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题名布莱凯特牛心脏脂肪酸结合蛋白基因的序列测定及分析
被引量：7
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作者
李兴芳
柏学进
董懿为
封纪武
董雅娟
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机构
青岛农业大学动物胚胎工程中心
山东省黑牛繁育工程技术研究中心
山东布莱凯特牧业科技有限公司
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出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2010年第9期112-118,共7页
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基金
山东省农业良种工程重大课题(6620573)
山东省重大科技专项资助(2007ZHZX11101)
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文摘
根据GenBank发表的牦牛心脏脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid-binding protein,H-FABP)基因的序列设计13对引物,分13段扩增出布莱凯特牛H-FABP基因,采用PCR产物直接测序的方式对各个片段进行测序,使用生物信息学软件对各个片段的测序结果进行拼接,得到布莱凯特牛H-FABP基因的全序列,并对其进行序列分析。结果表明,布莱凯特牛的H-FABP基因(GenBank登录号:FJ756345)是由4个外显子(73、173、102和54 bp)和3个内含子(3463、1892和1494 bp)组成;布莱凯特牛与牦牛、普通牛、山羊、猪、马、人、大鼠、小鼠和鸡等9个物种之间的核苷酸同源性大小依次为99.3%、99.0%、96.3%、92.5%、89.8%、88.3%、83.3%、82.8%、75.6%,其氨基酸的同源性为99.2%、99.2%、96.2%、93.2%、91.7%、88.7%、86.5%、86.5%、77.4%;系统发生树将这些物种总体上分成2支,鸡为独立的一支,布莱凯特牛、牦牛、普通牛、山羊、猪、马、人、大鼠、小鼠为另一独立的大分支。因此,渤海黑牛H-FABP基因具有很强的保守性,其进化树符合物种进化规律。
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关键词
布莱凯特牛
H-FABP基因
序列测定
序列分析
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Keywords
BLACK cattle
H-FABP gene
sequencing
sequence analysis
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分类号
S823
[农业科学—畜牧学]
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题名利用微卫星标记对4个肉牛品种进行遗传多样性分析
被引量：5
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作者
董懿为
董雅娟
柏学进
李兴芳
封纪武
肖超柱
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机构
青岛农业大学动物胚胎工程中心
山东省黑牛繁育工程技术研究中心
山东布莱凯特牧业科技有限公司
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出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2010年第8期121-129,共9页
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基金
国家"863"重点项目资助(2007AA100505)
山东省重大科技专项资助(2007ZHZX11101)
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文摘
本研究利用10个微卫星标记分析了鲁西黄牛、布莱凯特肉牛、渤海黑牛和日本和牛4个品种185个个体的品种内遗传变异情况及各品种间的亲缘关系,共检测到58个等位基因,每个位点平均观察等位基因数为5.8个,从4(BM1818)到8个(ETH225和TGLA53)不等;有效等位基因数为2.5417～3.5849个;观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量变异范围分别为0.2270～0.5459、0.6082～0.7230和0.5482～0.6791,均属高度多态性位点。群体间遗传分化明显,有34.49%的遗传分化来自群体间的变异。以Nei氏遗传距离(DA)构建UPGMA系统进化树,聚类结果表明,渤海黑牛与鲁西黄牛首先聚为一类,布莱凯特肉牛和日本和牛聚为一类。布莱凯特肉牛的3个微卫星座位10个克隆的PCR扩增片段测序获得的序列已提交GenBank,登录号分别为:GQ368896、GQ368897、GQ368898、GQ368899、GQ368900、GQ368901、GQ368902、GQ368903、GQ368904、GQ368905。10对微卫星座位可作为有效的遗传标记用于4个肉牛品种的遗传多样性和系统发生关系分析。
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关键词
布莱凯特肉牛
遗传多样性
微卫星标记
克隆
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Keywords
BLACK beef cattle
genetic diversity
microsatellite
clone
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分类号
S823.92
[农业科学—畜牧学]
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