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铜绿假单胞菌噬菌体vB_PaS_IME307的生物学特性研究及全基因组分析
1
作者
王灿
刘慧莹
+4 位作者
高明明
米丽媛
喻鑫婷
米志强
柏长青
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第19期2045-2056,共12页
目的以实验室保存菌株Pa175为宿主菌,从医院污水中分离得到1株铜绿假单胞菌噬菌体,研究其生物学特性及全基因组学特征。方法利用双层平板法、噬斑法分离并鉴定噬菌体;PEG8000浓缩NaCl沉淀法纯化噬菌体;蔗糖梯度离心进一步纯化噬菌体,经...
目的以实验室保存菌株Pa175为宿主菌,从医院污水中分离得到1株铜绿假单胞菌噬菌体,研究其生物学特性及全基因组学特征。方法利用双层平板法、噬斑法分离并鉴定噬菌体;PEG8000浓缩NaCl沉淀法纯化噬菌体;蔗糖梯度离心进一步纯化噬菌体,经磷钨酸负染染色后,使用透射电子显微镜观察其形态;蛋白酶K/SDS法提取噬菌体DNA,对提取的核酸进行全基因组测序和生物信息学分析。结果得到1株裂解性铜绿假单胞菌噬菌体vB_PaS_IME307,该噬菌体可以形成透明且有晕环的噬菌斑,全基因组大小为51545 bp。透射电镜结果显示vB_PaS_IME307的头部呈正二十面体形状,直径(66±2)nm,尾长(116±2)nm;进化树分析发现该噬菌体为Mccleskeyvirinae病毒属,长尾噬菌体科(Siphoviridae)。生物学特性研究发现:vB_PaS_IME307在pH=4.0~11.0、60℃以下能够保持较高活性,感染周期约为60 min,其中包括10 min潜伏期和50 min暴发期,其暴发量为150 PFU/cell。结论噬菌体vB_PaS_IME307具有宿主特异性,对温度和pH具有较好的耐受能力,具有防治铜绿假单胞菌细菌感染的潜力。
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关键词
铜绿假单胞菌
噬菌体
生物学特性
基因组学分析
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题名
铜绿假单胞菌噬菌体vB_PaS_IME307的生物学特性研究及全基因组分析
1
作者
王灿
刘慧莹
高明明
米丽媛
喻鑫婷
米志强
柏长青
机构
安徽医科大学附属阜阳医院呼吸内科
解放军总
医院
第五医学中心
呼吸
与危重症医学科
军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所
深圳
大学
总
医院
呼吸
与危重症医学科
出处
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第19期2045-2056,共12页
基金
安徽省自然科学基金青年项目(2108085QH310)
安徽省卫生健康委科研项目(AHWJ2021b057)
安徽医科大学校科研基金项目(2020xkj060)。
文摘
目的以实验室保存菌株Pa175为宿主菌,从医院污水中分离得到1株铜绿假单胞菌噬菌体,研究其生物学特性及全基因组学特征。方法利用双层平板法、噬斑法分离并鉴定噬菌体;PEG8000浓缩NaCl沉淀法纯化噬菌体;蔗糖梯度离心进一步纯化噬菌体,经磷钨酸负染染色后,使用透射电子显微镜观察其形态;蛋白酶K/SDS法提取噬菌体DNA,对提取的核酸进行全基因组测序和生物信息学分析。结果得到1株裂解性铜绿假单胞菌噬菌体vB_PaS_IME307,该噬菌体可以形成透明且有晕环的噬菌斑,全基因组大小为51545 bp。透射电镜结果显示vB_PaS_IME307的头部呈正二十面体形状,直径(66±2)nm,尾长(116±2)nm;进化树分析发现该噬菌体为Mccleskeyvirinae病毒属,长尾噬菌体科(Siphoviridae)。生物学特性研究发现:vB_PaS_IME307在pH=4.0~11.0、60℃以下能够保持较高活性,感染周期约为60 min,其中包括10 min潜伏期和50 min暴发期,其暴发量为150 PFU/cell。结论噬菌体vB_PaS_IME307具有宿主特异性,对温度和pH具有较好的耐受能力,具有防治铜绿假单胞菌细菌感染的潜力。
关键词
铜绿假单胞菌
噬菌体
生物学特性
基因组学分析
Keywords
Pseudomonas aeruginosa
phage
biological characteristics
genomic analysis
分类号
Q393.48 [生物学—遗传学]
R378.991 [医药卫生—病原生物学]
R394.2 [医药卫生—医学遗传学]
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1
铜绿假单胞菌噬菌体vB_PaS_IME307的生物学特性研究及全基因组分析
王灿
刘慧莹
高明明
米丽媛
喻鑫婷
米志强
柏长青
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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