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基于SRAP-PCR技术开发荞麦种间特异标记及相关序列分析
被引量：
1
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作者
王丽
孙朝霞
+4 位作者
刘荣华
侯思宇
李红英
韩渊怀
黄可胜
《山西农业大学学报（自然科学版）》
CAS
2016年第12期879-884,共6页
[目的]荞麦种质资源繁多,天然的自交不亲和特性使甜荞繁殖的种子存在一定程度的杂合。而苦荞的自交亲和特性又使其繁殖种子世代生殖隔离。为开发鉴别不同荞麦品种以及种子纯度特异分子标记。[方法]基于SRAPPCR技术,根据40个荞麦品种间DN...
[目的]荞麦种质资源繁多,天然的自交不亲和特性使甜荞繁殖的种子存在一定程度的杂合。而苦荞的自交亲和特性又使其繁殖种子世代生殖隔离。为开发鉴别不同荞麦品种以及种子纯度特异分子标记。[方法]基于SRAPPCR技术,根据40个荞麦品种间DNA多态性位点,将种间差异PCR扩增位点的DNA带回收测序,生物信息学分析其序列特征。[结果]克隆了8个种间多态性位点;经核酸序列分析,仅有2个差异PCR扩增位点序列包含SRAPPCR扩增的上下游引物序列,分别暂时命名为8802-1和M化5;其他位点分析表明均为单引物扩增序列。其中,8802-1位点核酸序列长度为705bp,包含3个常用酶切位点;预测到1个ORF区,所编码的氨基酸序列经BLASTP比对分析,未找到任何与蛋白质数据库中同源的氨基酸序列。M化5位点核酸序列长度为687bp,包含3个酶切位点和2个ORF,经BLASTP比对分析,预测第2个ORF编码的氨基酸序列与拟南芥的反转座子蛋白同源性为71%,推断该序列为包含一个反转座子元件的基因。[结论]本研究获得了2个品种特异位点序列,其中一个位点序列包含编码的反转座子元件,另一个为冗余的基因组序列,可进一步将这两个序列开发为STS标记,应用于荞麦种质资源遗传多样性分析、种子纯度鉴定、遗传图谱构建和分子标记辅助育种。
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关键词
甜荞
DNA多态性位点
SRAP-PCR技术
分子标记
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职称材料
题名
基于SRAP-PCR技术开发荞麦种间特异标记及相关序列分析
被引量：
1
1
作者
王丽
孙朝霞
刘荣华
侯思宇
李红英
韩渊怀
黄可胜
机构
山西
农业
大学农学院
山西
农业
大学
农业
生物工程研究所
山西省农科院农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室
浙江农林大学
出处
《山西农业大学学报（自然科学版）》
CAS
2016年第12期879-884,共6页
基金
国家自然科学基金(NSFC:31301385)
山西省科技攻关项目(20150311007-1)
文摘
[目的]荞麦种质资源繁多,天然的自交不亲和特性使甜荞繁殖的种子存在一定程度的杂合。而苦荞的自交亲和特性又使其繁殖种子世代生殖隔离。为开发鉴别不同荞麦品种以及种子纯度特异分子标记。[方法]基于SRAPPCR技术,根据40个荞麦品种间DNA多态性位点,将种间差异PCR扩增位点的DNA带回收测序,生物信息学分析其序列特征。[结果]克隆了8个种间多态性位点;经核酸序列分析,仅有2个差异PCR扩增位点序列包含SRAPPCR扩增的上下游引物序列,分别暂时命名为8802-1和M化5;其他位点分析表明均为单引物扩增序列。其中,8802-1位点核酸序列长度为705bp,包含3个常用酶切位点;预测到1个ORF区,所编码的氨基酸序列经BLASTP比对分析,未找到任何与蛋白质数据库中同源的氨基酸序列。M化5位点核酸序列长度为687bp,包含3个酶切位点和2个ORF,经BLASTP比对分析,预测第2个ORF编码的氨基酸序列与拟南芥的反转座子蛋白同源性为71%,推断该序列为包含一个反转座子元件的基因。[结论]本研究获得了2个品种特异位点序列,其中一个位点序列包含编码的反转座子元件,另一个为冗余的基因组序列,可进一步将这两个序列开发为STS标记,应用于荞麦种质资源遗传多样性分析、种子纯度鉴定、遗传图谱构建和分子标记辅助育种。
关键词
甜荞
DNA多态性位点
SRAP-PCR技术
分子标记
Keywords
Buckwheat
Molecular marker assisted selection
SRAP-PCR
Sequence analysis
分类号
S515 [农业科学—作物学]
Q94 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SRAP-PCR技术开发荞麦种间特异标记及相关序列分析
王丽
孙朝霞
刘荣华
侯思宇
李红英
韩渊怀
黄可胜
《山西农业大学学报（自然科学版）》
CAS
2016
1
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参考文献
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