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马铃薯SUMO E3连接酶基因家族分析及StSIZ1基因的克隆与表达模式分析
1
作者
许慧珍
SHANTWANA Ghimire
+3 位作者
RAJU Kharel
岳云
司怀军
唐勋
《生物技术通报》
北大核心
2025年第6期119-129,共11页
【目的】对马铃薯StSIZ1基因进行克隆、亚细胞定位及组织表达特异性分析,为阐明StSIZ1基因的功能提供理论依据。【方法】利用拟南芥SUMO E3连接酶基因序列进行同源检索,获得马铃薯SUMO E3连接酶基因家族成员,并对其进行生物信息学分析;...
【目的】对马铃薯StSIZ1基因进行克隆、亚细胞定位及组织表达特异性分析,为阐明StSIZ1基因的功能提供理论依据。【方法】利用拟南芥SUMO E3连接酶基因序列进行同源检索,获得马铃薯SUMO E3连接酶基因家族成员,并对其进行生物信息学分析;采用RT-PCR从马铃薯品种Atlantic克隆StSIZ1基因;通过RT-qPCR探究StSIZ1基因在马铃薯组织特异性及响应非生物胁迫的表达模式。构建pEGFP-StSIZ1亚细胞定位载体,通过农杆菌介导的烟草瞬时转化系统检测StSIZ1在细胞中的定位。【结果】StSIZ1基因位于第11号染色体,CDS区长2634 bp。RT-qPCR结果显示StSIZ1基因在茎中相对表达量最低,块茎中相对表达量最高;StSIZ1基因广泛响应多种胁迫处理,如渗透、盐、高温胁迫。融合蛋白荧光检测确定StSIZ1在细胞核中发挥功能。【结论】马铃薯StSIZ1响应多种非生物胁迫,且在细胞核中发挥功能。
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关键词
马铃薯
StSIZ1
基因克隆
亚细胞定位
表达模式分析
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职称材料
两种养殖模式中草鱼土腥味特征性物质累积变化
被引量：
5
2
作者
闫莉
李慷
+6 位作者
KAMALA Gharti Chetri
鲁强
徐岩
刘如聪
王桂香
ABDOUL Gadiri Sow
刘利平
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期147-154,共8页
为探究养殖模式对草鱼(Ctenopharyngodon idella)养殖水体和肌肉中土腥味物质含量的影响,研究了池塘内循环跑道养殖系统(In-pond raceway system,IPRS)与传统养殖模式对草鱼中土腥味特征性物质土臭素(Geosmin,GSM)和二甲基异莰醇(2-meth...
为探究养殖模式对草鱼(Ctenopharyngodon idella)养殖水体和肌肉中土腥味物质含量的影响,研究了池塘内循环跑道养殖系统(In-pond raceway system,IPRS)与传统养殖模式对草鱼中土腥味特征性物质土臭素(Geosmin,GSM)和二甲基异莰醇(2-methylisoborneol,2-MIB)累积的影响。通过对不同养殖模式中水体和草鱼肌肉中2-MIB、GSM的动态检测,探究养殖过程中影响土腥味物质累积的因素。结果表明,IPRS水体和鱼肉的2-MIB随养殖时间的延长显著上升,GSM呈现相同的逐步累积趋势,且鱼肉中这2种特征性土腥味物质的变化趋势与水体一致。传统养殖模式下,水体中2-MIB含量逐渐增加,鱼肉中的2-MIB含量在实验末期显著高于实验初期和中期;水体中GSM的变化差异不显著,鱼肉与水体的GSM含量变化趋势一致,但不同时期鱼肉中的GSM含量差异显著(P<0.05),且实验末期达最大值。相关性分析表明,土腥味物质的累积量与草鱼体质量、体长呈正相关。综上,养殖水体和草鱼肌肉中土腥味物质的累积受养殖模式影响,规格为0.42~1.23 kg的草鱼的土腥味特征性物质累积速率更快。
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关键词
草鱼
养殖模式
土腥味
土臭素
二甲基异莰醇
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职称材料
题名
马铃薯SUMO E3连接酶基因家族分析及StSIZ1基因的克隆与表达模式分析
1
作者
许慧珍
SHANTWANA Ghimire
RAJU Kharel
岳云
司怀军
唐勋
机构
甘肃农业
大学
生命科学技术学院
甘肃农业
大学
园艺学院
尼泊尔农林大学
甘肃省农业工程技术研究院
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第6期119-129,共11页
基金
甘肃农业大学青年导师扶持基金(GAU-QDFC-2023-11)
甘肃省高校教师创新基金(2025A-086)
+1 种基金
甘肃省重点研发计划(25YFWA018)
国家自然科学基金项目(31860399)。
文摘
【目的】对马铃薯StSIZ1基因进行克隆、亚细胞定位及组织表达特异性分析,为阐明StSIZ1基因的功能提供理论依据。【方法】利用拟南芥SUMO E3连接酶基因序列进行同源检索,获得马铃薯SUMO E3连接酶基因家族成员,并对其进行生物信息学分析;采用RT-PCR从马铃薯品种Atlantic克隆StSIZ1基因;通过RT-qPCR探究StSIZ1基因在马铃薯组织特异性及响应非生物胁迫的表达模式。构建pEGFP-StSIZ1亚细胞定位载体,通过农杆菌介导的烟草瞬时转化系统检测StSIZ1在细胞中的定位。【结果】StSIZ1基因位于第11号染色体,CDS区长2634 bp。RT-qPCR结果显示StSIZ1基因在茎中相对表达量最低,块茎中相对表达量最高;StSIZ1基因广泛响应多种胁迫处理,如渗透、盐、高温胁迫。融合蛋白荧光检测确定StSIZ1在细胞核中发挥功能。【结论】马铃薯StSIZ1响应多种非生物胁迫,且在细胞核中发挥功能。
关键词
马铃薯
StSIZ1
基因克隆
亚细胞定位
表达模式分析
Keywords
potato
StSIZ1
gene cloning
subcellular localization
expression pattern analysis
分类号
S532 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
两种养殖模式中草鱼土腥味特征性物质累积变化
被引量：
5
2
作者
闫莉
李慷
KAMALA Gharti Chetri
鲁强
徐岩
刘如聪
王桂香
ABDOUL Gadiri Sow
刘利平
机构
上海海洋
大学
/水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
上海海洋
大学
/上海水产养殖工程技术研究中心/水产科学国家级实验教学示范中心
尼泊尔农林大学
动物科学、兽医和渔业学院
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期147-154,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2019YFD0900303)
上海市科技兴农技术创新项目(沪农科创字〔2021〕第3-1号)
上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科创字〔2018〕第2-12号)。
文摘
为探究养殖模式对草鱼(Ctenopharyngodon idella)养殖水体和肌肉中土腥味物质含量的影响,研究了池塘内循环跑道养殖系统(In-pond raceway system,IPRS)与传统养殖模式对草鱼中土腥味特征性物质土臭素(Geosmin,GSM)和二甲基异莰醇(2-methylisoborneol,2-MIB)累积的影响。通过对不同养殖模式中水体和草鱼肌肉中2-MIB、GSM的动态检测,探究养殖过程中影响土腥味物质累积的因素。结果表明,IPRS水体和鱼肉的2-MIB随养殖时间的延长显著上升,GSM呈现相同的逐步累积趋势,且鱼肉中这2种特征性土腥味物质的变化趋势与水体一致。传统养殖模式下,水体中2-MIB含量逐渐增加,鱼肉中的2-MIB含量在实验末期显著高于实验初期和中期;水体中GSM的变化差异不显著,鱼肉与水体的GSM含量变化趋势一致,但不同时期鱼肉中的GSM含量差异显著(P<0.05),且实验末期达最大值。相关性分析表明,土腥味物质的累积量与草鱼体质量、体长呈正相关。综上,养殖水体和草鱼肌肉中土腥味物质的累积受养殖模式影响,规格为0.42~1.23 kg的草鱼的土腥味特征性物质累积速率更快。
关键词
草鱼
养殖模式
土腥味
土臭素
二甲基异莰醇
Keywords
Ctenopharyngodon idella
Aquaculture system
Off-flavor
Geosmin
2-methylisoborneol
分类号
S967.4 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马铃薯SUMO E3连接酶基因家族分析及StSIZ1基因的克隆与表达模式分析
许慧珍
SHANTWANA Ghimire
RAJU Kharel
岳云
司怀军
唐勋
《生物技术通报》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
两种养殖模式中草鱼土腥味特征性物质累积变化
闫莉
李慷
KAMALA Gharti Chetri
鲁强
徐岩
刘如聪
王桂香
ABDOUL Gadiri Sow
刘利平
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
5
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职称材料
已选择
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