基于金针菇(Flammulina filiformis)基因组和转录组的测序组装结果,选取13个内参基因(α-TUB、β-TUB、PGM、RPL19C、RPL6、CYC、18S rRNA、Vha68、ACT、GPD、PAS、TEF和VSN),通过设计跨内含子引物,分别对金针菇不同菌株(Fy331、Fw12、...基于金针菇(Flammulina filiformis)基因组和转录组的测序组装结果,选取13个内参基因(α-TUB、β-TUB、PGM、RPL19C、RPL6、CYC、18S rRNA、Vha68、ACT、GPD、PAS、TEF和VSN),通过设计跨内含子引物,分别对金针菇不同菌株(Fy331、Fw12、川金10、Fv296、金黄11和福建白金)菌丝和Fy331菌株不同发育阶段(菌丝、原基、幼嫩子实体和成熟子实体)样品进行实时荧光定量PCR(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测,并采用ΔCt算法和NormFinder、BestKeeper、GeNorm等软件对检测结果进行表达稳定性分析,以期筛选出在不同菌株菌丝和不同发育阶段中稳定表达的内参基因。结果表明:Vha68、TEF和β-TUB基因在不同菌株菌丝中表达稳定;Vha68、ACT和GPD基因在不同发育阶段样品中表达稳定。综合评价与qRT-PCR验证分析结果显示,Vha68和TEF、Vha68和ACT分别适合作为金针菇不同菌株菌丝、不同发育阶段qRT-PCR检测基因表达的最佳内参基因。展开更多
为研究超声辅助H_(2)O_(2)降解对鳞杯伞子实体多糖(Clitocybe squamulose fruiting body polysaccharide,CSFP)理化性质与活性的影响,通过H_(2)O_(2)降解法、超声波降解法、超声辅助H_(2)O_(2)降解法制备3种降解CSFP,分别记为H-CSFP、U-...为研究超声辅助H_(2)O_(2)降解对鳞杯伞子实体多糖(Clitocybe squamulose fruiting body polysaccharide,CSFP)理化性质与活性的影响,通过H_(2)O_(2)降解法、超声波降解法、超声辅助H_(2)O_(2)降解法制备3种降解CSFP,分别记为H-CSFP、U-CSFP、UH-CSFP。分子质量和单糖组成测定结果表明CSFP由I、II、III 3个不同分子质量组分构成,与CSFP相比,H-CSFP、U-CSFP和UH-CSFP的组分I和III分子质量降低,占比升高,而组分II分子质量升高,占比降低;但是不同降解方法均不影响多糖的单糖组成。扫描电子显微镜观察发现降解后多糖表面孔隙密度增加或直径增大,表明降解使多糖结构更松散。零剪切黏度和平均粒径测定结果表明,与降解前相比,降解后多糖零剪切黏度和平均粒径均显著降低,表明经过不同方法处理,CSFP发生不同程度降解。傅里叶变换红外光谱分析结果表明降解没有破坏多糖的主要官能团。流变特性分析结果表明降解使多糖表观黏度和凝胶特性减弱。对CSFP、H-CSFP、U-CSFP和UH-CSFP总糖、糖醛酸、硫酸基质量分数和体外抗氧化活性检测结果表明,降解前后,除UH-CSFP以外,其余各组总糖质量分数无明显变化,各组糖醛酸和硫酸基质量分数降解后有所提高,体外抗氧化活性表现为UH-CSFP>U-CSFP>H-CSFP>CSFP,由Pearson相关性分析可知,CSFP硫酸基质量分数与·OH清除率和总还原力极显著相关(P<0.01),与2,2’-联氮-双-3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸阳离子自由基清除率显著相关(P<0.05),与1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基清除率无显著相关性(P>0.05)。本研究可为CSFP在食品、药品、保健品等领域的应用提供理论参考。展开更多
文摘基于金针菇(Flammulina filiformis)基因组和转录组的测序组装结果,选取13个内参基因(α-TUB、β-TUB、PGM、RPL19C、RPL6、CYC、18S rRNA、Vha68、ACT、GPD、PAS、TEF和VSN),通过设计跨内含子引物,分别对金针菇不同菌株(Fy331、Fw12、川金10、Fv296、金黄11和福建白金)菌丝和Fy331菌株不同发育阶段(菌丝、原基、幼嫩子实体和成熟子实体)样品进行实时荧光定量PCR(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测,并采用ΔCt算法和NormFinder、BestKeeper、GeNorm等软件对检测结果进行表达稳定性分析,以期筛选出在不同菌株菌丝和不同发育阶段中稳定表达的内参基因。结果表明:Vha68、TEF和β-TUB基因在不同菌株菌丝中表达稳定;Vha68、ACT和GPD基因在不同发育阶段样品中表达稳定。综合评价与qRT-PCR验证分析结果显示,Vha68和TEF、Vha68和ACT分别适合作为金针菇不同菌株菌丝、不同发育阶段qRT-PCR检测基因表达的最佳内参基因。
