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盐和干旱胁迫下杨树新内参基因的筛选
被引量：
6
1
作者
储文渊
王玉娇
+3 位作者
朱东悦
陈竹
严涵薇
项艳
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期70-79,共10页
【目的】通过杨树的多个基因芯片数据,筛选出在盐和干旱胁迫下能够稳定表达的基因作为杨树的新内参基因,为挖掘出更稳定、更理想的内参基因提供途径。【方法】利用已公布的基因芯片数据库获取不同生长时期、不同逆境处理下的杨树表达数...
【目的】通过杨树的多个基因芯片数据,筛选出在盐和干旱胁迫下能够稳定表达的基因作为杨树的新内参基因,为挖掘出更稳定、更理想的内参基因提供途径。【方法】利用已公布的基因芯片数据库获取不同生长时期、不同逆境处理下的杨树表达数据,将这些数据进行归一化处理,对基因在不同试验条件下表达量的稳定性进行排序。结合基因的功能注释信息,筛选新的内参基因。为进一步验证基因表达的稳定性,以经过NaCl,PEG处理的南林95杨(组培苗)的叶片材料为研究对象,利用实时荧光定量PCR方法,对6个传统内参基因(PtUKN1,PtUBQ,Actin,EF1α,18S rRNA,TUA8)和本研究筛选的6个新内参基因在处理后的0,1,4,8,12,24 h的基因表达量进行分析,再利用geNorm,NormFinder和BestKeeper内参基因分析软件对试验数据进行统计和排序,以比较这12个基因的表达稳定性,从而筛选到合适的内参基因。【结果】筛选6个稳定表达的新内参基因(PtRG1,PtRG2,PtRG3,PtRG4,PtRG5,PtRG6)。将这6个新内参基因与6个传统内参基因进行稳定性比较后发现,在geNorm程序分析中盐胁迫下PtRG2和PtRG3稳定性较好,干旱胁迫下PtRG3和PtRG5的稳定性较好;在NormFinder程序分析中盐胁迫下TUA8和PtRG1稳定性较好,干旱胁迫下PtRG1和PtRG2稳定性较好;在BestKeeper程序分析中盐胁迫下PtRG1和PtRG5稳定性较好,干旱胁迫下PtRG3和PtRG5稳定性较好。综合以上3个内参基因分析软件的结果,PtRG1,PtRG3和PtRG5的稳定性较好。为了进一步验证新内参基因的可靠性,以在NaCl和PEG处理条件下受诱导表达的PtVQ6,PtVQ13和PtVQ37作为对照进行荧光定量PCR试验,发现3个VQ基因的总体表达趋势与使用其他内参基因的结果一致。【结论】本研究鉴定的PtRG1,PtRG3和PtRG5适宜作为杨树在盐和干旱胁迫下的内参基因,这些新内参基因的挖掘对准确校正实时荧光定量PCR试验中目的基因的表达水平具有重要意义。
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关键词
杨树
实时荧光定量PCR
内参基因
盐胁迫
干旱胁迫
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职称材料
盐胁迫对TaERECTA转基因小麦种子萌发和幼苗生理特性的影响
被引量：
2
2
作者
郑甲成
尤依锦
+5 位作者
刘婷
李杰勤
刘言龙
武德功
李金才
詹秋文
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2019年第6期922-927,共6页
【目的】研究TaERECTA基因超表达后对小麦耐盐性的影响。【方法】以转TaERECTA基因小麦为材料,分别在芽期和苗期高盐胁迫,测定种子发芽势、发芽率、发芽指数和相对盐害指数,以及植株枯萎数、幼苗抗氧化酶活性和丙二醛(MDA)含量。【结果...
【目的】研究TaERECTA基因超表达后对小麦耐盐性的影响。【方法】以转TaERECTA基因小麦为材料,分别在芽期和苗期高盐胁迫,测定种子发芽势、发芽率、发芽指数和相对盐害指数,以及植株枯萎数、幼苗抗氧化酶活性和丙二醛(MDA)含量。【结果】芽期盐胁迫下,与野生型(WT)株系相比,TaERECTA转基因小麦种子发芽势、发芽率和发芽指数较高,相对盐害指数较低(P<0.05);苗期盐胁迫下,转基因小麦幼苗平均枯萎数较低,抗氧化酶活性较高,且SOD活性显著高于CK株系(P<0.05)。【结论】一定盐胁迫下,TaERECTA基因超表达可以增强小麦耐盐性,其作用机制可能是TaERECTA激活组织细胞SOD酶活性,其他抗氧化酶相互协同减轻盐胁迫伤害。转基因株系L10相对盐害指数较小,综合抗盐能力较强,可作为下一步深入研究TaERECTA调控小麦耐盐性功能的重要材料。
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关键词
小麦
TaERECTA
耐盐性
种子和幼苗
抗氧化酶
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职称材料
玉米ZmMYC2基因的克隆及功能分析
被引量：
2
3
作者
杜明
陈明超
+1 位作者
方玉
武健东
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期3387-3398,共12页
植物在生长发育过程经常受到病原菌的侵害,严重影响作物产量。MYC2属于bHLH家族转录因子,在茉莉酸介导的信号途径中有着重要的调控作用。在前期工作中,通过对MYC家族进化树分析,找到了与拟南芥同源的玉米基因ZmMYC2。本研究克隆了ZmMYC2...
植物在生长发育过程经常受到病原菌的侵害,严重影响作物产量。MYC2属于bHLH家族转录因子,在茉莉酸介导的信号途径中有着重要的调控作用。在前期工作中,通过对MYC家族进化树分析,找到了与拟南芥同源的玉米基因ZmMYC2。本研究克隆了ZmMYC2,该基因全长2118 bp,编码705个氨基酸残基,其编码蛋白定位于细胞核。RT-qPCR分析表明,ZmMYC2在玉米各个组织中均有表达,但在叶中的表达量最高。诱导表达模式分析表明,ZmMYC2可以响应茉莉酸(jasmonic acid,JA)、水杨酸(salicylic acid,SA)和乙烯(ethylene,ETH)的诱导。在50μmol L–1茉莉酸处理的培养基上,过表达拟南芥的根长显著短于野生型,突变体拟南芥的根长显著长于野生型,回补材料拟南芥根长与野生型无明显差异。对过表达ZmMYC2拟南芥材料接种丁香假单胞杆菌(psedumonas syrinage pv.tomato DC3000,Pst DC3000),野生型、突变体和回补拟南芥相对于过表达表现出较好的状态,推测ZmMYC2降低了拟南芥对病原菌侵害的防御能力。接种前,外源施加茉莉酸激素,过表达拟南芥叶片死亡面积和叶内含菌量均有所减少,茉莉酸激素增强了ZmMYC2对病原菌侵害的抵抗能力。亚细胞定位显示,ZmMYC2为核定位蛋白。酵母双杂交表明ZmMYC2可以与JAZ蛋白中的JAZ1和JAZ3相互作用。茉莉酸、水杨酸和防御基因以及细胞程序性死亡基因的表达量分析表明,ZmMYC2负调控PDF1.2的表达,正调控PR1、MED25、COI1以及细胞程序性死亡基因HIN1的表达。综上所述,ZmMYC2通过与JAZ1和JAZ3相互作用,参与茉莉酸信号的转导作用,降低了拟南芥对病原菌胁迫的抵抗能力。
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关键词
玉米
ZmMYC2
病原菌防御
茉莉酸
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职称材料
题名
盐和干旱胁迫下杨树新内参基因的筛选
被引量：
6
1
作者
储文渊
王玉娇
朱东悦
陈竹
严涵薇
项艳
机构
安徽农业大学
林学与园林学院
安徽农业大学作物抗逆育种与减灾国家地方联合工程实验室
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期70-79,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31370561)
国家科技支撑计划子课题(2015BAD07B070104)
文摘
【目的】通过杨树的多个基因芯片数据,筛选出在盐和干旱胁迫下能够稳定表达的基因作为杨树的新内参基因,为挖掘出更稳定、更理想的内参基因提供途径。【方法】利用已公布的基因芯片数据库获取不同生长时期、不同逆境处理下的杨树表达数据,将这些数据进行归一化处理,对基因在不同试验条件下表达量的稳定性进行排序。结合基因的功能注释信息,筛选新的内参基因。为进一步验证基因表达的稳定性,以经过NaCl,PEG处理的南林95杨(组培苗)的叶片材料为研究对象,利用实时荧光定量PCR方法,对6个传统内参基因(PtUKN1,PtUBQ,Actin,EF1α,18S rRNA,TUA8)和本研究筛选的6个新内参基因在处理后的0,1,4,8,12,24 h的基因表达量进行分析,再利用geNorm,NormFinder和BestKeeper内参基因分析软件对试验数据进行统计和排序,以比较这12个基因的表达稳定性,从而筛选到合适的内参基因。【结果】筛选6个稳定表达的新内参基因(PtRG1,PtRG2,PtRG3,PtRG4,PtRG5,PtRG6)。将这6个新内参基因与6个传统内参基因进行稳定性比较后发现,在geNorm程序分析中盐胁迫下PtRG2和PtRG3稳定性较好,干旱胁迫下PtRG3和PtRG5的稳定性较好;在NormFinder程序分析中盐胁迫下TUA8和PtRG1稳定性较好,干旱胁迫下PtRG1和PtRG2稳定性较好;在BestKeeper程序分析中盐胁迫下PtRG1和PtRG5稳定性较好,干旱胁迫下PtRG3和PtRG5稳定性较好。综合以上3个内参基因分析软件的结果,PtRG1,PtRG3和PtRG5的稳定性较好。为了进一步验证新内参基因的可靠性,以在NaCl和PEG处理条件下受诱导表达的PtVQ6,PtVQ13和PtVQ37作为对照进行荧光定量PCR试验,发现3个VQ基因的总体表达趋势与使用其他内参基因的结果一致。【结论】本研究鉴定的PtRG1,PtRG3和PtRG5适宜作为杨树在盐和干旱胁迫下的内参基因,这些新内参基因的挖掘对准确校正实时荧光定量PCR试验中目的基因的表达水平具有重要意义。
关键词
杨树
实时荧光定量PCR
内参基因
盐胁迫
干旱胁迫
Keywords
poplar
quantitative real-time PCR
reference genes
salt stress
drought stress
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
盐胁迫对TaERECTA转基因小麦种子萌发和幼苗生理特性的影响
被引量：
2
2
作者
郑甲成
尤依锦
刘婷
李杰勤
刘言龙
武德功
李金才
詹秋文
机构
安徽
科技学院农学院
安徽农业大学作物抗逆育种与减灾国家地方联合工程实验室
出处
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2019年第6期922-927,共6页
基金
农业部国家重点研发计划粮食丰产增效科技创新重点专项子课题（2017YFD0301301）
国家级大学生创新创业训练计划项目（201710879068）
+1 种基金
安徽省教育厅高校科学研究项目（KJ2018A0538）
作物抗逆育种与减灾国家地方联合工程实验室开放基金资助项目（NELCOF20190106）
文摘
【目的】研究TaERECTA基因超表达后对小麦耐盐性的影响。【方法】以转TaERECTA基因小麦为材料,分别在芽期和苗期高盐胁迫,测定种子发芽势、发芽率、发芽指数和相对盐害指数,以及植株枯萎数、幼苗抗氧化酶活性和丙二醛(MDA)含量。【结果】芽期盐胁迫下,与野生型(WT)株系相比,TaERECTA转基因小麦种子发芽势、发芽率和发芽指数较高,相对盐害指数较低(P<0.05);苗期盐胁迫下,转基因小麦幼苗平均枯萎数较低,抗氧化酶活性较高,且SOD活性显著高于CK株系(P<0.05)。【结论】一定盐胁迫下,TaERECTA基因超表达可以增强小麦耐盐性,其作用机制可能是TaERECTA激活组织细胞SOD酶活性,其他抗氧化酶相互协同减轻盐胁迫伤害。转基因株系L10相对盐害指数较小,综合抗盐能力较强,可作为下一步深入研究TaERECTA调控小麦耐盐性功能的重要材料。
关键词
小麦
TaERECTA
耐盐性
种子和幼苗
抗氧化酶
Keywords
Triticum aestivum L.
TaERECTA
salt tolerance
seeds and seedlings
antioxidant enzyme
分类号
S512.103.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
玉米ZmMYC2基因的克隆及功能分析
被引量：
2
3
作者
杜明
陈明超
方玉
武健东
机构
上海中科荃银分子
育种
技术有限公司
安徽
荃银高科种业股份有限公司
安徽农业大学
/
作物
抗
逆
育种与
减灾
国家
地方
联合
工程
实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期3387-3398,共12页
基金
荃银高科国家企业技术中心创新项目(2021M002)
安徽省自然科学基金项目(2008085MC70)
安徽省高等学校自然科学研究项目(KJ2021A0172)资助。
文摘
植物在生长发育过程经常受到病原菌的侵害,严重影响作物产量。MYC2属于bHLH家族转录因子,在茉莉酸介导的信号途径中有着重要的调控作用。在前期工作中,通过对MYC家族进化树分析,找到了与拟南芥同源的玉米基因ZmMYC2。本研究克隆了ZmMYC2,该基因全长2118 bp,编码705个氨基酸残基,其编码蛋白定位于细胞核。RT-qPCR分析表明,ZmMYC2在玉米各个组织中均有表达,但在叶中的表达量最高。诱导表达模式分析表明,ZmMYC2可以响应茉莉酸(jasmonic acid,JA)、水杨酸(salicylic acid,SA)和乙烯(ethylene,ETH)的诱导。在50μmol L–1茉莉酸处理的培养基上,过表达拟南芥的根长显著短于野生型,突变体拟南芥的根长显著长于野生型,回补材料拟南芥根长与野生型无明显差异。对过表达ZmMYC2拟南芥材料接种丁香假单胞杆菌(psedumonas syrinage pv.tomato DC3000,Pst DC3000),野生型、突变体和回补拟南芥相对于过表达表现出较好的状态,推测ZmMYC2降低了拟南芥对病原菌侵害的防御能力。接种前,外源施加茉莉酸激素,过表达拟南芥叶片死亡面积和叶内含菌量均有所减少,茉莉酸激素增强了ZmMYC2对病原菌侵害的抵抗能力。亚细胞定位显示,ZmMYC2为核定位蛋白。酵母双杂交表明ZmMYC2可以与JAZ蛋白中的JAZ1和JAZ3相互作用。茉莉酸、水杨酸和防御基因以及细胞程序性死亡基因的表达量分析表明,ZmMYC2负调控PDF1.2的表达,正调控PR1、MED25、COI1以及细胞程序性死亡基因HIN1的表达。综上所述,ZmMYC2通过与JAZ1和JAZ3相互作用,参与茉莉酸信号的转导作用,降低了拟南芥对病原菌胁迫的抵抗能力。
关键词
玉米
ZmMYC2
病原菌防御
茉莉酸
Keywords
maize
ZmMYC2
pathogen defense
jasmonic acid
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
盐和干旱胁迫下杨树新内参基因的筛选
储文渊
王玉娇
朱东悦
陈竹
严涵薇
项艳
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017
6
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职称材料
2
盐胁迫对TaERECTA转基因小麦种子萌发和幼苗生理特性的影响
郑甲成
尤依锦
刘婷
李杰勤
刘言龙
武德功
李金才
詹秋文
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2019
2
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职称材料
3
玉米ZmMYC2基因的克隆及功能分析
杜明
陈明超
方玉
武健东
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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