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基于SSR标记的马铃薯野生种和地方种遗传多样性分析和指纹图谱构建
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作者 卢瑶 袁平平 +3 位作者 金鑫 毛向红 范向斌 白小东 《生物技术通报》 北大核心 2025年第9期94-104,共11页
【目的】从分子水平分析马铃薯野生种、地方种的遗传多样性并建立马铃薯种质资源的指纹图谱库。【方法】利用简单串接重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记技术,对国际马铃薯中心亚太中心保存的73份马铃薯野生种、地方种的遗... 【目的】从分子水平分析马铃薯野生种、地方种的遗传多样性并建立马铃薯种质资源的指纹图谱库。【方法】利用简单串接重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记技术,对国际马铃薯中心亚太中心保存的73份马铃薯野生种、地方种的遗传多样性进行研究。【结果】平均等位基因数(Na)为1.8437,Nei’s平均基因多样性指数为0.0659,平均Shannon信息指数为0.1286,多态性信息含量PIC平均值为0.8484,表明供试的73份马铃薯种质资源多态性高但遗传差异小。Structure群体结构将73份马铃薯种质分为7个类群,UPGMA聚类分析分为4个类群。【结论】从14对引物中筛选出可完全区分73份种质的5对核心引物,构建了73份马铃薯野生种和地方种的指纹图谱,为后续马铃薯种质鉴定和筛选体系的研究提供了理论基础和技术支撑。 展开更多
关键词 马铃薯 野生种 地方种 遗传多样性 SSR 指纹图谱
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晋北地区引进马铃薯品种表型性状遗传多样性分析
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作者 卢瑶 毛向红 +2 位作者 沈日敏 范向斌 白小东 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第1期81-88,共8页
为筛选适宜晋北地区种植的优异马铃薯品种,对引进的42个马铃薯品种的12个质量性状和6个数量性状进行表型性状遗传多样性分析、相关性分析、主成分分析和系统聚类分析。结果表明,引进的品种表型多样性丰富,质量性状中的熟性、花繁茂性、... 为筛选适宜晋北地区种植的优异马铃薯品种,对引进的42个马铃薯品种的12个质量性状和6个数量性状进行表型性状遗传多样性分析、相关性分析、主成分分析和系统聚类分析。结果表明,引进的品种表型多样性丰富,质量性状中的熟性、花繁茂性、薯形、薯皮类型、肉色和芽眼深度,遗传多样性指数分别达到了1.24、1.23、1.59、1.08、1.09和1.05。6个数量性状的遗传多样性指数均在1.5左右,变异系数范围在17.65%~61.00%,其中主茎数和分枝数的变异系数较大。相关性分析结果表明,株高与茎粗、分枝数呈极显著正相关,与主茎数呈显著正相关,商品薯率与主茎数呈极显著负相关,与产量呈极显著正相关。主成分分析法确定7个主成分的累积贡献率为78.23%。系统聚类分析将42个马铃薯品种分为5类,其中第Ⅰ类群和第Ⅳ类群不适宜常规大田管理;第Ⅲ类群是适宜在晋北地区种植的品种;第Ⅴ类群的品种可以作为育种的亲本材料。研究结果对晋北地区马铃薯品种筛选和育种亲本材料选择具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 马铃薯 质量性状 数量性状 遗传多样性
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基于SSR荧光标记毛细管电泳的马铃薯品种遗传多样性分析及分子身份证构建 被引量:7
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作者 毛向红 卢瑶 +2 位作者 范向斌 杜培兵 白小东 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期131-140,共10页
【目的】对引进的马铃薯品种进行遗传多样性分析和评价。【方法】使用SSR荧光标记毛细管电泳法分析51份引进的马铃薯品种的遗传多样性,并构建分子身份证。【结果】41对引物共扩增出327个等位位点,311个等位位点在相同位置存在差异性,多... 【目的】对引进的马铃薯品种进行遗传多样性分析和评价。【方法】使用SSR荧光标记毛细管电泳法分析51份引进的马铃薯品种的遗传多样性,并构建分子身份证。【结果】41对引物共扩增出327个等位位点,311个等位位点在相同位置存在差异性,多态性比例是95.11%;引物多态性信息指数(PIC)在0-0.89之间,平均为0.71;Shannon's(I)在0-0.54之间,平均为0.32。在遗传相似系数GS为0.76时,将供试材料分为6大类,第Ⅰ类包括14个品种;第Ⅱ类包括30个品种,第Ⅲ类包括3个品种,第Ⅴ类包括2个品种;第Ⅳ类和第Ⅵ类各包含1个品种。聚类分析发现维拉斯、定薯4号、克新33号和东农312这4个品种可作为马铃薯育种材料。【结论】筛选到3对核心引物STM0037、SSR0387、SSR01054可用于构建51个马铃薯品种的指纹图谱和分子身份证。 展开更多
关键词 马铃薯 SSR 毛细管电泳 遗传多样性 分子身份证
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马铃薯抗晚疫病及病毒病种质资源分子标记辅助筛选 被引量:1
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作者 卢瑶 金鑫 +3 位作者 沈日敏 范向斌 毛向红 白小东 《中国马铃薯》 2024年第4期289-299,共11页
为筛选具有多个晚疫病、马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)和马铃薯卷叶病毒(Potato leafroll virus,PLRV)抗性基因的马铃薯种质资源,利用4个与晚疫病抗性相关分子标记R2-800、R3a、R3b、R2F,3个与抗PVY的基因Ry_(sto)、Ry_(chc)紧密连... 为筛选具有多个晚疫病、马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)和马铃薯卷叶病毒(Potato leafroll virus,PLRV)抗性基因的马铃薯种质资源,利用4个与晚疫病抗性相关分子标记R2-800、R3a、R3b、R2F,3个与抗PVY的基因Ry_(sto)、Ry_(chc)紧密连锁的分子标记YES3-3B、GP122-564、Ry364和抗PLRV的基因PLRV.1紧密连锁的分子标记N1271164,对174份山西省保存的马铃薯种质资源进行检测。174份种质资源均含有1个或1个以上的抗性分子标记,单个标记中含有R3b和GP122-564抗性分子标记的有173份;多个标记中只含有7个标记R3a、R3b、R2F、N127_(1164)、YES3-3B、Ry364、GP122-564的马铃薯种质资源有84份。聚类分析结果将174份种质资源分为5类,其中第Ⅲ类25份均含有8个分子标记,其中仅有6份为国内育成品种,分别为‘早大白’‘内薯7号’‘希森4号’‘天薯9号’‘中薯19号’‘京张薯1号’,其余均为国际马铃薯中心提供的资源,因此这一类可作为山西省马铃薯抗病育种材料。筛选出的晚疫病和PVY、PLRV抗性资源,将为相关病害抗性资源、分子标记的进一步利用以及抗病基因的聚合育种奠定基础。 展开更多
关键词 马铃薯 分子标记 晚疫病 马铃薯Y病毒(PVY) 马铃薯卷叶病毒(PLRV)
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