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猪圆环病毒3型的鉴定和遗传演化分析
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作者 陈燕凌 王颖旺 +5 位作者 杨潞 杨漫漫 李雪梅 张月 田志革 胡晓亮 《世界热带农业信息》 2024年第2期63-65,共3页
为了解宜宾市养殖场猪圆环病毒(PCV)3型的基因组特征和遗传变异规律。本试验利用PCR方法从流产母猪血液中鉴定出1株PCV3,命名为SC-YB2203。经过PCR方法扩增部分基因组序列,对测序结果拼接并进行系统进化树分析。结果显示:遗传进化树分... 为了解宜宾市养殖场猪圆环病毒(PCV)3型的基因组特征和遗传变异规律。本试验利用PCR方法从流产母猪血液中鉴定出1株PCV3,命名为SC-YB2203。经过PCR方法扩增部分基因组序列,对测序结果拼接并进行系统进化树分析。结果显示:遗传进化树分析发现SCYB2203与广州株MK142771和美国株MK496279属于同一分支3f,与西班牙株MH579746和美国株MK496280亲缘关系较近,与四川株MZ449244和重庆株KY075990亲缘关系较远。序列分析发现SC-YB2203与参考序列之间的同源性最高的为重庆株KY075990(98.5%),与湖南株MG372488的同源性为87.7%,与其他国内株同源性较高(97.6%-98.5%)。 展开更多
关键词 遗传变异规律 遗传演化分析 系统进化树分析 PCR方法 基因组特征 序列分析 宜宾市 参考序列
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一株猪圆环病毒3型的鉴定和遗传演化分析 被引量:1
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作者 张琴 杨漫漫 +5 位作者 张月 李雪梅 杨潞 田志革 胡晓亮 崔鹏博 《口岸卫生控制》 2023年第6期56-58,共3页
目的了解宜宾市养殖场猪圆环病毒(PCV)3型的基因组特征和遗传变异规律。方法本试验利用PCR方法从患有呼吸困难仔猪中鉴定出一株PCV3,命名为SC-YB2212。经过PCR方法扩增衣壳蛋白序列,对测序结果拼接并进行系统进化树分析。结果SC-YB2212... 目的了解宜宾市养殖场猪圆环病毒(PCV)3型的基因组特征和遗传变异规律。方法本试验利用PCR方法从患有呼吸困难仔猪中鉴定出一株PCV3,命名为SC-YB2212。经过PCR方法扩增衣壳蛋白序列,对测序结果拼接并进行系统进化树分析。结果SC-YB2212与国内株PCV3序列同源性为97%~97.9%。遗传进化分析发现SC-YB2212与河北株MF318449和广西株MG650174和云南株MG650176属于同一分支,与西班牙株MH579746和美国株MK496280亲缘关系较近,与四川株MZ449244和重庆株KY075992亲缘关系较远。结论本研究为深入了解PCV3的感染及其毒株的分子特征和遗传变异,为PCV3的致病性研究和防控提供参考。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 3型 衣壳蛋白 复制蛋白
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一株猪圆环病毒3型的鉴定和分子特征分析
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作者 陈燕凌 王颖旺 +5 位作者 向梳瑕 李雪梅 杨潞 杨漫漫 田志革 胡晓亮 《现代畜牧科技》 2023年第1期13-15,共3页
为了解猪圆环病毒(PCV)3型的基因组特征和遗传变异情况。本试验利用PCR方法从病死猪脾脏中鉴定出一株PCV3,命名为SC-YB2108。经过PCR方法扩增全序列,对测序结果拼接并进行系统进化树和遗传重组分析。结果显示:SC-YB2108序列长度2 000 bp... 为了解猪圆环病毒(PCV)3型的基因组特征和遗传变异情况。本试验利用PCR方法从病死猪脾脏中鉴定出一株PCV3,命名为SC-YB2108。经过PCR方法扩增全序列,对测序结果拼接并进行系统进化树和遗传重组分析。结果显示:SC-YB2108序列长度2 000 bp;遗传进化树分析发现SC-YB2108全基因组与中国株MK142771,MG96866,美国株MK496279,KX458235,韩国株MH231553处于同一独立分支,属于PCV3f。序列分析发现SC-YB2108与广西株MK095620同源性为99.2%,与湖南株MG372488的同源性为91.6%,与四川株MZ449244和OK334614的同源性分别为98.4%和98.7%。本研究有助于深入了解四川省PCV3流行毒株的分子特性,为后续PCV3的诊断试剂和疫苗开发提供依据。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 3型 衣壳蛋白 复制蛋白
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