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草鱼呼肠孤病毒分离株HZ08基因组L节段的全长克隆与序列分析
被引量:
3
1
作者
张超
王庆
+4 位作者
石存斌
曾伟伟
刘永奎
杨淞
吴淑勤
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2011年第1期116-123,共8页
从浙江省湖州地区采集发病草鱼(Ctenopharyngodon idellus)样品,取症状明显病鱼的肝、脾、肾组织,经过滤除菌处理后接种草鱼肾脏细胞(CIK)进行病毒分离。盲传8代,CIK细胞未出现明显细胞病变,但感染细胞固定后经电镜观察发现,细胞质内有...
从浙江省湖州地区采集发病草鱼(Ctenopharyngodon idellus)样品,取症状明显病鱼的肝、脾、肾组织,经过滤除菌处理后接种草鱼肾脏细胞(CIK)进行病毒分离。盲传8代,CIK细胞未出现明显细胞病变,但感染细胞固定后经电镜观察发现,细胞质内有大量病毒聚集,病毒无囊膜,近球形,直径约70nm,形态与已报道的草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV)相似。十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)结果显示,病毒基因组由11个dsRNA组成,呈现水生呼肠孤病毒基因组典型特征。为了从分子水平上进一步了解该病毒的特性,应用单引物扩增技术获得了该病毒基因组L节段的全长。序列分析结果表明:完整的L1、L2、L3节段分别由3 927、3 870、3 753个碱基对组成,每个节段正链RNA仅含有1个开放阅读框,通过同源性比较,推测分别编码病毒的结构蛋白VP1、VP2、VP3,其中VP1推测为病毒RNA转录的鸟苷酸转移酶和甲基化酶,VP2为病毒的RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp),VP3为病毒NTP酶及解旋酶。3个推测结构蛋白的序列与GCRV 873株的同源性最高,分别为31%、45%、36%,并且具有与其他呼肠孤病毒相同的基序(motif)。各节段都具有相同的5'端和3'端保守序列,即5'-GUAAUUU......UUCAUC-3'。利用RdRp构建系统进化树,HZ08株与水生呼肠孤病毒聚为一簇,但单独列为1支,应为水生呼肠孤病毒属新成员。
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关键词
草鱼呼肠孤病毒
序列分析
RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)
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职称材料
浅谈5S原理在水产品质量检验中的应用
被引量:
2
2
作者
时彦民
黄秀丽
+3 位作者
刘方
史艳伟
孟丽华
别鹏
《中国渔业质量与标准》
2012年第1期76-79,共4页
水产品质量检验是保证水产品质量安全的重要手段。对水产品质量检验室进行科学管理可有效提高水产品质量安全检测水平。将5S原理应用于水产品质量检验实验室管理中,阐述实施5S的措施,并分析了5S的推进层次。检验中引入5S后,能有效改进...
水产品质量检验是保证水产品质量安全的重要手段。对水产品质量检验室进行科学管理可有效提高水产品质量安全检测水平。将5S原理应用于水产品质量检验实验室管理中,阐述实施5S的措施,并分析了5S的推进层次。检验中引入5S后,能有效改进检验质量和效率,改善实验室卫生和安全状况,节约实验耗材,提高检验人员的综合素质。
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关键词
5S原理
水产品
质量检验
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职称材料
题名
草鱼呼肠孤病毒分离株HZ08基因组L节段的全长克隆与序列分析
被引量:
3
1
作者
张超
王庆
石存斌
曾伟伟
刘永奎
杨淞
吴淑勤
机构
中国水产科学研究院珠江水产研究所
上海海洋大学水产与生命学院
山东省济宁市渔业监测站
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2011年第1期116-123,共8页
基金
农业公益性行业科研专项(200803013)
现代农业产业技术体系建设专项基金项目(nycytx-49-14)
农业科技跨越计划(2008043)
文摘
从浙江省湖州地区采集发病草鱼(Ctenopharyngodon idellus)样品,取症状明显病鱼的肝、脾、肾组织,经过滤除菌处理后接种草鱼肾脏细胞(CIK)进行病毒分离。盲传8代,CIK细胞未出现明显细胞病变,但感染细胞固定后经电镜观察发现,细胞质内有大量病毒聚集,病毒无囊膜,近球形,直径约70nm,形态与已报道的草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV)相似。十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)结果显示,病毒基因组由11个dsRNA组成,呈现水生呼肠孤病毒基因组典型特征。为了从分子水平上进一步了解该病毒的特性,应用单引物扩增技术获得了该病毒基因组L节段的全长。序列分析结果表明:完整的L1、L2、L3节段分别由3 927、3 870、3 753个碱基对组成,每个节段正链RNA仅含有1个开放阅读框,通过同源性比较,推测分别编码病毒的结构蛋白VP1、VP2、VP3,其中VP1推测为病毒RNA转录的鸟苷酸转移酶和甲基化酶,VP2为病毒的RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp),VP3为病毒NTP酶及解旋酶。3个推测结构蛋白的序列与GCRV 873株的同源性最高,分别为31%、45%、36%,并且具有与其他呼肠孤病毒相同的基序(motif)。各节段都具有相同的5'端和3'端保守序列,即5'-GUAAUUU......UUCAUC-3'。利用RdRp构建系统进化树,HZ08株与水生呼肠孤病毒聚为一簇,但单独列为1支,应为水生呼肠孤病毒属新成员。
关键词
草鱼呼肠孤病毒
序列分析
RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)
Keywords
grass carp reovirus
sequence analysis
RNA-dependent RNA polymerase(RdRp)
分类号
S965.112 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
浅谈5S原理在水产品质量检验中的应用
被引量:
2
2
作者
时彦民
黄秀丽
刘方
史艳伟
孟丽华
别鹏
机构
山东省济宁市渔业监测站
山东省
济宁市
高级职业学校
出处
《中国渔业质量与标准》
2012年第1期76-79,共4页
基金
济宁市农村科技发展计划项目(采煤塌陷区渔业环境评价及生态增养殖技术研究)
文摘
水产品质量检验是保证水产品质量安全的重要手段。对水产品质量检验室进行科学管理可有效提高水产品质量安全检测水平。将5S原理应用于水产品质量检验实验室管理中,阐述实施5S的措施,并分析了5S的推进层次。检验中引入5S后,能有效改进检验质量和效率,改善实验室卫生和安全状况,节约实验耗材,提高检验人员的综合素质。
关键词
5S原理
水产品
质量检验
Keywords
5S principle
aquatic products quality
quality inspection
分类号
S951.2 [农业科学—水产养殖]
F322 [经济管理—产业经济]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草鱼呼肠孤病毒分离株HZ08基因组L节段的全长克隆与序列分析
张超
王庆
石存斌
曾伟伟
刘永奎
杨淞
吴淑勤
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2011
3
在线阅读
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职称材料
2
浅谈5S原理在水产品质量检验中的应用
时彦民
黄秀丽
刘方
史艳伟
孟丽华
别鹏
《中国渔业质量与标准》
2012
2
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职称材料
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