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基于转录组分析的甘薯贮藏根淀粉含量相关SNPs开发
1
作者
秦桢
王庆美
+7 位作者
李爱贤
周媛媛
解备涛
段文学
张海燕
李广华
董顺旭
侯夫云
《山东农业科学》
北大核心
2024年第12期10-15,共6页
甘薯是重要的粮食和经济作物,贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状,开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义。但甘薯具有自交不亲和特性,基因组是高度杂合的六倍体,增加了开发分子标记的难度。本试验以高淀粉品种漯...
甘薯是重要的粮食和经济作物,贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状,开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义。但甘薯具有自交不亲和特性,基因组是高度杂合的六倍体,增加了开发分子标记的难度。本试验以高淀粉品种漯徐薯8号和低淀粉品种郑薯20及其杂交F1代中6个高淀粉株系和6个低淀粉株系为材料,基于转录组测序分析并结合表型分析,发现44个高淀粉特异的SNPs位点,从中选取9个进行PCR单克隆分析,筛选到3个与高淀粉含量显著相关的位点,分别为chr9.27120209、chr9.27120256和chr9.13675504,用上述12个株系和F_(1)群体中的另外16个株系进行验证,最终得到3个与贮藏根淀粉含量相关的单核苷酸多态性(SNPs)位点。本试验丰富了甘薯分子标记开发的途径,为甘薯贮藏根淀粉含量相关育种提供了可选择的标记。
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关键词
甘薯
贮藏根
淀粉含量
单核苷酸多态性标记
转录组分析
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职称材料
题名
基于转录组分析的甘薯贮藏根淀粉含量相关SNPs开发
1
作者
秦桢
王庆美
李爱贤
周媛媛
解备涛
段文学
张海燕
李广华
董顺旭
侯夫云
机构
山东省农业科学院作物研究所/农业农村部黄淮海薯类科学观测站
泗水利丰食品有限公司
出处
《山东农业科学》
北大核心
2024年第12期10-15,共6页
基金
山东省自然科学基金项目(ZR2024MC207)
山东省重点研发计划项目(2021LZGC025)
+2 种基金
泰山产业领军人才工程项目(LJNY202113)
国家甘薯产业技术体系项目(CARS-10-GW08)
山东省薯类产业技术体系项目(SDAIT-16-04)。
文摘
甘薯是重要的粮食和经济作物,贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状,开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义。但甘薯具有自交不亲和特性,基因组是高度杂合的六倍体,增加了开发分子标记的难度。本试验以高淀粉品种漯徐薯8号和低淀粉品种郑薯20及其杂交F1代中6个高淀粉株系和6个低淀粉株系为材料,基于转录组测序分析并结合表型分析,发现44个高淀粉特异的SNPs位点,从中选取9个进行PCR单克隆分析,筛选到3个与高淀粉含量显著相关的位点,分别为chr9.27120209、chr9.27120256和chr9.13675504,用上述12个株系和F_(1)群体中的另外16个株系进行验证,最终得到3个与贮藏根淀粉含量相关的单核苷酸多态性(SNPs)位点。本试验丰富了甘薯分子标记开发的途径,为甘薯贮藏根淀粉含量相关育种提供了可选择的标记。
关键词
甘薯
贮藏根
淀粉含量
单核苷酸多态性标记
转录组分析
Keywords
Sweet potato
Storage root
Starch content
SNPs
Transcriptome analysis
分类号
S531.01 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组分析的甘薯贮藏根淀粉含量相关SNPs开发
秦桢
王庆美
李爱贤
周媛媛
解备涛
段文学
张海燕
李广华
董顺旭
侯夫云
《山东农业科学》
北大核心
2024
0
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