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硒蛋白基因在新型冠状病毒感染患者中的表达水平及调控作用
1
作者
李晶
张荣强
+5 位作者
张灵芝
戚燕
郝洁
何傲月
赵旭
李秀芹
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期316-323,共8页
目的探讨硒蛋白基因在新型冠状病毒感染(COVID-19)患者中的表达水平及其可能的调控机制。方法从基因表达综合数据库获取数据集GSE177477,样本由有症状组(n=11)、无症状组(n=18)和健康对照组(n=18)构成。对数据集进行预处理,筛选出与COVI...
目的探讨硒蛋白基因在新型冠状病毒感染(COVID-19)患者中的表达水平及其可能的调控机制。方法从基因表达综合数据库获取数据集GSE177477,样本由有症状组(n=11)、无症状组(n=18)和健康对照组(n=18)构成。对数据集进行预处理,筛选出与COVID-19相关的差异表达基因,并进行基因本体功能注释和京都基因与基因组百科全书富集分析,建立差异表达硒蛋白基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络,采用多因素Logistic回归分析硒蛋白基因对COVID-19患者是否出现症状的影响。结果与健康对照组比较,有症状的COVID-19患者中GPX1、GPX4、GPX6、DIO2、TXNRD1、SELENOF、SELENOK、SELENOS、SELENOT、SELENOW基因表达均升高,TXNRD2、SELENON基因表达均下降(P均<0.05);无症状的COVID-19患者中GPX2、SELENOI、SELENOO、SELENOS、SELENOT、SELENOW基因表达均升高,SELP基因表达下降(P均<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,GPX1(OR=0.067,95%CI=0.005~0.904,P=0.042)、SELENON(OR=56.663,95%CI=3.114~856.999,P=0.006)基因的异常高表达是有症状COVID-19患者的影响因素,SELP基因的异常高表达是无症状COVID-19患者的危险因素(OR=15.000,95%CI=2.537~88.701,P=0.003)。结论硒蛋白基因的差异表达参与调控COVID-19疾病的发生发展,为COVID-19的预防和治疗提供新的参考依据。
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关键词
新型冠状病毒感染
硒蛋白
表达及调控
LOGISTIC回归
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职称材料
硒蛋白基因在人类免疫缺陷病毒感染和母婴传播中的表达水平及预测模型构建
被引量：
1
2
作者
戚燕
张荣强
+5 位作者
张灵芝
李晶
陈雪芹
付国涛
李灵兰
李秀芹
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期563-570,共8页
目的探讨硒蛋白基因在人类免疫缺陷病毒(HIV)感染及其母婴传播中的表达水平,为艾滋病的预防及诊疗提供新的理论依据。方法在基因表达数据库检索下载数据集GSE4124,样本由HIV阳性组(n=25)和对照组(n=20)构成,其中HIV阳性组包括母婴传播(...
目的探讨硒蛋白基因在人类免疫缺陷病毒(HIV)感染及其母婴传播中的表达水平,为艾滋病的预防及诊疗提供新的理论依据。方法在基因表达数据库检索下载数据集GSE4124,样本由HIV阳性组(n=25)和对照组(n=20)构成,其中HIV阳性组包括母婴传播(TR)组(n=11)和非母婴传播(NTR)组(n=14);采用t检验分析4组(HIV阳性组比对照组、NTR组比对照组、TR组比对照组、TR组比NTR组)硒蛋白基因表达水平的差异;随后采用单因素和多因素Logistic回归分析差异表达基因对HIV感染和母婴传播的影响;应用R语言构建列线图预测模型并验证其效能。结果与对照组比较,HIV阳性组、NTR组、TR组分别有8、5、8个差异表达硒蛋白基因为下调基因;与NTR组比较,TR组有4个差异表达硒蛋白基因为下调基因。单因素Logistic回归分析显示,GPX1、GPX3、GPX4、TXNRD1、TXNRD3、SEPHS2基因异常高表达对HIV感染均具有影响,而对母婴传播无影响作用。多因素Logistic回归分析显示,TXNRD3基因的异常高表达与是否HIV感染呈正相关(OR=0.032,95%CI=0.002~0.607,P=0.022)。列线图预测模型的预测效能显示,HIV感染者生存时间1、3年的受试者工作特征曲线下面积分别为0.840(95%CI=0.690~1.000)和0.870(95%CI=0.730~1.000)。结论多个硒蛋白基因差异表达水平下调,参与调控HIV感染和母婴传播过程;其中,TXNRD3基因异常高表达与是否HIV感染呈正相关,为艾滋病防治、诊疗提供了新思路。
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关键词
硒蛋白基因
人类免疫缺陷病毒
母婴传播
LOGISTIC回归
列线图
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职称材料
题名
硒蛋白基因在新型冠状病毒感染患者中的表达水平及调控作用
1
作者
李晶
张荣强
张灵芝
戚燕
郝洁
何傲月
赵旭
李秀芹
机构
陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室
安康市汉滨区第二医院检验科
陕西中医药大学人文管理学院公共管理教研室
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期316-323,共8页
基金
陕西中医药大学特色优势与交叉学科公共卫生管理(2022XKZC09)
陕西中医药大学公共卫生与预防医学特色学科(2022XKZC04)
文摘
目的探讨硒蛋白基因在新型冠状病毒感染(COVID-19)患者中的表达水平及其可能的调控机制。方法从基因表达综合数据库获取数据集GSE177477,样本由有症状组(n=11)、无症状组(n=18)和健康对照组(n=18)构成。对数据集进行预处理,筛选出与COVID-19相关的差异表达基因,并进行基因本体功能注释和京都基因与基因组百科全书富集分析,建立差异表达硒蛋白基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络,采用多因素Logistic回归分析硒蛋白基因对COVID-19患者是否出现症状的影响。结果与健康对照组比较,有症状的COVID-19患者中GPX1、GPX4、GPX6、DIO2、TXNRD1、SELENOF、SELENOK、SELENOS、SELENOT、SELENOW基因表达均升高,TXNRD2、SELENON基因表达均下降(P均<0.05);无症状的COVID-19患者中GPX2、SELENOI、SELENOO、SELENOS、SELENOT、SELENOW基因表达均升高,SELP基因表达下降(P均<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,GPX1(OR=0.067,95%CI=0.005~0.904,P=0.042)、SELENON(OR=56.663,95%CI=3.114~856.999,P=0.006)基因的异常高表达是有症状COVID-19患者的影响因素,SELP基因的异常高表达是无症状COVID-19患者的危险因素(OR=15.000,95%CI=2.537~88.701,P=0.003)。结论硒蛋白基因的差异表达参与调控COVID-19疾病的发生发展,为COVID-19的预防和治疗提供新的参考依据。
关键词
新型冠状病毒感染
硒蛋白
表达及调控
LOGISTIC回归
Keywords
coronavirus disease 2019
selenoprotein
expression and regulation
Logistic regression
分类号
R183.3 [医药卫生—流行病学]
在线阅读
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职称材料
题名
硒蛋白基因在人类免疫缺陷病毒感染和母婴传播中的表达水平及预测模型构建
被引量：
1
2
作者
戚燕
张荣强
张灵芝
李晶
陈雪芹
付国涛
李灵兰
李秀芹
机构
陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室
安康市汉滨区第二医院检验科
陕西中医药大学人文管理学院公共管理教研室
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期563-570,共8页
基金
陕西中医药大学特色优势与交叉学科公共卫生管理(2022XKZC09)
中央财政专项-主要性传播疾病的流行病学调查与防治研究(17901022202)
陕西中医药大学公共卫生与预防医学特色学科(2022XKZC04)。
文摘
目的探讨硒蛋白基因在人类免疫缺陷病毒(HIV)感染及其母婴传播中的表达水平,为艾滋病的预防及诊疗提供新的理论依据。方法在基因表达数据库检索下载数据集GSE4124,样本由HIV阳性组(n=25)和对照组(n=20)构成,其中HIV阳性组包括母婴传播(TR)组(n=11)和非母婴传播(NTR)组(n=14);采用t检验分析4组(HIV阳性组比对照组、NTR组比对照组、TR组比对照组、TR组比NTR组)硒蛋白基因表达水平的差异;随后采用单因素和多因素Logistic回归分析差异表达基因对HIV感染和母婴传播的影响;应用R语言构建列线图预测模型并验证其效能。结果与对照组比较,HIV阳性组、NTR组、TR组分别有8、5、8个差异表达硒蛋白基因为下调基因;与NTR组比较,TR组有4个差异表达硒蛋白基因为下调基因。单因素Logistic回归分析显示,GPX1、GPX3、GPX4、TXNRD1、TXNRD3、SEPHS2基因异常高表达对HIV感染均具有影响,而对母婴传播无影响作用。多因素Logistic回归分析显示,TXNRD3基因的异常高表达与是否HIV感染呈正相关(OR=0.032,95%CI=0.002~0.607,P=0.022)。列线图预测模型的预测效能显示,HIV感染者生存时间1、3年的受试者工作特征曲线下面积分别为0.840(95%CI=0.690~1.000)和0.870(95%CI=0.730~1.000)。结论多个硒蛋白基因差异表达水平下调,参与调控HIV感染和母婴传播过程;其中,TXNRD3基因异常高表达与是否HIV感染呈正相关,为艾滋病防治、诊疗提供了新思路。
关键词
硒蛋白基因
人类免疫缺陷病毒
母婴传播
LOGISTIC回归
列线图
Keywords
selenoprotein gene
human immunodeficiency virus
mother-to-child transmission
Logistic regression
nomogram
分类号
R183.9 [医药卫生—流行病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
硒蛋白基因在新型冠状病毒感染患者中的表达水平及调控作用
李晶
张荣强
张灵芝
戚燕
郝洁
何傲月
赵旭
李秀芹
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
硒蛋白基因在人类免疫缺陷病毒感染和母婴传播中的表达水平及预测模型构建
戚燕
张荣强
张灵芝
李晶
陈雪芹
付国涛
李灵兰
李秀芹
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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