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题名烟青虫转录组测序及分析
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作者
张海玲
李勇
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机构
安顺学院农学院/贵州省昆虫信息系统与资源开发利用重点实验室
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出处
《生物灾害科学》
2025年第3期348-353,共6页
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基金
贵州省普通高等学校青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2019]146)
安顺学院校级“金课”项目(2022XJJK10)
安顺学院“一流专业”(生物科学)项目(2021XJJZ12)。
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文摘
【目的】烟青虫(Helicoverpa assulta)是一种世界性农业害虫,对烟草危害尤为严重,但其基因资源缺乏,为获得烟青虫的基因信息,对其脂肪体和血细胞两种组织进行转录组测序和分析。【方法】选取四龄烟青虫幼虫作为样本,经RNA提取和cDNA文库构建之后,利用Illumina Hiseq测序平台分别对这两种组织进行从头组装。【结果】在脂肪体和血细胞两种组织中获得的Unigenes数量分别为46940和33707;Unigenes总长度分别为39760969 bp和22561814 bp;N50长度分别为1601 bp和1140 bp。经筛选,共获得24259个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。将DEGs进行GO数据库功能注释,分别注释到生物学过程的23个条目、细胞组分的18个条目以及分子功能的17个条目。使用KEGG数据库对DEGs进行代谢途径分析,有1179个DEGs被注释到免疫系统通路,307个DEGs被注释到外源性化合物生物降解通路。基因注释共获得1130个与抗药性相关的DEGs。【结论】研究获得的转录组信息为进一步验证烟青虫的基因功能、阐释抗药机理奠定分子基础。
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关键词
烟青虫
脂肪体
血细胞
转录组
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Keywords
Helicoverpa assulta
fat body
hemocyte
transcriptome
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分类号
S852.65
[农业科学—基础兽医学]
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