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全外显子测序筛选前列腺癌诊断及预后相关的新的候选基因
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作者 巩幼洁 余娜 +8 位作者 陈晴 杨欣燕 陶司政 沈靖 黄岩 马志厚 高杰 华浩铭 王红群 《临床与实验病理学杂志》 2025年第10期1345-1351,共7页
目的探索新的前列腺癌诊断及预后相关的单核苷酸变异。方法收集21例行前列腺癌根治术且临床资料完整的前列腺癌患者的癌组织蜡块及正常组织蜡块,利用全外显子组测序进行体细胞突变检测,筛选出前列腺癌相关的新突变基因,并进行相关性分... 目的探索新的前列腺癌诊断及预后相关的单核苷酸变异。方法收集21例行前列腺癌根治术且临床资料完整的前列腺癌患者的癌组织蜡块及正常组织蜡块,利用全外显子组测序进行体细胞突变检测,筛选出前列腺癌相关的新突变基因,并进行相关性分析。根据基因筛选结果,在前列腺癌患者的尿液中检测突变基因对应蛋白的含量情况。结果21例前列腺癌患者均出现明显的体细胞突变,突变类型以C>T和G>A为主,体细胞突变数为521个,其中ZSWIM6(5/21)、FOXA1(4/21)、SPTA1(2/21)、FAM47C(2/21)、FLG2(2/21)、PRSS3(2/21)、TP53(2/21)、FLG(2/21)、UBR4(2/21)等27个基因具有较高的突变比例(≥2例),ZSWIM6中发生的突变均为缺失突变,FOXA1中发生的突变为错义突变、缺失突变、缺失插入突变。10例前列腺癌患者尿液中UPF1、SPTA1及IDH1蛋白含量较健康对照组具有明显差异。相关性分析显示FOXA1与UBR4呈正相关(r=0.669,P=0.001),SPTA1与FLG2呈正相关(r=1.000,P<0.001),FAM47C与PRSS3呈正相关(r=1.000,P<0.001),TP53与FLG呈正相关(r=1.000,P<0.001)。ZSWIM6、FOXA1均与生化复发无相关性。SPTA1突变影响无进展生存(progression-free survival,PFS)[(66.0±0)个月vs(30.0±7.8)个月,P=0.008]。FAM47C与PFS具有相关性[(66.0±0)个月vs(19.0±0)个月,P<0.001]。ZNF676与PFS具有相关性[(66.0±0)个月vs(26.0±5.0)个月,P=0.008]。FLG2与PFS具有相关性[(66.0±0)个月vs(30.0±7.8)个月,P=0.008]。PRSS3与PFS具有相关性[(66.0±0)个月vs(19.0±0)个月,P<0.001]。结论21例前列腺癌患者均出现体细胞突变,其中以ZSWIM6(5/21)、FOXA1(4/21)突变出现较多。SPTA1、FAM47C、ZNF676、FLG2及PRSS3等基因可能与预后相关。 展开更多
关键词 前列腺肿瘤 全外显子测序 ZSWIM6 FOXA1 体细胞突变
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