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题名猪流行性腹泻病毒在抗体选择压下的基因变异
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作者
余蕊
高艺
孙永科
张恒
杨玉艾
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机构
云南农业大学动物医学院
山东信得科技股份有限公司猪病研发中心
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出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第1期79-85,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(32160845)。
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文摘
【目的】研究猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)在抗体选择压下的分子变异。【方法】将PEDV Sinder02株在添加适量抗体和不添加抗体的Vero E6细胞上连续传代40代,对传代前后毒株的全基因组序列进行扩增、测序、拼接和分析。【结果】第40代有抗体组和无抗体组全基因组核苷酸发生突变的位点累计分别为71和50个,氨基酸发生突变的位点累计分别为50和26个。有抗体组S基因的非同义突变(nonsynonymous mutation,NS)与同义突变(synonymous mutation,S)的比值(NS/S值)为4.25,ORF3基因的NS/S值为3.67。有抗体组S基因出现6个稳定突变位点,其中4个与已知抗原表位有关;ORF3基因出现5个稳定突变位点,其中3个与已知抗原表位有关。有抗体组、无抗体组与原代病毒序列的同源性逐代降低,且有抗体组与原代病毒之间的差距更大、遗传距离更远。【结论】首次证明抗体选择压对PEDV Sinder02株的S基因和ORF3基因起到促变异作用。研究结果为探索PEDV变异提供了理论基础,也为新型PEDV疫苗的研制提供了科学参考。
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关键词
猪流行性腹泻病毒(PEDV)
S基因
ORF3基因
抗体选择压
基因变异
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Keywords
porcine epidemic diarrhea virus(PEDV)
S gene
ORF3 gene
antibody selective pressure
genetic variation
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分类号
S852.651
[农业科学—基础兽医学]
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