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基于转录组测序的细风轮花青素合成途径及关键酶基因分析
被引量：
11
1
作者
赵历强
单春苗
+3 位作者
张声祥
施圆圆
马克龙
吴家文
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期886-896,共11页
为进一步理解细风轮花青素合成途径,本研究利用华大基因BGISEQ-500平台对细风轮中的根、茎、叶、花4个组织进行了转录组测序,从头组装后得到128856个Unigene。KEGG通路表明有40个Unigene编码了细风轮的花青素生物合成途径中6个关键酶。...
为进一步理解细风轮花青素合成途径,本研究利用华大基因BGISEQ-500平台对细风轮中的根、茎、叶、花4个组织进行了转录组测序,从头组装后得到128856个Unigene。KEGG通路表明有40个Unigene编码了细风轮的花青素生物合成途径中6个关键酶。我们对其中的关键酶DFR(二氢黄酮醇还原酶)进行同源比对和空间结构模拟,结果显示DFR序列和结构均具有良好的保守性,且具有高度保守的NAD+结合位点,其二级结构主要由α螺旋和β折叠组成,在空间上α螺旋包裹着β折叠,形成“夹心饼干”样结构。
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关键词
细风轮
花青素
转录组
单基因
二氢黄酮醇还原酶
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职称材料
题名
基于转录组测序的细风轮花青素合成途径及关键酶基因分析
被引量：
11
1
作者
赵历强
单春苗
张声祥
施圆圆
马克龙
吴家文
机构
安徽中医药大学
研究生院
安徽中医药大学科研实验中心、新安医学教育部重点实验室
安徽中医药大学
中西医结合学院
安徽
道地中药材品质提升协同创新
中心
安徽
省
中医药
科学院
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期886-896,共11页
基金
安徽高校自然科学研究重大项目(KJ2018ZD028)
名贵中药资源可持续利用能力建设项目(2060302)
+1 种基金
国家自然科学基金(81874431)
国家级大学生创新训练项目(201810369050)。
文摘
为进一步理解细风轮花青素合成途径,本研究利用华大基因BGISEQ-500平台对细风轮中的根、茎、叶、花4个组织进行了转录组测序,从头组装后得到128856个Unigene。KEGG通路表明有40个Unigene编码了细风轮的花青素生物合成途径中6个关键酶。我们对其中的关键酶DFR(二氢黄酮醇还原酶)进行同源比对和空间结构模拟,结果显示DFR序列和结构均具有良好的保守性,且具有高度保守的NAD+结合位点,其二级结构主要由α螺旋和β折叠组成,在空间上α螺旋包裹着β折叠,形成“夹心饼干”样结构。
关键词
细风轮
花青素
转录组
单基因
二氢黄酮醇还原酶
Keywords
Clinopodium gracile
anthocyanin
transcriptome
unigene
DFR
分类号
Q949.777.6 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序的细风轮花青素合成途径及关键酶基因分析
赵历强
单春苗
张声祥
施圆圆
马克龙
吴家文
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2020
11
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