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四川省马铃薯孢囊线虫的形态和分子鉴定 被引量:5
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作者 顾建锋 邵宝林 +3 位作者 方亦午 马欣欣 李星月 郑经武 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期520-528,共9页
【目的】四川省越西县马铃薯发现疑似线虫侵染症状,为查清病原,对分离获得的线虫进行形态学和分子生物学鉴定。【方法】采集马铃薯根系和根围土壤,对根系内部线虫进行染色观察,用简易漂浮法分离孢囊,并对发现的二龄幼虫、雌虫和孢囊进... 【目的】四川省越西县马铃薯发现疑似线虫侵染症状,为查清病原,对分离获得的线虫进行形态学和分子生物学鉴定。【方法】采集马铃薯根系和根围土壤,对根系内部线虫进行染色观察,用简易漂浮法分离孢囊,并对发现的二龄幼虫、雌虫和孢囊进行显微摄影和形态学测计。提取孢囊和二龄幼虫的DNA,用种特异PCR方法进行鉴定,同时PCR扩增后获得核糖体rDNA部分18S基因、28S基因D2~D3区和ITS区DNA序列,在GenBank中下载已登录的各近似种(球孢囊线虫属)的部分序列,进行序列比对,并使用MrBayes 3.2.3软件进行贝叶斯法系统进化树的构建。【结果】该种线虫能入侵寄主根系内部,二龄幼虫口针基部球近圆形,向后倾斜;口针平均长<23μm;孢囊Granek比值≥3,与马铃薯金线虫高度一致。特异PCR扩增3个孢囊和4条二龄幼虫均得到了430 bp左右的明亮条带,进一步测序后得到的序列长度均为434 bp,与马铃薯金线虫一致。核糖体rDNA 18S和28S进化分析表明,该四川越西马铃薯上发现的孢囊线虫属于球孢囊属线虫,核糖体ITS基因序列进一步分析证实该群体确为马铃薯金线虫。【结论】四川省越西县马铃薯根系分离获得的线虫为马铃薯金线虫,该线虫为我国内检和外检均十分关注的检疫性线虫,一旦传入和定殖扩散,根除十分困难。建议尽快建立马铃薯金线虫疫情监测体系,加强马铃薯种薯的检疫监督管理,增加马铃薯金线虫防控技术的研发投入、研发检测和防控技术,为我国马铃薯主粮化产业健康可持续发展保驾护航。 展开更多
关键词 马铃薯孢囊线虫 形态学 分子生物学 检疫 鉴定 监测
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基于18S、28S宏条形码高通量测序和形态学方法的土壤线虫群落多样性比较 被引量:2
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作者 方亦午 顾建锋 +3 位作者 熊武 马欣欣 吕晓玲 陈先锋 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第6期202-210,共9页
为探究不同靶标位点的高通量测序方法以及形态学鉴定方法对土壤线虫群落分析的影响,选取线虫群落复杂程度高的日本进境罗汉松根际土壤样品,设置18S、28S、形态学鉴定3个处理,比较不同线虫群落分析方法对土壤线虫群落分析的差异。结果表... 为探究不同靶标位点的高通量测序方法以及形态学鉴定方法对土壤线虫群落分析的影响,选取线虫群落复杂程度高的日本进境罗汉松根际土壤样品,设置18S、28S、形态学鉴定3个处理,比较不同线虫群落分析方法对土壤线虫群落分析的差异。结果表明,线虫群落中属的数量分析,18S组、28S组高于形态学鉴定组;除捕食和杂食性线虫的相对丰度在3组间无显著性差异外,食细菌线虫、食真菌线虫以及植物寄生线虫的相对丰度在3组间均有一定差异。各线虫指数中,除多样性指数在在3组间无显著性差异外,均匀度指数、线虫成熟度指数、植物线虫指数、富集指数、结构指数、基础指数、线虫通道比率在3组间均有较大差异。高通量测序方法形态学鉴定结果存在一定的相关性,结合多基因位点的宏条形码高通测序方法以及形态学鉴定方法,可作为研究土壤线虫群落组分的新策略。 展开更多
关键词 土壤线虫 线虫群落 高通量测序 形态学鉴定 线虫指数
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北京油松上东京伞滑刃线虫的鉴定
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作者 刘乐乐 方亦午 +3 位作者 刘曦 陈先锋 边勇 顾建锋 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第4期447-452,共6页
对北京地区重点林区开展松材线虫普查时从油松中分离到一个伞滑刃线虫属群体.通过形态特征观察发现其与东京伞滑刃线虫(Bursaphelenchus tokyoensis)基本相似;通过扩增核糖体DNA(rDNA)18S、28S、ITS基因片段及测序分析,发现该群体与东... 对北京地区重点林区开展松材线虫普查时从油松中分离到一个伞滑刃线虫属群体.通过形态特征观察发现其与东京伞滑刃线虫(Bursaphelenchus tokyoensis)基本相似;通过扩增核糖体DNA(rDNA)18S、28S、ITS基因片段及测序分析,发现该群体与东京伞滑刃线虫的rDNA 18S和28S基因序列的相似度高达99%,ITS基因序列的相似度高达98%,因此将该群体鉴定为东京伞滑刃线虫. 展开更多
关键词 油松 东京伞滑刃线虫 形态特征 核糖体DNA 系统进化
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中国十二齿小蠹伞滑刃线虫新记录
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作者 顾建锋 于海英 +1 位作者 刘乐乐 方亦午 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第3期307-312,共6页
2018年8月从来自我国吉林省辽源市的2批枯死红松中发现一种伞滑刃线虫属群体,经形态特征观察、形态测计值比较以及核糖体DNA序列分析,将该群体鉴定为十二齿小蠹伞滑刃线虫(Bursaphelenchus sexdentati).该线虫为我国新记录种.
关键词 红松 形态学 分子生物学 致病性
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