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基于生物信息学分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及临床意义
1
作者 喻莹 刘玉婷 +2 位作者 黎桂珍 梁景皓 李彬彬 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第4期294-300,307,共8页
目的基于数据库分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系,并探讨相关机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达综合(GEO)数据库分析SRSF11在胃癌中的表达情况;利用UALCAN、KM Plotter评估SRSF11表达与临... 目的基于数据库分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系,并探讨相关机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达综合(GEO)数据库分析SRSF11在胃癌中的表达情况;利用UALCAN、KM Plotter评估SRSF11表达与临床病理特征、预后的关系;利用TIMER工具分析SRSF11表达对肿瘤微环境免疫细胞浸润的影响;结合TCGA spliceSeq中可变剪接数据和RNA-seq数据分析SRSF11调控的可变剪接事件和基因,并对靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果胃癌组织中SRSF11表达明显上调(P<0.05),且与患者淋巴结转移和TP53基因突变有关(P<0.05);SRSF11高表达与胃癌患者预后不良相关(P<0.001);SRSF11表达可影响胃癌中多种免疫细胞的浸润水平,巨噬细胞高浸润量与患者预后不良相关(P<0.05);靶基因KEGG富集分析显示主要参与病毒感染、溶酶体、三磷酸腺苷结合盒转运体和肿瘤相关信号通路等。结论SRSF11在胃癌组织中呈现高表达,且与不良预后和免疫浸润相关。SRSF11有望成为胃癌诊断、预后评估和治疗的新靶点。 展开更多
关键词 胃癌 SRSF11 可变剪接 生物信息学
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