为研究常州市春季PM_(2.5)中细菌群落特征,利用高通量测序对PM_(2.5)中细菌的16S r RNA基因进行研究.测序获得的有效序列数为600150,以97%的相似水平划分,各样品的OTUs为1890～6519,同时样本的Coverage指数较高,表明测序结果可以准确地...为研究常州市春季PM_(2.5)中细菌群落特征,利用高通量测序对PM_(2.5)中细菌的16S r RNA基因进行研究.测序获得的有效序列数为600150,以97%的相似水平划分,各样品的OTUs为1890～6519,同时样本的Coverage指数较高,表明测序结果可以准确地代表样本中的空气细菌群落.物种注释结果表明:常州春季PM_(2.5)中相对丰度>1%的有11个细菌门、14个细菌纲和12个细菌属,其中变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻细菌门(Cyanobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)是排名前3的优势细菌类群,占总基因丰度的80.88%.属水平优势细菌主要有拟甲色球藻属(Chroococcidiopsis,6.03%)、Rubellimicrobium(5.95%)、微囊藻属(Microcystis,4.86%)和鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas,3.16%),但在属水平上未能进行分类的基因序列比例高达81.11%.基于PM_(2.5)中细菌群落组成进行来源分析,发现常州市春季PM_(2.5)中细菌的环境来源多变,其主要环境源可能为淡水,其次是土壤、植物和人为源.利用冗余分析探讨环境因子与细菌群落的关系,结果表明,NH_4^+、NO_3^-、O_3、SO_4^(2-)、OC、气压和CO是常州市春季PM_(2.5)中细菌群落的主要影响因子,同时不同环境因子对不同细菌类群影响不同.展开更多
文摘为研究常州市春季PM_(2.5)中细菌群落特征,利用高通量测序对PM_(2.5)中细菌的16S r RNA基因进行研究.测序获得的有效序列数为600150,以97%的相似水平划分,各样品的OTUs为1890～6519,同时样本的Coverage指数较高,表明测序结果可以准确地代表样本中的空气细菌群落.物种注释结果表明:常州春季PM_(2.5)中相对丰度>1%的有11个细菌门、14个细菌纲和12个细菌属,其中变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻细菌门(Cyanobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)是排名前3的优势细菌类群,占总基因丰度的80.88%.属水平优势细菌主要有拟甲色球藻属(Chroococcidiopsis,6.03%)、Rubellimicrobium(5.95%)、微囊藻属(Microcystis,4.86%)和鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas,3.16%),但在属水平上未能进行分类的基因序列比例高达81.11%.基于PM_(2.5)中细菌群落组成进行来源分析,发现常州市春季PM_(2.5)中细菌的环境来源多变,其主要环境源可能为淡水,其次是土壤、植物和人为源.利用冗余分析探讨环境因子与细菌群落的关系,结果表明,NH_4^+、NO_3^-、O_3、SO_4^(2-)、OC、气压和CO是常州市春季PM_(2.5)中细菌群落的主要影响因子,同时不同环境因子对不同细菌类群影响不同.
