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题名杨梅种质资源InDel标记开发及与熟期的关联分析
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作者
焦云
高中山
汪国云
陈方永
姚小映
周超超
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机构
宁波市特色园艺作物品质调控与抗性育种重点实验室
宁波市农业科学研究院林业研究所
浙江大学果树科学研究所
余姚市农业技术推广服务总站
浙江省柑桔研究所
宁波市江北南珍水果专业合作社
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出处
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第3期575-588,共14页
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基金
宁波市现代种业专项(2021Z008)
宁波市特色园艺作物品质调控与抗性育种重点实验室开放课题基金(NBYYL2023002)。
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文摘
InDel标记已广泛用于果树分子标记辅助育种等研究领域,然而针对我国传统特色果树杨梅的相关研究报道甚少。本研究通过103份杨梅核心种质全基因组重测序及生物信息学分析,共获得了大小分布在1~50 bp范围内的25831个InDel。不同染色体上的InDel变异频率介于1/11297~1/8903;其中,CM025856.1染色体上发生InDel变异频率最高。通过注释分析发现有1312个InDel分布在基因外显子区域,另有21055和6659个InDel分别分布在基因间区和内含子区域。经GO注释,上述InDel生物过程主要涉及细胞过程(Cellular process)和代谢过程(Metabolic process);分子功能主要包括结合(Binding)和催化活性(Catalyticactivity)。经KEGG通路分析发现,InDel所在的基因区域的功能主要为次生代谢、碳代谢和核质运输等。通过全基因组关联分析,获得20个与杨梅果实成熟期性状显著关联的InDel,其功能注释主要涉及线粒体、质体结构基因,三磷酸核苷水解酶和细胞分裂素信号蛋白等。进一步验证显示InDelEP-18标记对杨梅果实成熟期性状鉴定准确率较高,达89.25%;通过基因预测结果发现该位点注释为早期结瘤素家族(Early nodulin)基因。本研究筛选获得的InDel EP-18标记将为杨梅分子辅助育种提供重要的理论依据。
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关键词
杨梅
INDEL
重测序
关联分析
成熟期
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Keywords
Chinese bayberry
InDel
resequencing
correlation analysis
mature stage
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分类号
S667.6
[农业科学—果树学]
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题名味鲜质优黄泥拱笋培育技术
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作者
朱惠珍
张兆康
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机构
宁波市江北南珍水果专业合作社
宁波市江北区农业农村局
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出处
《特种经济动植物》
2020年第9期44-44,共1页
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文摘
为提高味鲜质优的黄泥拱笋产量,应打造一套科学合理的培育技术。本文从选择合适的林地、适量施用畜禽有机肥、科学的垦复松土方法、推行深层埋鞭技术以及采用适宜的挖笋方法等方面简介培育优质黄泥拱笋的方法,以期为笋农提供参考。
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关键词
黄泥拱笋
培育方法
技术集成
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分类号
S51
[农业科学—作物学]
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