检索结果-维普期刊中文期刊服务平台

基于剪接因子SRSF9在头颈部鳞状细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析: 1; 作者刘玉婷喻莹 +2 位作者黎桂珍史沁雪李彬彬《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期379-391,共13页; 目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30... 展开更多; 关键词头颈部鳞状细胞癌富含丝氨酸/精氨酸剪接因子9 可变剪接肿瘤免疫生物信息学; 在线阅读下载PDF 职称材料

血清反应因子全长及N端片段过表达慢病毒载体的构建及其对心脏干细胞分化的影响被引量：4: 2; 作者雷洪王可可 +5 位作者哈艳平贾亚楠李汝佳申志华郭峻莉揭伟《临床与实验病理学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第10期1109-1115,共7页; 目的探讨血清反应因子全长(SRF-Full)及N端片段(SRF-N,1-254aa)对TGF-β1诱导c-Kit+心脏干细胞(cardiac stem cell,CSC)分化的影响。方法从c DNA文库扩增大鼠SRF-Full及SRF-N表达序列并克隆入酶切线性化慢病毒载体GV358(Ubi-MCS-3FLAG-S... 展开更多; 关键词血清反应因子血清反应因子N端片段质粒构建心脏干细胞细胞分化; 在线阅读下载PDF 职称材料

HIF-1α过表达慢病毒载体的构建及对心肌细胞Notch配体Jagged1表达的影响被引量：4: 3; 作者王振良丁然然 +5 位作者哈艳平雷洪王可可申志华姜汉国揭伟《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期416-420,共5页; 目的构建低氧诱导因子1α（hypoxia-inducible factor 1α,HIF-1α）过表达重组慢病毒质粒并包装病毒,将病毒感染乳鼠心肌细胞,分析其对Notch配体Jagged1表达的影响。方法从cDNA文库中PCR扩增人HIF-1α编码序列并克隆入酶切线性化慢... 展开更多; 关键词质粒构建慢病毒包装心肌细胞 NOTCH信号低氧诱导因子1Α; 在线阅读下载PDF 职称材料

血清反应因子N端片段对鼻咽癌细胞增殖及迁移能力的影响被引量：2: 4; 作者袁建玲邵钟铭 +6 位作者邹园伍彩霞郑阿秀邢敬慈白建荣揭伟申志华《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期535-542,共8页; 目的:探讨血清反应因子N端剪切片段(SRF-N)对鼻咽癌(NPC)细胞增殖和迁移能力的影响与机制。方法:应用SRF全长(SRF-Full,1~508 aa)、SRF-N(1~254 aa)及阴性对照(NC)慢病毒颗粒感染人NPC细胞系6-10B,经嘌呤霉素抗性筛选结合Western blot检... 展开更多; 关键词鼻咽癌血清反应因子N端片段细胞增殖细胞迁移上皮-间充质转化; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于生物信息学分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及临床意义: 5; 作者喻莹刘玉婷 +2 位作者黎桂珍梁景皓李彬彬《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第4期294-300,307,共8页; 目的基于数据库分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系,并探讨相关机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达综合(GEO)数据库分析SRSF11在胃癌中的表达情况;利用UALCAN、KM Plotter评估SRSF11表达与临... 展开更多; 关键词胃癌 SRSF11 可变剪接生物信息学; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于剪接因子SRSF9在头颈部鳞状细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析: 1; 作者刘玉婷喻莹黎桂珍史沁雪李彬彬; 机构广东医科大学基础医学院病理生理学教研室广东医科大学第二临床医学院; 出处《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期379-391,共13页; 基金国家自然科学基金项目(81502411) 广东省科技厅自然科学基金项目(2023A1515010448) +1 种基金广东医科大学大学生创新实验项目(ZYDS004)。; 文摘目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30784和GSE13601数据集、临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)数据库、基因表达交互分析(GEPIA)数据库和Kaplan-Meier plotter数据库分析SRSF9在HNSCC中的表达及与患者临床病理特征和预后的关系;利用cBioPortal数据库分析SRSF9基因变异情况;应用ESTIMATE算法和肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库评估SRSF9表达与肿瘤微环境和肿瘤免疫细胞浸润的关系;利用LinkedOmics数据库分析SRSF9在HNSCC中的共表达基因及其调控通路;基于TCGA SpliceSeq数据库分析HNSCC中SRSF9调控的可变剪接事件,并对靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:TCGA数据库、GEO数据库中GSE30784和GSE13601数据集分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA表达水平较癌旁正常组织明显升高(P<0.01);CPTAC数据库分析,与正常组织比较,HNSCC组织中SRSF9蛋白表达水平明显升高(P<0.001)。TCGA数据库分析,SRSF9 mRNA表达与HNSCC患者病理分级(P=0.004)和HPV感染(P=0.031)有关联。GEPIA和Kaplan-Meier plotter数据库分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA高表达均与患者总生存期(OS)较差相关[风险比(HR)=1.40,P=0.019;HR=1.55,P=0.003]。cBioPortal数据库分析,HNSCC中SRSF9基因拷贝数变异(CNV)占26.85%,其CNV与SRSF9 mRNA表达水平呈正相关关系(r=0.44,P<0.001)。ESTIMATE算法分析,SRSF9 mRNA高表达组基质评分和免疫评分均较SRSF9 mRNA低表达组低(P<0.001),肿瘤纯度则高于SRSF9 mRNA低表达组(P<0.001)。TIMER数据库分析,SRSF9 mRNA表达水平与CD4+T淋巴细胞浸润呈正相关关系(r=0.186,P<0.001),而与B淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞和树突状细胞浸润呈负相关关系(r=-0.269,P<0.001;r=-0.353,P<0.001;r=-0.304,P<0.001)。SRSF9共表达基因富集分析,核糖体、剪接体和代谢通路等相关基因上调,而黏着斑、细胞因子和细胞黏附分子等相关基因下调。SRSF9相关可变剪接靶基因主要涉及脂类代谢、胰高血糖素和紧密连接等通路。结论:SRSF9在HNSCC中呈高表达,且与患者预后不良和肿瘤微环境免疫细胞浸润相关,可成为HNSCC诊断、预后评估和治疗的潜在分子靶标。; 关键词头颈部鳞状细胞癌富含丝氨酸/精氨酸剪接因子9 可变剪接肿瘤免疫生物信息学; Keywords Head and neck Squamous cell carcinoma Serine/arginine-rich splicing factor 9 Alternative splicing Tumor immunity Bioinformatics; 分类号 R739.91 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名血清反应因子全长及N端片段过表达慢病毒载体的构建及其对心脏干细胞分化的影响被引量：4: 2; 作者雷洪王可可哈艳平贾亚楠李汝佳申志华郭峻莉揭伟; 机构广东医科大学基础医学院病理学系广东医科大学基础医学院病理生理学教研室海南医学院第一附属医院心血管研究所; 出处《临床与实验病理学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第10期1109-1115,共7页; 基金国家自然科学基金(81460042) 广东省教育厅科技创新项目基金(KJCX20130088) +1 种基金 2015年国家留学人员科技活动择优资助项目; 文摘目的探讨血清反应因子全长(SRF-Full)及N端片段(SRF-N,1-254aa)对TGF-β1诱导c-Kit+心脏干细胞(cardiac stem cell,CSC)分化的影响。方法从c DNA文库扩增大鼠SRF-Full及SRF-N表达序列并克隆入酶切线性化慢病毒载体GV358(Ubi-MCS-3FLAG-SV40-EGFP-IRES-puromycin),转化感受态细胞筛选出阳性克隆并测序鉴定。将SRF-Full及SRF-N过表达质粒与病毒包装辅助质粒共转染工具细胞HEK293T,包装慢病毒。磁激活细胞分选法分离乳SD大鼠c-Kit+CSC,将SRF-Full及SRF-N过表达慢病毒感染CSC并经TGF-β1诱导,定量PCR分析下游分化基因mRNA水平的变化。结果成功扩增出SRF-Full及SRF-N编码序列并正确连接入线性化载体,获得的阳性转化子经测序无误。将转化子质粒与病毒包装辅助质粒共转染HEK293T后,获得滴度为2×108TU/m L的慢病毒颗粒,Western blot检测到预期Flag融合蛋白。重组慢病毒感染CSC后细胞核中见e GFP信号。TGF-β1诱导CSC出现心肌细胞分化基因(Nkx2.5、Gata4、c Tn I)及平滑肌细胞分化基因(SM22α)的表达,内皮细胞分化(v WF)无影响,SRF-Full促进CSC的心肌细胞分化,而SRF-N则抑制这种分化。结论成功构建SRFFull及SRF-N过表达重组慢病毒质粒。SRF-Full促进而SRF-N减弱TGF-β1诱导CSC的心肌细胞分化。; 关键词血清反应因子血清反应因子N端片段质粒构建心脏干细胞细胞分化; Keywords serum response factor N-terminal fragment of serum response factor plasmid construction cardiac stem cell cell differentiation; 分类号 Q21 [生物学—细胞生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名HIF-1α过表达慢病毒载体的构建及对心肌细胞Notch配体Jagged1表达的影响被引量：4: 3; 作者王振良丁然然哈艳平雷洪王可可申志华姜汉国揭伟; 机构广东医科大学病理学系广东医科大学基础医学院病理生理学教研室; 出处《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期416-420,共5页; 基金国家自然科学基金(81170121 81541004) +2 种基金 YS2015004 YS2015005); 文摘目的构建低氧诱导因子1α（hypoxia-inducible factor 1α,HIF-1α）过表达重组慢病毒质粒并包装病毒,将病毒感染乳鼠心肌细胞,分析其对Notch配体Jagged1表达的影响。方法从cDNA文库中PCR扩增人HIF-1α编码序列并克隆入酶切线性化慢病毒载体GV218,转化感受态大肠杆菌细胞筛选出阳性克隆并测序鉴定。将HIF-1α过表达慢病毒质粒与病毒包装辅助质粒共转染工具细胞HEK293T,包装出慢病毒颗粒。原代分离SD乳大鼠心肌细胞,将HIF-1α过表达慢病毒感染心肌细胞,定量PCR分析Jagged1mRNA水平的变化。结果成功扩增HIF-1α编码序列并正确连接入线性化载体GV218,获得阳性转化子并测序无误。将转化子质粒与病毒包装辅助质粒共转染HEK293T后,获得滴度为1×108TU/ml的慢病毒颗粒,Western blot法检测到HIF-1α-GFP融合蛋白。重组慢病毒感染乳鼠心肌细胞后,胞核中见GFP信号。与对照组相比,HIF-1α过表达5天后显著上调Jagged1mRNA的水平。结论心肌细胞中HIF-1α可诱导Jagged1的表达。HIF-1α过表达重组慢病毒载体的成功构建,为研究缺血缺氧性心肌损伤反应的分子机制奠定了基础。; 关键词质粒构建慢病毒包装心肌细胞 NOTCH信号低氧诱导因子1Α; Keywords plasmid construction lentiviral packaging cardiomyocyte Notch signaling hypoxia-inducible factor 1α; 分类号 R363 [医药卫生—病理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名血清反应因子N端片段对鼻咽癌细胞增殖及迁移能力的影响被引量：2: 4; 作者袁建玲邵钟铭邹园伍彩霞郑阿秀邢敬慈白建荣揭伟申志华; 机构广东医科大学基础医学院病理生理学教研室海南医学院急救与创伤研究教育部重点实验室北京大学深圳医院病理科; 出处《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期535-542,共8页; 基金国家自然科学基金资助项目(No.81402415) 广东省扬帆计划高层次人才项目(No.4YF16007G)。; 文摘目的:探讨血清反应因子N端剪切片段(SRF-N)对鼻咽癌(NPC)细胞增殖和迁移能力的影响与机制。方法:应用SRF全长(SRF-Full,1~508 aa)、SRF-N(1~254 aa)及阴性对照(NC)慢病毒颗粒感染人NPC细胞系6-10B,经嘌呤霉素抗性筛选结合Western blot检测Flag标签化融合蛋白的表达获得单克隆细胞株,CCK-8实验分析细胞活力的改变,划痕损伤修复实验和Transwell实验分析细胞迁移能力,细胞-基质黏附实验分析细胞黏附能力,Western blot检测细胞增殖相关蛋白增殖细胞核抗原(PCNA)和上皮-间充质转化(EMT)相关指标的表达,双萤光素酶报告基因实验检测SRF-Full和SRF-N对Snail1启动子的调节效应。结果:成功用SRF-Full、SRF-N及NC慢病毒感染6-10B细胞,经嘌呤霉素抗性筛选结合Flag标签蛋白的表达获得相应的单克隆细胞株,分别标记为6-10B^(SRF-Full)、6-10B^(SRF-N)和6-10B^(NC)。与6-10B^(NC)细胞相比,6-10B^(SRF-Full)细胞活力、迁移能力和与基质的黏附能力均显著增强(P<0.01),而6-10B^(SRF-N)细胞较6-10B^(SRF-Full)细胞活力、迁移能力及黏附能力均显著下降(P<0.01)。6-10B^(SRF-Full)细胞中波形蛋白(vimentin)、神经钙黏素(N-cadherin)和Snail1的表达水平较6-10B^(NC)细胞显著升高(P<0.01),上皮钙黏素(Ecadherin)表达水平显著下降(P<0.01);而6-10B^(SRF-N)细胞中vimentin、N-cadherin和Snail1的表达水平较6-10B^(SRF-Full)细胞显著下降(P<0.05),E-cadherin表达水平显著上升(P<0.05)。双萤光素酶活性实验结果表明,与NC相比,SRFFull显著激活Snail1启动子(P<0.001);与SRF-Full相比,SRF-N显著抑制Snail1启动子活性(P<0.01)。结论:SRF-Full促进而SRF-N抑制NPC细胞的增殖和迁移;SRF-N抑制Snail1启动子活性而介导NPC的EMT;SRF-N具有潜在的抗NPC作用。; 关键词鼻咽癌血清反应因子N端片段细胞增殖细胞迁移上皮-间充质转化; Keywords Nasopharyngeal carcinoma N-terminal fragment of serum response factor Cell proliferation Cell migration Epithelial-mesenchymal transition; 分类号 R363.2 [医药卫生—病理学] R739.6 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于生物信息学分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及临床意义: 5; 作者喻莹刘玉婷黎桂珍梁景皓李彬彬; 机构广东医科大学基础医学院病理生理学教研室广东医科大学基础医学院生物技术系; 出处《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第4期294-300,307,共8页; 基金国家自然科学基金(81502411) 广东省自然科学基金(2023A1515010448) 广东省大学生创新创业训练计划项目(S202110571091,S202210571047)。; 文摘目的基于数据库分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系,并探讨相关机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达综合(GEO)数据库分析SRSF11在胃癌中的表达情况;利用UALCAN、KM Plotter评估SRSF11表达与临床病理特征、预后的关系;利用TIMER工具分析SRSF11表达对肿瘤微环境免疫细胞浸润的影响;结合TCGA spliceSeq中可变剪接数据和RNA-seq数据分析SRSF11调控的可变剪接事件和基因,并对靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果胃癌组织中SRSF11表达明显上调(P<0.05),且与患者淋巴结转移和TP53基因突变有关(P<0.05);SRSF11高表达与胃癌患者预后不良相关(P<0.001);SRSF11表达可影响胃癌中多种免疫细胞的浸润水平,巨噬细胞高浸润量与患者预后不良相关(P<0.05);靶基因KEGG富集分析显示主要参与病毒感染、溶酶体、三磷酸腺苷结合盒转运体和肿瘤相关信号通路等。结论SRSF11在胃癌组织中呈现高表达,且与不良预后和免疫浸润相关。SRSF11有望成为胃癌诊断、预后评估和治疗的新靶点。; 关键词胃癌 SRSF11 可变剪接生物信息学; Keywords stomach adenocarcinoma SRSF11 alternative splicing bioinformatics; 分类号 R735.2 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于剪接因子SRSF9在头颈部鳞状细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析	刘玉婷喻莹黎桂珍史沁雪李彬彬	《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	血清反应因子全长及N端片段过表达慢病毒载体的构建及其对心脏干细胞分化的影响	雷洪王可可哈艳平贾亚楠李汝佳申志华郭峻莉揭伟	《临床与实验病理学杂志》 CSCD 北大核心	2017	4	在线阅读下载PDF 职称材料
3	HIF-1α过表达慢病毒载体的构建及对心肌细胞Notch配体Jagged1表达的影响	王振良丁然然哈艳平雷洪王可可申志华姜汉国揭伟	《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2016	4	在线阅读下载PDF 职称材料
4	血清反应因子N端片段对鼻咽癌细胞增殖及迁移能力的影响	袁建玲邵钟铭邹园伍彩霞郑阿秀邢敬慈白建荣揭伟申志华	《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心	2022	2	在线阅读下载PDF 职称材料
5	基于生物信息学分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及临床意义	喻莹刘玉婷黎桂珍梁景皓李彬彬	《中国医科大学学报》 CAS 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料