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基于单细胞核转录组测序的多发性大动脉炎外周血单个核细胞图谱分析
1
作者
何川
丁洋
万圣云
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第6期1068-1075,共8页
目的基于单细胞核转录组测序(snRNA-seq)技术描绘多发性大动脉炎(TAK)外周血单个核细胞(PBMC)基因和功能的异质性改变,阐述TAK可能的免疫机制。方法收集确诊为TAK患者的PBMC共6例为疾病组(TAK组),同期就诊的健康人群6例PBMC为正常组(NC...
目的基于单细胞核转录组测序(snRNA-seq)技术描绘多发性大动脉炎(TAK)外周血单个核细胞(PBMC)基因和功能的异质性改变,阐述TAK可能的免疫机制。方法收集确诊为TAK患者的PBMC共6例为疾病组(TAK组),同期就诊的健康人群6例PBMC为正常组(NC组)。基于snRNA-seq工作流程建库测序,下机数据采用R 3.6.2软件进行主成分分析(PCA)及t-分布随机邻域嵌入(tSNE)分析等手段对两组PBMC样本池的单个核细胞的基因表达进行检测。结果TAK患者PBMC的免疫细胞的相对比例和含量都发生了改变;高克隆TCR可高度同源性匹配整合素beta-3的氨基酸序列;T细胞介导的干扰素γ和TNFα通路显著上调;TNFRSF13B+记忆B细胞比例明显升高;所有细胞类型中单核细胞所形成的的配体受体相互作用始终最多。结论TAK的发生发展过程中PBMC参与了复杂的调节,多种免疫炎症因子异常表达,其中单核细胞在PBMC的相互作用中占据了重要地位。
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关键词
单细胞核转录组测序
多发性大动脉炎
外周血单个核细胞
免疫
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职称材料
题名
基于单细胞核转录组测序的多发性大动脉炎外周血单个核细胞图谱分析
1
作者
何川
丁洋
万圣云
机构
安徽医科大学第二附属医院血管与胃肠外科
皖南医学院
第二
附属
医院
介入科
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第6期1068-1075,共8页
基金
安徽高校自然科学研究项目重点项目(编号:2022AHO50764)
安徽医科大学校科研基金项目临床项目(编号:2022xkj187)。
文摘
目的基于单细胞核转录组测序(snRNA-seq)技术描绘多发性大动脉炎(TAK)外周血单个核细胞(PBMC)基因和功能的异质性改变,阐述TAK可能的免疫机制。方法收集确诊为TAK患者的PBMC共6例为疾病组(TAK组),同期就诊的健康人群6例PBMC为正常组(NC组)。基于snRNA-seq工作流程建库测序,下机数据采用R 3.6.2软件进行主成分分析(PCA)及t-分布随机邻域嵌入(tSNE)分析等手段对两组PBMC样本池的单个核细胞的基因表达进行检测。结果TAK患者PBMC的免疫细胞的相对比例和含量都发生了改变;高克隆TCR可高度同源性匹配整合素beta-3的氨基酸序列;T细胞介导的干扰素γ和TNFα通路显著上调;TNFRSF13B+记忆B细胞比例明显升高;所有细胞类型中单核细胞所形成的的配体受体相互作用始终最多。结论TAK的发生发展过程中PBMC参与了复杂的调节,多种免疫炎症因子异常表达,其中单核细胞在PBMC的相互作用中占据了重要地位。
关键词
单细胞核转录组测序
多发性大动脉炎
外周血单个核细胞
免疫
Keywords
single nuclei RNA sequencing
takayasu arteritis
peripheral blood mononuclear cell
immunity
分类号
R654.4 [医药卫生—外科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于单细胞核转录组测序的多发性大动脉炎外周血单个核细胞图谱分析
何川
丁洋
万圣云
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2024
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