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基于数据库数据分析脑胶质瘤组织中FN1基因的表达变化及其预后预测效能 被引量:3
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作者 王计虎 王政 +3 位作者 范文勇 郑佳 陈伟强 许加军 《山东医药》 CAS 2022年第27期41-45,共5页
目的 观察纤维连接蛋白1(FN1)基因在胶质瘤组织中的表达变化,并探讨其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法 基于TCGA数据库和GTEx数据库中胶质瘤及正常脑组织转录组数据,分析FN1基因在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异及与患者临床... 目的 观察纤维连接蛋白1(FN1)基因在胶质瘤组织中的表达变化,并探讨其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法 基于TCGA数据库和GTEx数据库中胶质瘤及正常脑组织转录组数据,分析FN1基因在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异及与患者临床病理特征的相关性。用Kaplan-Meier生存分析及ROC分析FN1基因在胶质瘤患者预后中的价值。使用ssGSEA算法及TIMER数据库进行肿瘤免疫细胞浸润分析。利用clusterProfiler包进行KEGG通路及GO功能富集分析。通过STRING数据库得到FN1蛋白互作网络。利用cancerSEA数据库进行FN1基因表达与肿瘤细胞功能状态的相关性分析。结果 FN1基因在胶质瘤组织中表达明显上调(P<0.01),并与肿瘤分级增加、IDH分型、1p19q缺失、年龄以及胶质瘤的组织病理学分型有关(P均<0.001)。FN1基因高表达是胶质瘤患者的不良预后因素。FN1基因表达与肿瘤微环境中B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、树突状细胞、中性粒细胞、巨噬细胞等免疫细胞免疫浸润有关(P均<0.001)。FN1基因表达与肿瘤血管内皮细胞增生、肿瘤细胞分化呈正相关(r分别为0.58、0.47,P均<0.001),与肿瘤细胞DNA损伤、细胞周期呈负相关(r分别为-0.52、-0.45,P均<0.01)。FN1基因有关的生物过程共有351条,包括补体激活等;细胞组分共有28条,包括免疫球蛋白复合物等;分子功能共有94条,包括抗原结合等。KEGG分子信号通路29条,主要包括细胞因子-细胞因子受体相互作用等。FN1的互作蛋白主要有ITGB1、ITGB3、ITGA3等。结论 FN1基因在胶质瘤组织中的表达上调,是预后不良的指标;与肿瘤免疫细胞浸润及胶质瘤细胞功能状态相关;FN1基因有关的生物功能与补体激活、免疫球蛋白复合物、抗原结合等有关,参与的信号通路要包括细胞因子-细胞因子受体相互作用等,互作蛋白主要有ITGB等。 展开更多
关键词 纤维连接蛋白1 胶质瘤 生物学功能分析 免疫细胞浸润 肿瘤细胞功能状态
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颅骨骨肉瘤的影像学特点
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作者 武玉良 朱玉英 +4 位作者 李立新 张殿星 黄世廷 张睿 孙博 《医学影像学杂志》 2020年第11期2084-2086,共3页
目的探讨颅骨骨肉瘤的影像学特点,以期为外科治疗提供精准化依据。方法选取经病理证实的10例颅骨骨肉瘤的影像学表现。本组患者男性7例,女性3例,平均年龄36.5岁。结果10例患者中原发性骨肉瘤7例,继发性骨肉瘤3例。3例病变位于颞骨,2例... 目的探讨颅骨骨肉瘤的影像学特点,以期为外科治疗提供精准化依据。方法选取经病理证实的10例颅骨骨肉瘤的影像学表现。本组患者男性7例,女性3例,平均年龄36.5岁。结果10例患者中原发性骨肉瘤7例,继发性骨肉瘤3例。3例病变位于颞骨,2例位于蝶骨,2例位于顶骨,1例位于额骨,1例患者病变同时累及颞骨和蝶骨,1例同时累及颞骨和枕骨。成骨型骨肉瘤7例,溶骨型骨肉瘤2例,混合型骨肉瘤1例。影像表现主要为骨质破坏,软组织肿块,以及肿块内瘤骨形成,增强扫描呈不均匀明显强化。结论应用不同的检查手段,并注意瘤骨的识别,将有助于提高对颅骨骨肉瘤影像诊断的准确性,为临床手术提供更为准确的影像学依据。 展开更多
关键词 骨肉瘤 颅骨 体层摄影术 X线计算机 磁共振成像
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LncRNA MEG3在胶质瘤组织中的表达变化及其相关功能 被引量:1
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作者 张珂珂 张振 +2 位作者 郭庚寅 陈金言 何东 《山东医药》 CAS 2023年第4期11-16,共6页
目的基于生物信息学分析长链非编码RNA(LncRNA)母系表达基因3(MEG3)在胶质瘤组织中的表达变化及其相关功能。方法基于人类蛋白质图谱(HPA)数据集分析MEG3在不同组织中的表达,根据癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据集应用R软件分析其在泛癌... 目的基于生物信息学分析长链非编码RNA(LncRNA)母系表达基因3(MEG3)在胶质瘤组织中的表达变化及其相关功能。方法基于人类蛋白质图谱(HPA)数据集分析MEG3在不同组织中的表达,根据癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据集应用R软件分析其在泛癌中的表达,进一步使用泛胶质瘤数据集(TCGA-GBMLGG)中的临床病理特征资料分析MEG3在胶质瘤与正常脑组织的表达关系,同时分析不同WHO分级以及胶质瘤重要分子病理标志(IDH突变与1p/19q共缺失)与MEG3表达的相关性;并应用临床预后数据绘制各MEG3亚组患者的生存曲线,用基因型-组织表达(GTEx)数据库匹配TCGA-GBMLGG数据集,绘制受试者工作特征曲线评估其诊断效能。应用Linkedomics数据库中的TCGA-GBMLGG数据分析MEG3共表达基因的功能富集情况,应用R软件DESeq2软件包分析以MEG3作为亚组的不同亚组间差异表达基因,用Metascape数据库分析差异基因的表达,用基因集富集(GESA)分析全部差异表达基因富集的功能通路,单样本基因集富集(ssGESA)与肿瘤免疫估算数据库(TIMER)分析MEG3表达与胶质瘤免疫浸润状态的关系。结果MEG3在胶质瘤组织中低表达,与1p/19q共缺少相关;MEG3可区分正常脑组织与胶质瘤组织。MEG3相关表达基因的功能富集结果显示,其与神经系统与免疫功能密切相关;MEG3的差异基因功能富集结果显示其与干扰素反应相关,主要影响巨噬细胞、细胞毒性细胞的免疫浸润状态,并且不同MEG3分组的临床样本中多种免疫细胞富集分数具有显著差异,提示MEG3低表达可能与胶质瘤的免疫抑制微环境相关。结论MEG3在胶质瘤组织中低表达,可作为胶质瘤的诊断标志物与预后标志物,有望成为胶质瘤免疫治疗和相关研究的重要靶点。 展开更多
关键词 胶质瘤 长链非编码RNA 母体表达基因3 生物信息学 免疫浸润
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胶质母细胞瘤组织Asporin表达变化及其与患者替莫唑胺耐药、预后的关系 被引量:1
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作者 郑向荣 杨洪安 丁锋 《山东医药》 CAS 2021年第24期25-28,共4页
目的观察胶质母细胞瘤(GBM)组织中牙周韧带相关蛋白-1(Asporin)的表达变化,并分析其与患者替莫唑胺(TMZ)耐药、预后的关系。方法选取GBM组织40例份,正常脑组织10例份,采用Western blotting法和免疫组化法检测各脑组织Asporin,根据Aspori... 目的观察胶质母细胞瘤(GBM)组织中牙周韧带相关蛋白-1(Asporin)的表达变化,并分析其与患者替莫唑胺(TMZ)耐药、预后的关系。方法选取GBM组织40例份,正常脑组织10例份,采用Western blotting法和免疫组化法检测各脑组织Asporin,根据Asporin的表达情况将GBM标本分为高表达者和低表达者,分析Asporin表达与患者对TMZ耐药性、预后的关系。结果 GBM组织、正常脑组织Asporin相对表达量分别为1.90±1.20、0.34±0.20,免疫组化染色得分分别为(8.01±4.38)、(2.00±1.15)分,两者比较,P均<0.05。接受MGMT启动子甲基化检测的17例GBM患者中,12例MGMT启动子未甲基化(对TMZ耐药),5例MGMT启动子甲基化(对TMZ敏感),12例对TMZ耐药者、5例对TMZ敏感者瘤组织Asporin相对表达量分别为3.07±0.61、1.04±0.18,两者比较,P<0.05;接受MGMT启动子甲基化检测的17例GBM患者根据瘤组织免疫组化染色评分结果分为Asporin高表达者(13例)、Asporin低表达者(4例),Asporin高、低表达者中对TMZ耐药者分别为10、2例,两者比较,P<0.05。30例GBM患者根据瘤组织Asporin染色评分结果分为高表达者(27例)、低表达者(13例),Asporin高、低表达者中位生存期分别为(12.0±0.7)、(23.0±3.9)个月,两者比较,P<0.05。结论 GBM组织Asporin的表达升高,Asporin表达水平越高,对TMZ耐药者越多,患者预后越差。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 牙周韧带相关蛋白-1 替莫唑胺 患者预后
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