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基于转录组测序的兔儿伞羽扇豆醇合成途径及关键酶基因研究
被引量：
1
1
作者
张京晶
许景垚
+4 位作者
单婷玉
赵历强
钟欣欣
张帅帅
吴家文
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期32-40,共9页
为解析兔儿伞羽扇豆醇生物合成途径,探究其关键酶基因,研究运用DNBSEQ测序平台对兔儿伞的叶、茎、根及根茎进行转录组测序,从头组装后获得了191541条Unigenes。KEGG代谢通路分析表明有961条Unigenes涉及兔儿伞羽扇豆醇生物合成途径,其中...
为解析兔儿伞羽扇豆醇生物合成途径,探究其关键酶基因,研究运用DNBSEQ测序平台对兔儿伞的叶、茎、根及根茎进行转录组测序,从头组装后获得了191541条Unigenes。KEGG代谢通路分析表明有961条Unigenes涉及兔儿伞羽扇豆醇生物合成途径,其中,395条Unigenes编码羽扇豆醇生物合成途径的17个关键酶。根与其他各组织比较,24条共有差异表达基因涉及羽扇豆醇生物合成途径,编码了法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,FPPS)、角鲨烯合成酶(squalene synthase,SS)、角鲨烯环氧酶(squalene epoxidase,SE)等关键酶。对关键酶FPPS、SS和SE进行结构分析,发现它们均具有保守的催化结构域和底物结合结构域。研究丰富了兔儿伞植物的功能基因数据库,为进一步研究羽扇豆醇生物合成途径及其关键酶基因的功能和调控机制奠定了基础。
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关键词
兔儿伞
转录组测序
羽扇豆醇
法尼基焦磷酸合酶
角鲨烯合成酶
角鲨烯环氧酶
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职称材料
题名
基于转录组测序的兔儿伞羽扇豆醇合成途径及关键酶基因研究
被引量：
1
1
作者
张京晶
许景垚
单婷玉
赵历强
钟欣欣
张帅帅
吴家文
机构
安徽中医药大学
研究生院
安徽中医药大学科研技术中心新安医学教育部重点实验室
安徽
省
中医药
科学院
安徽
道地中药材品质提升协同创新
中心
出处
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期32-40,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFC1701600)
安徽省自然科学基金项目(2008085MH268)
安徽省高等学校科学研究项目(2022AH050474)。
文摘
为解析兔儿伞羽扇豆醇生物合成途径,探究其关键酶基因,研究运用DNBSEQ测序平台对兔儿伞的叶、茎、根及根茎进行转录组测序,从头组装后获得了191541条Unigenes。KEGG代谢通路分析表明有961条Unigenes涉及兔儿伞羽扇豆醇生物合成途径,其中,395条Unigenes编码羽扇豆醇生物合成途径的17个关键酶。根与其他各组织比较,24条共有差异表达基因涉及羽扇豆醇生物合成途径,编码了法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,FPPS)、角鲨烯合成酶(squalene synthase,SS)、角鲨烯环氧酶(squalene epoxidase,SE)等关键酶。对关键酶FPPS、SS和SE进行结构分析,发现它们均具有保守的催化结构域和底物结合结构域。研究丰富了兔儿伞植物的功能基因数据库,为进一步研究羽扇豆醇生物合成途径及其关键酶基因的功能和调控机制奠定了基础。
关键词
兔儿伞
转录组测序
羽扇豆醇
法尼基焦磷酸合酶
角鲨烯合成酶
角鲨烯环氧酶
Keywords
Syneilesis aconitifolia
transcriptome sequencing
lupeol
farnesyl diphosphate synthase
squalene synthase
squalene epoxidase
分类号
Q344.13 [生物学—遗传学]
Q78 [生物学—分子生物学]
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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作者
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1
基于转录组测序的兔儿伞羽扇豆醇合成途径及关键酶基因研究
张京晶
许景垚
单婷玉
赵历强
钟欣欣
张帅帅
吴家文
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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