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花生种子不同发育阶段的转录因子调控网络鉴定
1
作者
孙志辉
鲁清
+10 位作者
李海芬
黄璐
李少雄
陈小平
王润风
余倩霞
徐杨玉
洪彦彬
王键宽
汪文毅
刘浩
《中国油料作物学报》
北大核心
2025年第5期1108-1122,共15页
为了对花生种子发育过程中的转录因子调控网络进行全面解析,本研究首先对花生果针入土后3个不同发育时期(5 d、25 d、45 d)的种子与荚果进行表型数据测定。随后利用转录组测序进行基因表达量分析,共检测到71044个基因,其中5198个为新鉴...
为了对花生种子发育过程中的转录因子调控网络进行全面解析,本研究首先对花生果针入土后3个不同发育时期(5 d、25 d、45 d)的种子与荚果进行表型数据测定。随后利用转录组测序进行基因表达量分析,共检测到71044个基因,其中5198个为新鉴定的转录本。本研究分别于3个不同发育时期鉴定到5159(25vs5)、7714(45vs5)、1712(45vs25)个差异表达基因。差异基因参与的生物学代谢通路富集分析表明,果针入土后25 d的花生种子涉及的代谢通路最多,而果针入土后45 d的花生种子中代谢通路减少,油脂合成占主导地位。此外,基于差异基因谱共筛选出544个转录因子,并以此构建了转录调控网络,结果表明这些转录调控网络主要涉及植物激素信号转导、昼夜节律调控、MAPK信号途径等种子发育相关的重要途径。进一步的研究表明,18个转录因子在种子内特异高表达,且与种子油脂积累相关的转录因子家族ABI、NFYB与WRI的基因表达趋势与种子发育速率呈正相关性,并用qPCR进行验证。本研究基于3个不同发育时期的转录组测序数据构建了花生种子基因表达谱与转录因子互作网络,为探究花生种子发育的分子调控机制提供了参考。
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关键词
花生
种子
发育时期
转录组测序
转录因子
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职称材料
题名
花生种子不同发育阶段的转录因子调控网络鉴定
1
作者
孙志辉
鲁清
李海芬
黄璐
李少雄
陈小平
王润风
余倩霞
徐杨玉
洪彦彬
王键宽
汪文毅
刘浩
机构
广东
省农业科学院作物
研究
所
广东
省农垦南亚热带作物科技中心
广东兆华航天育种创新研究院
华南农业大学农学院
出处
《中国油料作物学报》
北大核心
2025年第5期1108-1122,共15页
基金
河源市科技计划项目(河科社农大专项2022002)
“十四五”广东省农业科技创新十大主攻方向“揭榜挂帅”项目(2022SDZG05)
+1 种基金
国家重点研发计划(2023YFD1202800)
国家花生产业技术体系(CARS-13)。
文摘
为了对花生种子发育过程中的转录因子调控网络进行全面解析,本研究首先对花生果针入土后3个不同发育时期(5 d、25 d、45 d)的种子与荚果进行表型数据测定。随后利用转录组测序进行基因表达量分析,共检测到71044个基因,其中5198个为新鉴定的转录本。本研究分别于3个不同发育时期鉴定到5159(25vs5)、7714(45vs5)、1712(45vs25)个差异表达基因。差异基因参与的生物学代谢通路富集分析表明,果针入土后25 d的花生种子涉及的代谢通路最多,而果针入土后45 d的花生种子中代谢通路减少,油脂合成占主导地位。此外,基于差异基因谱共筛选出544个转录因子,并以此构建了转录调控网络,结果表明这些转录调控网络主要涉及植物激素信号转导、昼夜节律调控、MAPK信号途径等种子发育相关的重要途径。进一步的研究表明,18个转录因子在种子内特异高表达,且与种子油脂积累相关的转录因子家族ABI、NFYB与WRI的基因表达趋势与种子发育速率呈正相关性,并用qPCR进行验证。本研究基于3个不同发育时期的转录组测序数据构建了花生种子基因表达谱与转录因子互作网络,为探究花生种子发育的分子调控机制提供了参考。
关键词
花生
种子
发育时期
转录组测序
转录因子
Keywords
peanut
seed
period of development
transcriptome sequencing
transcription factors
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花生种子不同发育阶段的转录因子调控网络鉴定
孙志辉
鲁清
李海芬
黄璐
李少雄
陈小平
王润风
余倩霞
徐杨玉
洪彦彬
王键宽
汪文毅
刘浩
《中国油料作物学报》
北大核心
2025
0
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