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题名苜蓿全基因组WRKY转录因子基因的分析
被引量：31
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作者
江腾
林勇祥
刘雪
江海洋
朱苏文
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机构
安徽农业大学生命科学学院安徽省作物生物学重点实验室
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出处
《草业学报》
CSCD
北大核心
2011年第3期211-218,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(30111309)
安徽省自然科学基金项目(090411023)资助
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文摘
蒺藜苜蓿的基因组较小,遗传转化相对容易,是国际上广泛用于研究豆科植物的模式植物,其全基因组测序已经完成。WRKY转录因子是近年来在植物中发现的N-端含有WRKYGQK高度保守氨基酸序列的新型转录调控因子,调节启动子中含W-box元件的调节基因和(/或)功能基因的表达,从而参与植物的各种防卫反应。本研究以苜蓿基因组序列(Mt2.0)为材料,利用生物信息学方法分析苜蓿全基因组WRKY转录因子基因的数目、种类、系统发生学、保守基序,结果表明,苜蓿中共有28个WRKY基因,其中5个基因含有2个WRKY结构域,共含有33个WRKY结构域,根据其结构域特点可以分为3个大类,同时与水稻WRKY基因进行了比较研究,发现基因数目远少于拟南芥和水稻,同时研究证实苜蓿与水稻WRKY基因的起源和进化关系存在较大差异,显示出苜蓿WRKY进化有其独特的特点,此外分析苜蓿WRKY基因的保守motif共有46个,筛选得到WRKY结构域的5个保守motif。该研究对苜蓿WRKY基因功能的研究及进化具有重要的意义。
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关键词
苜蓿
WRKY
系统发生树
生物信息学
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Keywords
Medicago truncatula
WRKY
phylogenetic tree
bioinformatics
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分类号
S541.9
[农业科学—作物学]
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题名玉米叶绿体铁氧还蛋白1的原核表达及部分性质分析
被引量：1
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作者
冯爱花
陈宗梅
李静
程备久
范军
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机构
安徽农业大学生命科学学院/安徽省作物生物学重点实验室
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出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期62-66,共5页
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基金
转基因生物新品种培育重大专项(No.2009ZX0810-002B)
国家自然科学基金(No.30840018)
安徽省攻关课题(No.0701302137)
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文摘
叶绿体铁氧还蛋白(Fd)通过活性中心的铁硫簇传递还原力,在各种氧化还原途径中起重要作用。本研究中,氨基酸序列比对显示玉米中5种Fd的叶绿体导肽同源性很低,而去除导肽的成熟蛋白氨基酸序列具有很高的同源性。采用RT-PCR技术从玉米幼叶总RNA中克隆了编码成熟Fd1的基因,并分别插入pQE 80和p28SUMO表达载体,转化大肠杆菌BL21(DE3),表达的N端含有组氨酸标签的Fd1(His-Fd1),和含有组氨酸标签的小类泛素修饰蛋白(SUMO)的Fd1(HisSUMO-Fd1),用Ni-NTA层析介质亲和纯化,SDS-PAGE显示纯化的His-Fd1为一条带,亚基分子量约12kD。纯化的HisSUMO-Fd1用专一性蛋白酶Ulp除去HisSUMO,获得纯化的Fd1。紫外可见光谱扫描显示纯化的HisSUMO-Fd1溶液在315nm、415nm和459nm有特异吸收峰,电子顺磁共振波谱分析表明Fd1中存在[2Fe-2S]。SDS-PAGE显示多种玉米幼叶可溶性蛋白被固定化的His-Fd1吸附。
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关键词
铁氧还蛋白(Fd)
Fd1
玉米
重组表达
纯化
铁硫簇
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Keywords
ferredoxin protein
Fd1
maize（Zea mays）
prokaryotic expression
purification
[2Fe-2S]cluster
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分类号
S513
[农业科学—作物学]
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