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安徽省人乳头瘤病毒16型全基因组的结构特征
1
作者
孙云峰
江彤
陈传俊
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2014年第10期1456-1460,共5页
目的克隆安徽省人乳头状瘤病毒16型(HPV16)全基因组,分析HPV16全基因组序列并了解其结构特征。方法收集5例安徽省宫颈癌病理组织标本并提取总DNA,设计4对特异性引物分段克隆HPV16全基因组,测序后进行序列拼接及核苷酸序列分析。结果检测...
目的克隆安徽省人乳头状瘤病毒16型(HPV16)全基因组,分析HPV16全基因组序列并了解其结构特征。方法收集5例安徽省宫颈癌病理组织标本并提取总DNA,设计4对特异性引物分段克隆HPV16全基因组,测序后进行序列拼接及核苷酸序列分析。结果检测到1个宫颈癌病理样本中含有HPV16并获得全基因组序列,序列全长7 906 nts(GenBank登录号:KC935953)。序列比对显示,安徽HPV16(HPV16-Anhui)与泰国HPV16和日本HPV16的全基因组核苷酸序列相似性最高,达99.5%。系统关系树分析显示,HPV16-Anhui与其他7个HPV16型聚成1个单独的分支。结论获得安徽省首例HPV16全基因组核苷酸序列,HPV16-Anhui与不同地区HPV16亲缘关系均较近且基因组变异性较小。
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关键词
人乳头状瘤病毒16型
全基因组
克隆
序列分析
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题名
安徽省人乳头瘤病毒16型全基因组的结构特征
1
作者
孙云峰
江彤
陈传俊
机构
安徽医科大学
第三
附属
医院
(
合肥市第一人民医院
)
口腔
颌面
外科
安徽
农业
大学
植物保护学院
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2014年第10期1456-1460,共5页
基金
国家自然科学基金(编号:81172574)
文摘
目的克隆安徽省人乳头状瘤病毒16型(HPV16)全基因组,分析HPV16全基因组序列并了解其结构特征。方法收集5例安徽省宫颈癌病理组织标本并提取总DNA,设计4对特异性引物分段克隆HPV16全基因组,测序后进行序列拼接及核苷酸序列分析。结果检测到1个宫颈癌病理样本中含有HPV16并获得全基因组序列,序列全长7 906 nts(GenBank登录号:KC935953)。序列比对显示,安徽HPV16(HPV16-Anhui)与泰国HPV16和日本HPV16的全基因组核苷酸序列相似性最高,达99.5%。系统关系树分析显示,HPV16-Anhui与其他7个HPV16型聚成1个单独的分支。结论获得安徽省首例HPV16全基因组核苷酸序列,HPV16-Anhui与不同地区HPV16亲缘关系均较近且基因组变异性较小。
关键词
人乳头状瘤病毒16型
全基因组
克隆
序列分析
Keywords
human papillomavirus type 16
genome
clone
sequence analysis
分类号
R730.261 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
安徽省人乳头瘤病毒16型全基因组的结构特征
孙云峰
江彤
陈传俊
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2014
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