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基于加权基因共表达网络挖掘番茄抗灰霉病的关键基因
1
作者
张孟晗
韩鸿宇
+5 位作者
李亚妮
耿梦爽
刘奕飞
刘佳琳
孟宪文
李传友
《中国蔬菜》
北大核心
2025年第6期74-84,共11页
为挖掘番茄抗灰霉病关键基因,以高代自交系E6203为试材,对灰霉病菌侵染前、后的番茄幼苗叶片开展转录组测序,通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选番茄抵御灰霉病菌侵染的关键基因。结...
为挖掘番茄抗灰霉病关键基因,以高代自交系E6203为试材,对灰霉病菌侵染前、后的番茄幼苗叶片开展转录组测序,通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选番茄抵御灰霉病菌侵染的关键基因。结果表明:通过WGCNA分析共获得13个基因共表达模块,其中有2个模块与番茄早期响应灰霉病菌侵染相关,有2个模块与番茄晚期响应灰霉病菌侵染有关。功能富集分析发现,番茄在灰霉病菌侵染后初级代谢过程减弱,而防御响应过程被激活。进一步挖掘模块关键基因,在早、晚期响应模块中共筛选出4个参与调控灰霉病抗性的候选基因CDIP、DJC17、NATA2和NPF6.4。番茄抵御灰霉病菌侵染时主要涉及糖原分解、含吡啶化合物的分解、膜蛋白降解等途径。
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关键词
番茄
灰霉病
转录组测序
加权基因共表达网络分析
关键基因
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职称材料
镇江焦北滩湿地公园生态规划研究
被引量：
3
2
作者
姜小蕾
史纯鸿
姜泽盛
《山东农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2013年第2期205-210,共6页
中国有着丰富的湿地资源,如何以保护为前提,对湿地资源进行科学的开发利用,是维护湿地生态系统正常运转的关键性问题。本文着重研究镇江焦北滩东大堤以东的618hm2土地。通过进行实地考察,在当地政府部门的协助下,搜集了植被、水资源、...
中国有着丰富的湿地资源,如何以保护为前提,对湿地资源进行科学的开发利用,是维护湿地生态系统正常运转的关键性问题。本文着重研究镇江焦北滩东大堤以东的618hm2土地。通过进行实地考察,在当地政府部门的协助下,搜集了植被、水资源、湿地退化情况等相关资料,运用因子加权评分法对其进行生态适宜性分析,并绘制了生态适宜性分区图。在理论分析的基础上,文章指出用生态规划方法指导湿地公园建设,可以很好的协调生态效益和经济效益。最后,文章分别通过保护性规划和利用性规划为湿地公园建设提出指导性建议。
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关键词
湿地公园
生态规划
焦北滩
适宜性分析
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职称材料
题名
基于加权基因共表达网络挖掘番茄抗灰霉病的关键基因
1
作者
张孟晗
韩鸿宇
李亚妮
耿梦爽
刘奕飞
刘佳琳
孟宪文
李传友
机构
山东农业大学园艺科学与技术学院
山东农业大学
泰山番茄产业研究院
山东农业大学
生命
科学
学院
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2025年第6期74-84,共11页
基金
青岛市科技惠民示范工程项目(23-2-8-xdny-15-nsh)
国家重点研发计划项目(2023YFD1200100)
国家自然科学基金项目(32000364)。
文摘
为挖掘番茄抗灰霉病关键基因,以高代自交系E6203为试材,对灰霉病菌侵染前、后的番茄幼苗叶片开展转录组测序,通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选番茄抵御灰霉病菌侵染的关键基因。结果表明:通过WGCNA分析共获得13个基因共表达模块,其中有2个模块与番茄早期响应灰霉病菌侵染相关,有2个模块与番茄晚期响应灰霉病菌侵染有关。功能富集分析发现,番茄在灰霉病菌侵染后初级代谢过程减弱,而防御响应过程被激活。进一步挖掘模块关键基因,在早、晚期响应模块中共筛选出4个参与调控灰霉病抗性的候选基因CDIP、DJC17、NATA2和NPF6.4。番茄抵御灰霉病菌侵染时主要涉及糖原分解、含吡啶化合物的分解、膜蛋白降解等途径。
关键词
番茄
灰霉病
转录组测序
加权基因共表达网络分析
关键基因
Keywords
tomato
gray mold
transcriptome sequencing
weighted gene co-expression network analysis(WGCNA)
hub gene
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
镇江焦北滩湿地公园生态规划研究
被引量：
3
2
作者
姜小蕾
史纯鸿
姜泽盛
机构
青岛
农业
大学
园林与林
学院
日照经济开发区市政工程管理处
山东农业大学园艺科学与技术学院
出处
《山东农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2013年第2期205-210,共6页
文摘
中国有着丰富的湿地资源,如何以保护为前提,对湿地资源进行科学的开发利用,是维护湿地生态系统正常运转的关键性问题。本文着重研究镇江焦北滩东大堤以东的618hm2土地。通过进行实地考察,在当地政府部门的协助下,搜集了植被、水资源、湿地退化情况等相关资料,运用因子加权评分法对其进行生态适宜性分析,并绘制了生态适宜性分区图。在理论分析的基础上,文章指出用生态规划方法指导湿地公园建设,可以很好的协调生态效益和经济效益。最后,文章分别通过保护性规划和利用性规划为湿地公园建设提出指导性建议。
关键词
湿地公园
生态规划
焦北滩
适宜性分析
Keywords
Wetland park
ecological planning
Jiao bei shoals
suitability analysis
分类号
S6 [农业科学—园艺学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于加权基因共表达网络挖掘番茄抗灰霉病的关键基因
张孟晗
韩鸿宇
李亚妮
耿梦爽
刘奕飞
刘佳琳
孟宪文
李传友
《中国蔬菜》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
镇江焦北滩湿地公园生态规划研究
姜小蕾
史纯鸿
姜泽盛
《山东农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2013
3
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职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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