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基于加权随机森林的三阴性乳腺癌microRNA组学数据的分类预测
被引量：
1
1
作者
郭志飞
王碧珏
+4 位作者
杨海涛
李治
王菊平
曹红艳
周立业
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2020年第6期809-812,817,共5页
目的基于microRNA组学数据,探讨加权随机森林在三阴性乳腺癌分类预测中的应用,为疾病诊断提供方法学支撑。方法以TCGA乳腺癌数据为例,采用加权随机森林构建三阴性乳腺癌的分类预测模型,并与随机森林、logistic回归、支持向量机、LASSO...
目的基于microRNA组学数据,探讨加权随机森林在三阴性乳腺癌分类预测中的应用,为疾病诊断提供方法学支撑。方法以TCGA乳腺癌数据为例,采用加权随机森林构建三阴性乳腺癌的分类预测模型,并与随机森林、logistic回归、支持向量机、LASSO和岭回归五种模型进行比较。结果通过比较六种模型的5个评价指标,加权随机森林模型的预测性能明显优于其他五种模型,加权随机森林模型的灵敏度为0.852、特异度为0.873、准确度为0.871、AUC值为0.862和G-means值为0.861。结论加权随机森林构建的分类预测模型较好地识别了三阴性乳腺癌患者,可为三阴性乳腺癌的诊断提供方法学上的参考。
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关键词
加权随机森林
分类预测
MICRORNA
三阴性乳腺癌
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职称材料
基于因果推断方法检验mRNA在年龄和低级别胶质瘤中的中介效应
被引量：
1
2
作者
王碧珏
郭志飞
+4 位作者
杨海涛
李治
王菊平
曹红艳
周立业
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2020年第6期840-843,847,共5页
目的构建年龄、mRNA表达水平和低级别胶质瘤(LGG)患者结局之间的因果中介推断模型,识别介导年龄和LGG结局的中介因子,为LGG的治疗和预后提供方法指导。方法以TCGA数据库中LGG数据为例,采用CIT和VanderWeele方法建立因果中介模型,识别年...
目的构建年龄、mRNA表达水平和低级别胶质瘤(LGG)患者结局之间的因果中介推断模型,识别介导年龄和LGG结局的中介因子,为LGG的治疗和预后提供方法指导。方法以TCGA数据库中LGG数据为例,采用CIT和VanderWeele方法建立因果中介模型,识别年龄和LGG结局之间的介导基因。结果识别出11个在年龄和LGG结局之间起中介作用的基因,中介间接效应的RR值均大于1,表明这11个基因的表达异常可能是LGG不良结局的危险因素。结论基于因果推断的方法能够识别介导年龄和低级别胶质瘤结局的重要基因,为LGG的预后治疗提供了潜在的预后标志物和治疗靶点。
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关键词
因果推断
中介分析
MRNA
低级别胶质瘤
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职称材料
题名
基于加权随机森林的三阴性乳腺癌microRNA组学数据的分类预测
被引量：
1
1
作者
郭志飞
王碧珏
杨海涛
李治
王菊平
曹红艳
周立业
机构
山西
医科
大学
卫生管理学
教研室
山西医科大学社会医学教研室
河北
医科
大学
流行病与卫生统计学
教研室
中北
大学
体育学院
山西
医科
大学
卫生统计
教研室
重大疾病风险评估
山西
省重点实验室
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2020年第6期809-812,817,共5页
基金
国家自然科学基金资助(71403156)
山西省回国留学人员科研资助(2017-054)
+1 种基金
山西省应用基础研究计划(201901D111204)
河北省自然科学基金(H2019206558)。
文摘
目的基于microRNA组学数据,探讨加权随机森林在三阴性乳腺癌分类预测中的应用,为疾病诊断提供方法学支撑。方法以TCGA乳腺癌数据为例,采用加权随机森林构建三阴性乳腺癌的分类预测模型,并与随机森林、logistic回归、支持向量机、LASSO和岭回归五种模型进行比较。结果通过比较六种模型的5个评价指标,加权随机森林模型的预测性能明显优于其他五种模型,加权随机森林模型的灵敏度为0.852、特异度为0.873、准确度为0.871、AUC值为0.862和G-means值为0.861。结论加权随机森林构建的分类预测模型较好地识别了三阴性乳腺癌患者,可为三阴性乳腺癌的诊断提供方法学上的参考。
关键词
加权随机森林
分类预测
MICRORNA
三阴性乳腺癌
Keywords
Weighted random forest
Classification prediction
microRNA
Triple negative breast cancer
分类号
R195.1 [医药卫生—卫生统计学]
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职称材料
题名
基于因果推断方法检验mRNA在年龄和低级别胶质瘤中的中介效应
被引量：
1
2
作者
王碧珏
郭志飞
杨海涛
李治
王菊平
曹红艳
周立业
机构
山西医科大学社会医学教研室
山西
医科
大学
卫生管理学
教研室
河北
医科
大学
流行病与卫生统计学
教研室
中北
大学
体育学院
山西
医科
大学
卫生统计
教研室
重大疾病风险评估
山西
省重点实验室
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2020年第6期840-843,847,共5页
基金
国家自然科学基金资助(71403156,81872717)
山西省回国留学人员科研资助(2017-054)
山西省应用基础研究计划(201901D111204)。
文摘
目的构建年龄、mRNA表达水平和低级别胶质瘤(LGG)患者结局之间的因果中介推断模型,识别介导年龄和LGG结局的中介因子,为LGG的治疗和预后提供方法指导。方法以TCGA数据库中LGG数据为例,采用CIT和VanderWeele方法建立因果中介模型,识别年龄和LGG结局之间的介导基因。结果识别出11个在年龄和LGG结局之间起中介作用的基因,中介间接效应的RR值均大于1,表明这11个基因的表达异常可能是LGG不良结局的危险因素。结论基于因果推断的方法能够识别介导年龄和低级别胶质瘤结局的重要基因,为LGG的预后治疗提供了潜在的预后标志物和治疗靶点。
关键词
因果推断
中介分析
MRNA
低级别胶质瘤
Keywords
Causal inference
Mediation analysis
mRNA
Low-grade glioma
分类号
R195.1 [医药卫生—卫生统计学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于加权随机森林的三阴性乳腺癌microRNA组学数据的分类预测
郭志飞
王碧珏
杨海涛
李治
王菊平
曹红艳
周立业
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2020
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于因果推断方法检验mRNA在年龄和低级别胶质瘤中的中介效应
王碧珏
郭志飞
杨海涛
李治
王菊平
曹红艳
周立业
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2020
1
在线阅读
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
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