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利用微卫星标记分析山西3个地方牛群体的遗传多样性和遗传分化
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作者 李超杰 蒙萌 +6 位作者 李博 靳光 王坤 车雷杰 乔晓春 张元庆 牛晓艳 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第1期226-237,共12页
[目的]研究晋南牛、平陆山地牛和“太行云牛”3个群体的遗传多样性、遗传结构和遗传分化情况,为山西地方牛品种保护提供数据支持。[方法]采用12个微卫星标记对3个群体共230个个体进行PCR扩增、测序和分型,并对各群体的等位基因数、遗传... [目的]研究晋南牛、平陆山地牛和“太行云牛”3个群体的遗传多样性、遗传结构和遗传分化情况,为山西地方牛品种保护提供数据支持。[方法]采用12个微卫星标记对3个群体共230个个体进行PCR扩增、测序和分型,并对各群体的等位基因数、遗传杂合度、多态信息含量以及群体间的遗传距离等参数进行评估。[结果]12个微卫星标记中等位基因数为2~15个。3个群体的有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量的平均值分别为3.205~4.611、0.680~0.735、0.646~0.750和0.601~0.716。Hardy-Weinberg平衡(HWE)检测结果显示,除晋南牛在HAUT27座位上显著偏离HWE外(P<0.05),其余标记均未偏离HWE(P>0.05)。F统计量结果显示,群体内近交系数(F_(IS))为―0.012,群体平均近交系数(F_(IT))为0.043,群体分化系数(F_(ST))为0.054。UPGMA系统发育树结果表明,平陆山地牛和晋南牛聚为一支,“太行云牛”则单独为一支。主坐标分析(PCoA)结果显示,晋南牛和平陆山地牛两个群体间存在较近的亲缘关系,且不同群体间存在一定的遗传交流。STRUCTURE结果进一步发现,3个群体间存在一定的群体混杂现象。[结论]山西3个地方牛群体内遗传多样性水平较高,各种群的系统发育关系相对独立,且晋南牛与平陆山地牛之间存在较多的基因交流。本研究结果有助于深入理解山西地方牛群体的遗传结构,并对品种保护方案的制订提供了重要的数据基础。 展开更多
关键词 地方牛群体 微卫星 遗传多样性 遗传分化 遗传结构
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