乳链球菌感染和Poly(I∶C)刺激后呈时间依赖性上调表达,表明ifi44基因作为重要的调节因子,参与了尼罗罗非鱼抗细菌感染、抗病毒增殖的免疫应答过程。
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关键词
尼罗罗非鱼
ifi44基因
组织表达特征
免疫应答
无乳链球菌
聚肌胞苷酸[Poly(I∶C)]
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职称材料
题名
深圳红树林沉积物可培养细菌多样性及其生物活性筛选
被引量：
5
1
作者
龙梦
樊慧敏
夏洪丽
汪志文
喻大鹏
夏立群
鲁义善
机构
广东海洋大学深圳研究院/广东省水生动物健康评估工程技术研究中心
/
深圳
市海水经济
动物
种苗
健康
评价公共
技术
服务平台
广东海洋大学
水产学院
/广东省
水产
动物
病害防控与
健康
养殖重点实验室
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
北大核心
2022年第6期88-96,共9页
基金
深圳市科技计划项目(20180507183240459)
深圳市大鹏新区科技创新和产业发展专项资金资助项目(PT202101-24)。
文摘
【目的】研究广东深圳红树林沉积物可培养细菌多样性,筛选潜在生物活性菌株及水产病原菌拮抗菌。【方法】采用稀释涂布法分离纯化深圳红树林沉积物中可培养细菌,基于16S rRNA序列分析细菌物种多样性,通过PCR扩增聚酮合酶基因、非核糖体肽合成酶基因检测菌株产次级代谢产物潜力,并采用点种法筛选水产病原菌拮抗菌。【结果】获得177株细菌,隶属于4门20属27种,芽孢杆菌属(Bacillus)是优势菌属,6株细菌为潜在新物种,55株细菌的基因组DNA扩增出至少1种生物合成基因,其中有7株细菌对水产病原菌有拮抗活性。【结论】深圳红树林沉积物可培养细菌资源丰富,有应用于活性次级代谢产物发掘和水产病害绿色防控的巨大潜力。
关键词
红树林沉积物
细菌多样性
拮抗活性
水产病原菌
生物合成基因
Keywords
mangrove sediments
bacterial diversity
antagonistic activity
aquatic pathogens
biosynthetic genes
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
Q938.15 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
大口黑鲈肠道益生菌的分离与鉴定
被引量：
9
2
作者
赵浩航
康旭
黄子威
温依铭
汪志文
喻大鹏
甘桢
夏洪丽
夏立群
鲁义善
机构
广东海洋大学
水产学院
广东省
水产
动物
病害防控与
健康
养殖重点实验室
广东海洋大学深圳研究院/广东省水生动物健康评估工程技术研究中心
/
深圳
市海水经济
动物
种苗
健康
评价公共
技术
服务平台
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期62-68,共7页
基金
深圳市可持续发展专项(KCXFZ20211020165547010)
深圳市科技计划(JCYJ20220530140813030)。
文摘
【目的】分离鉴定大口黑鲈(Micropterus salmoides)肠道益生菌,评估分离菌用作饲料添加剂的益生潜力。【方法】采集大口黑鲈肠道样本,采用稀释涂布法分离细菌,经16S rRNA序列比对和生化试验鉴定种属,并进行抗逆性能、黏附能力、溶血活性和药敏特性等鉴定。【结果】从大口黑鲈肠道分离菌株84株,经测序、blast比对,筛选出3株同源性最高的菌株MS-1、MS-2、MS-3,分别鉴定为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)和贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)。3株分离菌均为γ-溶血,不具有生物膜,疏水性50%~93.3%,自凝集性43.6%~69.2%;可在pH 2.0~12.0环境和5.0 g/L胆盐中存活;经高温处理后仍可生长;3株菌对大多数抗生素敏感。【结论】芽孢杆菌MS-1、MS-2和MS-3抗逆性高,黏附性能及饲料学安全性高,可作为大口黑鲈养殖中潜在益生菌。
关键词
大口黑鲈
肠道微生物
益生菌
分离与鉴定
芽孢杆菌
Keywords
Micropterus salmoides
gut microbes
probiotics
isolation and identification
Bacillus
分类号
S965.199 [农业科学—水产养殖]
Q93-3 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
尼罗罗非鱼干扰素诱导蛋白44基因克隆及表达分析
被引量：
2
3
作者
翁婷婷
夏立群
黄瑜
机构
广东海洋大学
水产学院
/广东省
水产
动物
病害防控与
健康
养殖重点实验室
广东海洋大学深圳研究院/广东省水生动物健康评估工程技术研究中心
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期3548-3557,共10页
基金
国家自然科学基金项目(32002426)
广东省自然科学基金项目(2022A1515010553)。
文摘
【目的】探索干扰素诱导蛋白44基因(ifi44)在尼罗罗非鱼各组织的分布特征及其响应无乳链球菌感染和聚肌胞苷酸[Poly(I∶C)]刺激过程中的表达模式,为进一步揭示ifi44基因在鱼类免疫应答中的作用机制打下基础。【方法】克隆On-ifi44基因开放阅读框(ORF),通过ExPASy、TMHMM-2.0、Euk-mPLoc 2.0、SOPMA和SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析,根据单细胞转录组测序结果分析On-ifi44基因在细胞层面的分布情况,并采用实时荧光定量PCR检测On-ifi44基因在尼罗罗非鱼各组织中的表达分布特征及在无乳链球菌感染和Poly(I∶C)刺激后的时序表达情况。【结果】On-ifi44基因ORF序列全长1437 bp,编码478个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为52.7 kD,理论等电点(pI)为4.97。On-ifi44含有1个TLDc_dom结构域(1~157 aa)和1个GTP-bd结构域(197~322 aa),不含跨膜结构域。On-ifi44氨基酸序列与奥利亚罗非鱼ifi44氨基酸序列的相似性为97.94%;基于ifi44氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树也显示On-ifi44氨基酸序列与奥利亚罗罗非鱼ifi44氨基酸序列聚为一支,二者具有较近的亲缘关系。On-ifi44基因在尼罗罗非鱼的肠道、肝脏、鳃、皮肤、脾脏、体肾、胸腺、脑、头肾、肌肉、心脏等11个组织中均有表达,且主要在T细胞亚群表达;经无乳链球菌感染和Poly(I∶C)刺激后,On-ifi44基因在尼罗罗非鱼脾脏、肾脏、头肾和肠道组织中的相对表达量均发生变化,且存在明显的时间依赖性。【结论】On-ifi44含有1个TLDc_dom结构域和1个GTP-bd结构域,进化保守且在不同物种间具有相似的生物学功能;On-ifi44基因在无乳链球菌感染和Poly(I∶C)刺激后呈时间依赖性上调表达,表明ifi44基因作为重要的调节因子,参与了尼罗罗非鱼抗细菌感染、抗病毒增殖的免疫应答过程。
关键词
尼罗罗非鱼
ifi44基因
组织表达特征
免疫应答
无乳链球菌
聚肌胞苷酸[Poly(I∶C)]
Keywords
Nile tilapia(Oreochromis niloticus)
ifi44 gene
tissue expression
immune response
Streptococcus agalactiae
Polyinosinic-polycytidylic acid[Poly(I∶C)]
分类号
S965.125 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
深圳红树林沉积物可培养细菌多样性及其生物活性筛选
龙梦
樊慧敏
夏洪丽
汪志文
喻大鹏
夏立群
鲁义善
《广东海洋大学学报》
CAS
北大核心
2022
5
在线阅读
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职称材料
2
大口黑鲈肠道益生菌的分离与鉴定
赵浩航
康旭
黄子威
温依铭
汪志文
喻大鹏
甘桢
夏洪丽
夏立群
鲁义善
《广东海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
9
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下载PDF
职称材料
3
尼罗罗非鱼干扰素诱导蛋白44基因克隆及表达分析
翁婷婷
夏立群
黄瑜
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
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