-
题名水芹SSR分子标记开发与遗传多样性分析
被引量：1
- 1
-
-
作者
邢啸林
陈丹
况勇
徐文娟
黄然
甘德芳
-
机构
安徽农业大学园艺学院
安徽正泽生态农业科技发展有限公司
-
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第7期1285-1296,共12页
-
基金
安徽省良种攻关项目(22805003)
安徽省自然科学研究重点项目(2023AH051056)
安徽省自然科学基金项目(2008085MC80)。
-
文摘
水芹是伞形科水芹属多年生草本植物,是一种重要的药食两用蔬菜作物。在中国,水芹的种植区域十分广泛,然而目前对其种质资源的鉴定、培育及遗传信息的研究较少。本研究利用溧阳白芹基因组开发水芹简单重复序列(SSR)分子标记,分析55份水芹的遗传多样性并用非加权组平均法(UPGMA)构建系统进化树,同时用SSR扩增条带数据构建DNA指纹图谱。结果显示,共鉴定到325699个SSR位点,其中单核苷酸SSR重复单元、二核苷酸SSR重复单元、三核苷酸SSR重复单元、四核苷酸SSR重复单元、五核苷酸SSR重复单元、六核苷酸SSR重复单元的出现频率分别为33.94%、54.62%、9.31%、1.66%、0.17%、0.29%,其中二核苷酸SSR重复单元数最多,有177887个,且A/T(占比为29.98%)和AT/AT(占比为35.70%)是较丰富的重复类型。UPGMA分析结果表明,33对高多态性引物[多态信息含量(PIC)>0.25]可将55份水芹材料分为4组。利用筛选出的4对引物(Oj-084、Oj-110、Oj-112、Oj-156)可以将55份水芹材料完全区分开,并且可构建指纹图谱。研究结果可为水芹种质资源鉴定、保护及分子遗传育种提供有力依据。
-
关键词
水芹
简单重复序列(SSR)分子标记
聚类分析
遗传多样性
-
Keywords
dropwort
simple sequence repeat(SSR)molecular markers
cluster analysis
genetic diversity
-
分类号
S645.901
[农业科学—蔬菜学]
-
