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猪环状RNA IGF1R促进脂肪细胞分化
被引量：
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作者
张娜
李萌
+7 位作者
李娇
孟珊
蔡春波
杨阳
高鹏飞
郭晓红
曹果清
李步高
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期333-342,共10页
环状RNA(circular RNA,circRNA)作为竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)在细胞分化调控中发挥着重要作用。本研究旨在对猪环状RNA IGF1R(circular RNA insulin-like growth factor 1 receptor,circIGF1R)进行鉴定及分析,...
环状RNA(circular RNA,circRNA)作为竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)在细胞分化调控中发挥着重要作用。本研究旨在对猪环状RNA IGF1R(circular RNA insulin-like growth factor 1 receptor,circIGF1R)进行鉴定及分析,探明其表达规律,构建猪circIGF1R相关的ceRNA调控网络,并探究其异位表达对小鼠间充质干细胞(C3H10T1/2)成脂分化的调控作用。通过正反向引物PCR、Sanger测序、RNase R酶消化检测和qRT-PCR验证circIGF1R是胰岛素样生长因子1受体(insulin-like growth factor 1 receptor,IGF1R)第二外显子形成的circRNA,它在猪各组织中均有表达,且其表达量在脂肪组织中随日龄增加呈上升趋势;使用miRDB、TargetScan和miRWalk在线软件预测circIGF1R靶基因,运用RNAhybrid软件进行结合位点预测,使用DAVID生物信息功能分析软件对候选靶基因进行GO和KEGG富集分析,运用Cytoscape软件构建ceRNA网络,基于基因表达相关性和预测的靶标关系,绘制了GO和KEGG富集分析及构建了ceRNA网络;双荧光素酶报告基因分析证明circIGF1R及FABP 4可与ssc(Sus scrofa chromosome)-miR-133a-5p结合;成功构建circIGF1R过表达载体,在间充质干细胞C3H10T1/2中异位表达,过表达circIGF1R后关键成脂调控因子CEBPα、CEBPβ、FABP 4和PPARγ极显著升高(P<0.01),脂滴数量显著增加。本研究结果证明,circIGF1R在猪脂肪组织中存在,并且可能通过ceRNA机制正调控C3H10T1/2细胞成脂分化,为进一步研究circIGF1R调控猪前体肌内脂肪细胞成脂分化奠定理论基础。
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关键词
环状RNA
竞争性内源RNA
胰岛素样生长因子1受体
间充质干细胞C3H10T1/2
成脂分化
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职称材料
题名
猪环状RNA IGF1R促进脂肪细胞分化
被引量：
1
1
作者
张娜
李萌
李娇
孟珊
蔡春波
杨阳
高鹏飞
郭晓红
曹果清
李步高
机构
山西农业大学动物科学学院动物遗传育种与繁殖系猪种质创新实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期333-342,共10页
基金
国家自然科学基金项目(No.31872336)
三晋学者人才项目(2016,2017)资助。
文摘
环状RNA(circular RNA,circRNA)作为竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)在细胞分化调控中发挥着重要作用。本研究旨在对猪环状RNA IGF1R(circular RNA insulin-like growth factor 1 receptor,circIGF1R)进行鉴定及分析,探明其表达规律,构建猪circIGF1R相关的ceRNA调控网络,并探究其异位表达对小鼠间充质干细胞(C3H10T1/2)成脂分化的调控作用。通过正反向引物PCR、Sanger测序、RNase R酶消化检测和qRT-PCR验证circIGF1R是胰岛素样生长因子1受体(insulin-like growth factor 1 receptor,IGF1R)第二外显子形成的circRNA,它在猪各组织中均有表达,且其表达量在脂肪组织中随日龄增加呈上升趋势;使用miRDB、TargetScan和miRWalk在线软件预测circIGF1R靶基因,运用RNAhybrid软件进行结合位点预测,使用DAVID生物信息功能分析软件对候选靶基因进行GO和KEGG富集分析,运用Cytoscape软件构建ceRNA网络,基于基因表达相关性和预测的靶标关系,绘制了GO和KEGG富集分析及构建了ceRNA网络;双荧光素酶报告基因分析证明circIGF1R及FABP 4可与ssc(Sus scrofa chromosome)-miR-133a-5p结合;成功构建circIGF1R过表达载体,在间充质干细胞C3H10T1/2中异位表达,过表达circIGF1R后关键成脂调控因子CEBPα、CEBPβ、FABP 4和PPARγ极显著升高(P<0.01),脂滴数量显著增加。本研究结果证明,circIGF1R在猪脂肪组织中存在,并且可能通过ceRNA机制正调控C3H10T1/2细胞成脂分化,为进一步研究circIGF1R调控猪前体肌内脂肪细胞成脂分化奠定理论基础。
关键词
环状RNA
竞争性内源RNA
胰岛素样生长因子1受体
间充质干细胞C3H10T1/2
成脂分化
Keywords
circular RNA(circRNA)
competing endogenous RNAs(ceRNA)
insulin-like growth factor 1 receptor(IGF1R)
mesenchymal stem cells C3H10T1/2
adipogenic differentiation
分类号
Q291 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪环状RNA IGF1R促进脂肪细胞分化
张娜
李萌
李娇
孟珊
蔡春波
杨阳
高鹏飞
郭晓红
曹果清
李步高
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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