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泥鳅线粒体DNA控制区结构分析及遗传多样性研究
被引量：
9
1
作者
荣朝振
祖国掌
+2 位作者
胡建华
孙守旗
孙棠丽
《南方水产科学》
CAS
2011年第5期55-62,共8页
采用PCR和DNA测序技术对4个泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)群体的线粒体DNA控制区序列进行比较,研究其遗传多样性和控制区的结构。结果显示,用于分析的线粒体DNA控制区片段序列为918～920 bp。32个序列中共发现了56个多态位点,其中3...
采用PCR和DNA测序技术对4个泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)群体的线粒体DNA控制区序列进行比较,研究其遗传多样性和控制区的结构。结果显示,用于分析的线粒体DNA控制区片段序列为918～920 bp。32个序列中共发现了56个多态位点,其中32个转换位点,19个颠换位点,5个转换与颠换同时存在的位点,定义了32种单倍型。同时对控制区结构进行分析,识别了其终止序列区(ETAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的关键序列。4个地理群体的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.992、0.012和10.698。群体间的平均Kimura双参数遗传距离(Kimura 2-parameter distance,K2-P)、遗传分化指数(Fst)、基因交流值(Nm)和分子方差分析(AMOVA)均表明4个泥鳅群体具有较高的遗传分化,基因交流贫乏。利用核苷酸序列构建的NJ分子系统树揭示4个群体分为2个谱系,除范县群体外,其余各群体间相互交叉聚集。
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关键词
泥鳅
线粒体DNA控制区
遗传多样性
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职称材料
3个群体泥鳅mtDNA D-loop的PCR-RFLP分析
被引量：
1
2
作者
荣朝振
祖国掌
+2 位作者
胡建华
孙守旗
孙棠丽
《水生态学杂志》
北大核心
2011年第4期91-96,共6页
采用PCR-RFLP方法,对采自安徽怀远、河南范县及安徽舒城的3个群体共112尾泥鳅(Misgurnus anguilli-caudatus)线粒体DNA(mtDNA)的D-loop区段进行PCR扩增,使用11种核酸限制性内切酶进行酶切。结果显示,在11种内切酶中,8种有酶切位点,4种...
采用PCR-RFLP方法,对采自安徽怀远、河南范县及安徽舒城的3个群体共112尾泥鳅(Misgurnus anguilli-caudatus)线粒体DNA(mtDNA)的D-loop区段进行PCR扩增,使用11种核酸限制性内切酶进行酶切。结果显示,在11种内切酶中,8种有酶切位点,4种存在个体间变异,共产生7种单倍型。怀远、范县和舒城群体的核苷酸多样性指数为0.0033、0.0083、0.0011,单倍型多样性指数分别为0.6048、0.8370、0.2344。范县与怀远、舒城群体间的Rogers遗传距离分别为0.3456和0.6847,怀远和舒城群体间的Rogers遗传距离为0.6326。SspⅠ的酶切类型C组成的单倍型在舒城群体中占87.5%,而在范县群体中为0;同时发现,SspⅠ的酶切类型C、D和XspⅠ的酶切类型B分别组成的单倍型仅在范县群体中存在。
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关键词
泥鳅
PCR-RFLP
MTDNA
D-LOOP
核苷酸多样性
单倍型多样性
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职称材料
提高鳜鱼幼苗成活率的有效措施
3
作者
孙守旗
宫贞君
孙棠丽
《水产养殖》
CAS
2011年第9期18-19,共2页
鳜鱼从幼苗期开始,到全长4cm以上可以下塘养殖这一期间,最容易死亡,出现这种状况的主要原因有：先天性发育不足、繁殖水温不适应、孵化操作不慎、饵料适口性差、病虫害等。根据多年生产经验,总结出以下几项提高鳜鱼苗成活率有效措施,供...
鳜鱼从幼苗期开始,到全长4cm以上可以下塘养殖这一期间,最容易死亡,出现这种状况的主要原因有：先天性发育不足、繁殖水温不适应、孵化操作不慎、饵料适口性差、病虫害等。根据多年生产经验,总结出以下几项提高鳜鱼苗成活率有效措施,供鳜鱼苗种生产单位参考。
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关键词
幼苗成活率
鳜鱼
鱼苗成活率
生产经验
生产单位
幼苗期
先天性
适口性
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职称材料
题名
泥鳅线粒体DNA控制区结构分析及遗传多样性研究
被引量：
9
1
作者
荣朝振
祖国掌
胡建华
孙守旗
孙棠丽
机构
安徽
农业大学动物
科技
学院
安徽省
怀远县
水产技术推广中心
安徽省怀远县渔业科技发展有限责任公司
出处
《南方水产科学》
CAS
2011年第5期55-62,共8页
基金
安徽省科技攻关计划项目(07010302147)
文摘
采用PCR和DNA测序技术对4个泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)群体的线粒体DNA控制区序列进行比较,研究其遗传多样性和控制区的结构。结果显示,用于分析的线粒体DNA控制区片段序列为918～920 bp。32个序列中共发现了56个多态位点,其中32个转换位点,19个颠换位点,5个转换与颠换同时存在的位点,定义了32种单倍型。同时对控制区结构进行分析,识别了其终止序列区(ETAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的关键序列。4个地理群体的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.992、0.012和10.698。群体间的平均Kimura双参数遗传距离(Kimura 2-parameter distance,K2-P)、遗传分化指数(Fst)、基因交流值(Nm)和分子方差分析(AMOVA)均表明4个泥鳅群体具有较高的遗传分化,基因交流贫乏。利用核苷酸序列构建的NJ分子系统树揭示4个群体分为2个谱系,除范县群体外,其余各群体间相互交叉聚集。
关键词
泥鳅
线粒体DNA控制区
遗传多样性
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
mitochondrial DNA control region
genetic diversity
分类号
Q523.8 [生物学—生物化学]
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
3个群体泥鳅mtDNA D-loop的PCR-RFLP分析
被引量：
1
2
作者
荣朝振
祖国掌
胡建华
孙守旗
孙棠丽
机构
安徽
农业大学动物
科技
学院
安徽省
怀远县
水产技术推广中心
安徽省怀远县渔业科技发展有限责任公司
出处
《水生态学杂志》
北大核心
2011年第4期91-96,共6页
基金
安徽省2007年度科技攻关计划项目(07010302147)
文摘
采用PCR-RFLP方法,对采自安徽怀远、河南范县及安徽舒城的3个群体共112尾泥鳅(Misgurnus anguilli-caudatus)线粒体DNA(mtDNA)的D-loop区段进行PCR扩增,使用11种核酸限制性内切酶进行酶切。结果显示,在11种内切酶中,8种有酶切位点,4种存在个体间变异,共产生7种单倍型。怀远、范县和舒城群体的核苷酸多样性指数为0.0033、0.0083、0.0011,单倍型多样性指数分别为0.6048、0.8370、0.2344。范县与怀远、舒城群体间的Rogers遗传距离分别为0.3456和0.6847,怀远和舒城群体间的Rogers遗传距离为0.6326。SspⅠ的酶切类型C组成的单倍型在舒城群体中占87.5%,而在范县群体中为0;同时发现,SspⅠ的酶切类型C、D和XspⅠ的酶切类型B分别组成的单倍型仅在范县群体中存在。
关键词
泥鳅
PCR-RFLP
MTDNA
D-LOOP
核苷酸多样性
单倍型多样性
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
PCR-RFLP
mtDNA D-loop
nucleotide diversity
haplotype diversity
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
提高鳜鱼幼苗成活率的有效措施
3
作者
孙守旗
宫贞君
孙棠丽
机构
安徽
农业大学
安徽省
怀远县
水产技术推广中心
安徽省怀远县渔业科技发展有限责任公司
出处
《水产养殖》
CAS
2011年第9期18-19,共2页
文摘
鳜鱼从幼苗期开始,到全长4cm以上可以下塘养殖这一期间,最容易死亡,出现这种状况的主要原因有：先天性发育不足、繁殖水温不适应、孵化操作不慎、饵料适口性差、病虫害等。根据多年生产经验,总结出以下几项提高鳜鱼苗成活率有效措施,供鳜鱼苗种生产单位参考。
关键词
幼苗成活率
鳜鱼
鱼苗成活率
生产经验
生产单位
幼苗期
先天性
适口性
分类号
S965 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
泥鳅线粒体DNA控制区结构分析及遗传多样性研究
荣朝振
祖国掌
胡建华
孙守旗
孙棠丽
《南方水产科学》
CAS
2011
9
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下载PDF
职称材料
2
3个群体泥鳅mtDNA D-loop的PCR-RFLP分析
荣朝振
祖国掌
胡建华
孙守旗
孙棠丽
《水生态学杂志》
北大核心
2011
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
提高鳜鱼幼苗成活率的有效措施
孙守旗
宫贞君
孙棠丽
《水产养殖》
CAS
2011
0
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职称材料
已选择
0
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