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基于数据挖掘和网络药理学研究慢性阻塞性肺疾病的中药用药规律及机制 被引量:13
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作者 吴凡 李泽庚 +4 位作者 董昌武 朱洁 王小乐 高雅婷 杨勤军 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期2869-2873,共5页
目的基于数据挖掘分析中药治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的用药规律,应用网络药理学研究高频药对治疗COPD的机制。方法检索中国知网、万方数据库、维普数据库及中国生物医学文献数据库,构建方药数据库,规范中药命名后,通过频次分析、关联... 目的基于数据挖掘分析中药治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的用药规律,应用网络药理学研究高频药对治疗COPD的机制。方法检索中国知网、万方数据库、维普数据库及中国生物医学文献数据库,构建方药数据库,规范中药命名后,通过频次分析、关联规则、复杂网络、系统聚类及主成分因子分析数据,运用TCMSP检索高频药对化合物及治疗靶点,与Genecards和OMIM数据库筛选出COPD的靶点相映射并取交集,STRING11.0数据库构建可视化PPI网络,对关键靶点用R语言进行KEGG通路富集分析。结果共纳入处方439例,涉及药物332味,归18类,补虚药、化痰止咳平喘药、解表药、清热药及利水渗湿药排名前五。用药频次≥50次共39味,二项关联20条,三项关联22条,聚类分析组合12个,因子分析公因子15个。高频药对半夏-陈皮治疗COPD核心靶点10个,重要通路20条。结论中药治疗COPD多以痰、热、虚、瘀为主要病机。急性发作期常由外邪诱发,易化热夹瘀,治疗多以清热化痰祛瘀为法,并透散表邪;稳定期以肺脾肾三脏亏虚为主,尤为重视培土生金和金水相生原则。 展开更多
关键词 中药 慢性阻塞性肺疾病 用药规律 机制 数据挖掘 网络药理学
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芪白平肺胶囊调控慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关免疫细胞群分子机制的生物信息学分析 被引量:2
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作者 王小乐 高雅婷 +6 位作者 朱洁 张星星 吴凡 杨勤军 吴迪 童佳兵 李泽庚 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期961-966,共6页
目的通过分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者肺组织单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据,并联合芪白平肺胶囊网络药理学,探讨芪白平肺胶囊调控COPD相关免疫细胞群及其可能的机制。方法下载基因表达数据集(GEO)中COPD患者肺组织scRNA-seq数据... 目的通过分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者肺组织单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据,并联合芪白平肺胶囊网络药理学,探讨芪白平肺胶囊调控COPD相关免疫细胞群及其可能的机制。方法下载基因表达数据集(GEO)中COPD患者肺组织scRNA-seq数据用于挖掘COPD免疫细胞群及其差异表达RNA;并基于中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)获取芪白平肺胶囊的主要活性成分及其靶基因。通过COPD免疫细胞群的差异表达RNA与芪白平肺胶囊的靶基因映射,构建芪白平肺胶囊的“活性成分-免疫细胞群-靶基因”网络,并经基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、蛋白质相互作用(PPI)分析靶基因的分子作用机制。结果芪白平肺胶囊中槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、刺芒柄花素(formononetin)等主要的12个活性成分靶向COPD巨噬细胞、肺泡巨噬细胞、T细胞等多个免疫细胞群及过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、应激活化蛋白激酶(JUN)、血红素加氧酶1(HMOX1)、低氧诱导因子1α(HIF1A)等基因,且这些基因主要富集于白细胞介素17(IL-17)信号通路、核因子κB(NF-κB)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等。结论芪白平肺胶囊可能靶向多种免疫细胞,干预炎症免疫相关通路,调控COPD的炎症免疫反应。 展开更多
关键词 芪白平肺胶囊 慢性阻塞性肺疾病(COPD) 单细胞转录组测序 免疫细胞 中医
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慢性阻塞性肺疾病舌苔菌群微生态的相关研究 被引量:4
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作者 李清仪 朱洁 +4 位作者 王小乐 高雅婷 李泽庚 吴迪 张星星 《辽宁中医杂志》 CAS 2022年第4期1-4,221-222,共6页
目的探讨慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)稳定期患者舌苔微生态多样性的特点。方法对30例COPD稳定期患者和10例健康人舌苔标本进行16S rRNA高通量测序,并对结果进行alpha多样性分析、beta多样性分析和线... 目的探讨慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)稳定期患者舌苔微生态多样性的特点。方法对30例COPD稳定期患者和10例健康人舌苔标本进行16S rRNA高通量测序,并对结果进行alpha多样性分析、beta多样性分析和线性判别分析效应量(LEfSe)分析以寻找COPD稳定期患者舌苔微生态特点。结果在OTU水平上,PLS-DA分析显示COPD组和健康对照组的舌苔菌群组成具有显著性差异;颗粒二氧化碳噬纤维菌(capnocytophaga granulosa)可能成为COPD稳定期患者的舌苔标志菌,二氧化碳噬纤维菌属(Capnocytophaga)与患者CAT评分的分值呈正相关关系。弯曲杆菌属(Campylobacter)的丰度与COPD气流受限程度相关。结论COPD患者舌苔微生态失调与COPD疾病的发生发展有一定的相关性,二氧化碳噬纤维菌属和弯曲杆菌属可能是COPD的标志菌群。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 舌苔 微生态 菌群 肺病
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益肺健脾方降低香烟烟雾诱导的人支气管上皮细胞的炎性损伤和黏液高分泌:基于抑制TLR4/NF-κB信号通路 被引量:13
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作者 徐晨 李春颖 王胜 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期507-515,共9页
目的探究益肺健脾方通过TLR4/NF-κB信号通路改善人支气管上皮细胞(16HBE)炎性损伤和黏液高分泌的机制。方法将40只SD大鼠随机分为两组:空白血清组、含药血清组,20只/组,对空白血清组和含药血清组大鼠分别以生理盐水、益肺健脾方药液灌... 目的探究益肺健脾方通过TLR4/NF-κB信号通路改善人支气管上皮细胞(16HBE)炎性损伤和黏液高分泌的机制。方法将40只SD大鼠随机分为两组:空白血清组、含药血清组,20只/组,对空白血清组和含药血清组大鼠分别以生理盐水、益肺健脾方药液灌胃,末次灌胃后对大鼠进行麻醉并于无菌状态下腹主动脉采血收集益肺健脾方含药血清;自制气体抽吸泵制备香烟烟雾溶液(CSE),刺激人支气管上皮细胞16HBE,并用CCK8法筛选CSE和益肺健脾方含药血清干预慢性阻塞性肺疾病细胞模型的最佳作用浓度以及最佳作用时间;qRT-PCR法检测TLR4基因沉默和过表达对16HBE中TLR4mRNA的表达;Westernblot法和qRT-PCR法检测益肺健脾方对TLR4沉默和过表达后TLR4、NF-κB、MUC5AC、MUC7、MUC8mRNA和蛋白表达的影响;ELISA法检测细胞炎症因子TNF-α、IL-1β、IL-6和IL-8的表达。结果选择20%含药血清作用24h作为益肺健脾方最佳给药浓度及给药时间;与CSE组相比,CSE+含药血清组的TLR4、NF-κB、MUC5AC、MUC7、MUC8mRNA及相应蛋白的表达显著降低;与CSE+含药血清组相比,CSE+siRNA-TLR4+含药血清组的TLR4、NF-κB、MUC5AC、MUC7、MUC8mRNA及相应蛋白的表达降低;与CSE+Lv-TLR4组相比,CSE+Lv-TLR4+含药血清组的TLR4、NF-κB、MUC5AC、MUC7、MUC8mRNA及相应蛋白的表达显著降低;与CSE+含药血清组相比,CSE+Lv-TLR4+含药血清组的TLR4、NF-κB、MUC5AC、MUC7、MUC8mRNA及相应蛋白的表达显著升高(P<0.05);与CSE组相比,CSE+含药血清组的TNF-α、IL-1β、IL-6和IL-8炎症因子水平下降(P<0.05);结论益肺健脾方可干预TLR4/NF-κB信号通路,作用于COPD细胞模型,降低MUC的分泌抑制COPD气道炎症和黏液高分泌,降低与NF-κB信号通路相关的TNF-α、IL-1β、IL-6和IL-8炎症因子的表达,其机制可能与TLR4/NF-κB信号通路的基因及MUC蛋白表达有关。 展开更多
关键词 益肺健脾方 慢性阻塞性肺疾病 气道炎症 黏液高分泌 TLR4/NF-κB
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COPD患者免疫细胞亚群特征及六味补气胶囊干预的分子机制 被引量:17
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作者 王小乐 朱洁 +7 位作者 高雅婷 吴凡 杨勤军 童佳兵 张星星 王传博 吴迪 李泽庚 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1492-1500,共9页
目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)肺组织免疫细胞亚群特征及六味补气胶囊改善其免疫炎症失衡的机制。方法基于基因表达汇编(GEO)数据库,下载COPD相关研究的单细胞测序数据,使用R软件中Seurat包分析获取COPD免疫细胞亚群特征,以构建COPD... 目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)肺组织免疫细胞亚群特征及六味补气胶囊改善其免疫炎症失衡的机制。方法基于基因表达汇编(GEO)数据库,下载COPD相关研究的单细胞测序数据,使用R软件中Seurat包分析获取COPD免疫细胞亚群特征,以构建COPD的各免疫细胞亚群的“免疫细胞亚群-差异基因”关系;通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)平台获取六味补气胶囊的主要活性成分及靶基因,将靶基因映射到COPD各免疫细胞亚群的差异基因,构建“六味补气胶囊-免疫细胞亚群-靶基因”网络,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,研究该网络中靶基因的显著富集的通路,并获取显著富集通路间关联的靶基因。经六味补气胶囊干预COPD大鼠模型实验研究,分析其对COPD大鼠的肺功能和肺组织病理改变,血清IL1B、NF-κB、TNF-α的表达情况,及肺组织IKBα、JNK、c-JUN、c-FOS的蛋白表达。结果COPD和正常对照中均存在巨噬细胞、肺泡巨噬细胞等18种免疫相关细胞亚群。与正常对照相比,COPD患者肺组织中巨噬细胞、cDC1、pDC、肥大细胞、T细胞、成熟树突状细胞占总细胞数比的差异均具有统计学意义(P<0.05)。六味补气胶囊靶向多个免疫细胞亚群,且靶基因主要富集于脂质和动脉粥样硬化、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路、TNF信号通路等免疫炎症相关信号通路,其中CXCL8、IL1B、JUN、NFKBIA、MAPK8、FOS等可能是显著富集通路间的关联基因,动物实验研究表明六味补气胶囊可有效改善COPD大鼠肺功能和肺组织病理改变,并降低COPD大鼠血清IL1B、TNF-α、NF-κB(P<0.05)和肺组织肺组织JNK、c-JUN、c-FOS(P<0.01)蛋白的表达,升高肺组织IκBα蛋白表达(P<0.01)。结论六味补气胶囊可能通过靶向COPD患者肺组织中多种免疫细胞亚群发挥免疫调节作用。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 六味补气胶囊 免疫炎症 单细胞转录组测序
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