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甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析
1
作者 买热拜克·木哈买提汉 赛尔兰·贾纳尔别克 +1 位作者 韦志强 王超楠 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第3期27-36,共10页
硫酸盐转运蛋白(SULTR)作为主动转运硫酸盐时需要的载体蛋白,是植物负责硫酸盐吸收和转运的关键蛋白。以甜瓜基因组数据和转录组测序数据为基础,利用生物信息学方法,对甜瓜CmSULTR基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、染色体位置、亚... 硫酸盐转运蛋白(SULTR)作为主动转运硫酸盐时需要的载体蛋白,是植物负责硫酸盐吸收和转运的关键蛋白。以甜瓜基因组数据和转录组测序数据为基础,利用生物信息学方法,对甜瓜CmSULTR基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、染色体位置、亚细胞定位、保守基序、顺式作用元件、基因结构、跨膜结构及表达模式进行了分析,在感硫材料和耐硫材料中进行qRT-PCR验证及分析。结果表明,在甜瓜中共鉴定到11个SULTR基因家族成员,10个都具有完整的保守基序,具有高度保守性。基因结构中具有8~12个跨膜结构,顺式作用元件包含大量激素响应元件、抗逆响应元件。硫胁迫处理后,CmSULTR8、CmSULTR11在感硫材料M446中的相对表达量显著高于耐硫材料M531,推测CmSULTR8、CmSULTR11可能通过负调控参与甜瓜的耐硫过程。CmSULTR基因家族成员在不同组织中的表达模式具有差异性,协同调控了甜瓜硫酸盐的吸收和转运,其中CmSULTR1、CmSULTR6、CmSULTR8、CmSULTR11可能是硫酸盐吸收和转运的关键基因。以上结果为后续深入研究SULTR基因家族在甜瓜生长发育和硫酸盐转运中的作用机制提供参考。 展开更多
关键词 甜瓜 硫酸盐转运蛋白(SULTR) 基因家族 生物信息学分析
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