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HLA新等位基因A~*02:355序列及其编码蛋白分子三维结构模拟分析
被引量：
3
1
作者
聂向民
朱海峰
+2 位作者
朱传福
乔文本
刘艳
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第13期1559-1563,共5页
目的:鉴定分析HLA新等位基因A*02:355的序列变异并预测分析其氨基酸残基改变在编码蛋白分子三维空间结构中的影响。方法:应用Luminex SSO流式、PCR-SBT及单等位基因特异性测序对1例A位点变异序列进行鉴定。应用Phyre2蛋白折叠识别在线...
目的:鉴定分析HLA新等位基因A*02:355的序列变异并预测分析其氨基酸残基改变在编码蛋白分子三维空间结构中的影响。方法:应用Luminex SSO流式、PCR-SBT及单等位基因特异性测序对1例A位点变异序列进行鉴定。应用Phyre2蛋白折叠识别在线服务器以及RasMol和PDB Protein Workshop分析软件,对其编码蛋白分子三级结构及其氨基酸残基改变特点在MHC分子三维空间结构中所处位置及可能影响进行模拟分析。结果:相较于A*02:03:01,其第98、102位核苷酸发生T->A、A->C替代,导致其编码氨基酸发生9F→Y改变。其编码蛋白分子三维结构模拟分析表明,该氨基酸变异位置位于α1和α2结构域抗原多肽结合凹槽β折叠片层底面的第1 β股链的中心位置,该位置亦参与构成抗原多肽结合凹袋B和凹袋C。结论:该等位基因序列被WHO HLA命名委员会正式命名为A*02:355。分析预测此编码氨基酸改变将可能影响其MHC分子的抗原多肽结合及呈递功能。
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关键词
人类白细胞抗原
测序分型
新等位基因
模拟分析
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职称材料
HLA新等位基因DRB1＊03：80的鉴定及其序列分析
被引量：
1
2
作者
聂向民
张毅
+4 位作者
庄云龙
宋永红
乔文本
刘艳
朱传福
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期509-512,共4页
本研究旨在分析鉴定中国人群HLA-DR位点1个新等位基因。应用Luminex PCR-SSO流式分型技术发现1例罕见等位基因组合样本,应用PCR-测序分型(sequence-based typing,SBT)及单等位基因特异性测序分型技术进行鉴定分析。结果表明,该样本DR位...
本研究旨在分析鉴定中国人群HLA-DR位点1个新等位基因。应用Luminex PCR-SSO流式分型技术发现1例罕见等位基因组合样本,应用PCR-测序分型(sequence-based typing,SBT)及单等位基因特异性测序分型技术进行鉴定分析。结果表明,该样本DR位点1个等位基因序列与同源性最高的DRB1*03:06等位基因相比,其第2外显子第239位核苷酸碱基由C→G,结果导致相应51位密码子编码的苏氨酸变为精氨酸。结论:确定了该样本含有1个HLA-DRB1新等位基因。该等位基因被WHO HLA因子命名委员会正式命名为DRB1*03:80。
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关键词
人类白细胞抗原
HIA新等位基因
DRB1＊03
80等位基因
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职称材料
题名
HLA新等位基因A~*02:355序列及其编码蛋白分子三维结构模拟分析
被引量：
3
1
作者
聂向民
朱海峰
朱传福
乔文本
刘艳
机构
山东省血液中心中国造血干细胞捐献者资料库山东省分型实验室
/HLA研究室
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第13期1559-1563,共5页
基金
山东省自然基金面上项目(ZR2014HM095)资助
文摘
目的:鉴定分析HLA新等位基因A*02:355的序列变异并预测分析其氨基酸残基改变在编码蛋白分子三维空间结构中的影响。方法:应用Luminex SSO流式、PCR-SBT及单等位基因特异性测序对1例A位点变异序列进行鉴定。应用Phyre2蛋白折叠识别在线服务器以及RasMol和PDB Protein Workshop分析软件,对其编码蛋白分子三级结构及其氨基酸残基改变特点在MHC分子三维空间结构中所处位置及可能影响进行模拟分析。结果:相较于A*02:03:01,其第98、102位核苷酸发生T->A、A->C替代,导致其编码氨基酸发生9F→Y改变。其编码蛋白分子三维结构模拟分析表明,该氨基酸变异位置位于α1和α2结构域抗原多肽结合凹槽β折叠片层底面的第1 β股链的中心位置,该位置亦参与构成抗原多肽结合凹袋B和凹袋C。结论:该等位基因序列被WHO HLA命名委员会正式命名为A*02:355。分析预测此编码氨基酸改变将可能影响其MHC分子的抗原多肽结合及呈递功能。
关键词
人类白细胞抗原
测序分型
新等位基因
模拟分析
Keywords
HLA
SBT
Novel allele
Model analysis
分类号
R392.2 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
HLA新等位基因DRB1＊03：80的鉴定及其序列分析
被引量：
1
2
作者
聂向民
张毅
庄云龙
宋永红
乔文本
刘艳
朱传福
机构
山东省血液中心中国造血干细胞捐献者资料库山东省分型实验室
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期509-512,共4页
基金
山东省自然科学基金面上项目(编号ZR2012CM031)
文摘
本研究旨在分析鉴定中国人群HLA-DR位点1个新等位基因。应用Luminex PCR-SSO流式分型技术发现1例罕见等位基因组合样本,应用PCR-测序分型(sequence-based typing,SBT)及单等位基因特异性测序分型技术进行鉴定分析。结果表明,该样本DR位点1个等位基因序列与同源性最高的DRB1*03:06等位基因相比,其第2外显子第239位核苷酸碱基由C→G,结果导致相应51位密码子编码的苏氨酸变为精氨酸。结论:确定了该样本含有1个HLA-DRB1新等位基因。该等位基因被WHO HLA因子命名委员会正式命名为DRB1*03:80。
关键词
人类白细胞抗原
HIA新等位基因
DRB1＊03
80等位基因
Keywords
HLA
HLA novel allele
DRB1 ＊ 03 ： 80 allele
分类号
R457.11 [医药卫生—治疗学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HLA新等位基因A~*02:355序列及其编码蛋白分子三维结构模拟分析
聂向民
朱海峰
朱传福
乔文本
刘艳
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
HLA新等位基因DRB1＊03：80的鉴定及其序列分析
聂向民
张毅
庄云龙
宋永红
乔文本
刘艳
朱传福
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引证文献
统计分析
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