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基于BSA-seq的榧树雌雄性别分子标记筛选与应用
1
作者
邬玉芬
田海丹
+1 位作者
汪佞元
焦云
《经济林研究》
北大核心
2025年第2期12-19,共8页
【目的】筛选快速鉴定榧树性别的分子标记,加快榧树雌雄株定向培育及育种进程。【方法】采用BSA-Seq技术,分别对榧树雌株和雄株混池进行测序分析。【结果】获得了1751232个Contig,其中长度大于1 MB的Contig合计有5796个。根据不同性别...
【目的】筛选快速鉴定榧树性别的分子标记,加快榧树雌雄株定向培育及育种进程。【方法】采用BSA-Seq技术,分别对榧树雌株和雄株混池进行测序分析。【结果】获得了1751232个Contig,其中长度大于1 MB的Contig合计有5796个。根据不同性别测序结果中Contig的对比分析,锁定部分性别关联位点并设计16对引物。引物分别来源于9个不同的Contig,其特异性位点突变序列长度为4~10 bp,PCR扩增产物长度预期为61~180 bp,最终筛选出与榧树雄株(含雌雄同株)性别紧密连锁的引物XF1754,其扩增产物长度仅为97 bp。进一步优化PCR循环条件,将循环数量设为17~22。琼脂糖凝胶电泳分析结果表明,仅需17个循环即可获得清晰可见的扩增条带。在ABI 3730荧光毛细管电泳检测平台上对XF1754扩增产物进行分析,结果显示,仅榧树雄株(含雌雄同株)样本能够扩增出单一且清晰的峰,与预期产物片段大小一致。因此,XF1754适用于荧光定量PCR仪和遗传分析仪等高通量检测平台。随机选择70份榧树不同性别种质自然群体进行分型与表型验证,结果表明使用XF1754可将榧树试材清晰地划分为2簇,分别代表雄株(含雌雄同株)群体与雌株种质群体,与实际的性别表型完全一致。【结论】筛选获得的XF1754标记可用于榧树种质资源性别性状的早期快速鉴定。
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关键词
榧树
雌雄
性别
分子标记
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职称材料
题名
基于BSA-seq的榧树雌雄性别分子标记筛选与应用
1
作者
邬玉芬
田海丹
汪佞元
焦云
机构
宁波市
宁海县
林特技术推广站
宁波市
宁海县
农业农村
局
宁波市宁海县自然资源与规划局
宁波市
农业科学研究院林业研究所
出处
《经济林研究》
北大核心
2025年第2期12-19,共8页
基金
宁波市农业重大科技攻关项目(2012C10015)
余姚市农业与社发项目(20191YYS030014)。
文摘
【目的】筛选快速鉴定榧树性别的分子标记,加快榧树雌雄株定向培育及育种进程。【方法】采用BSA-Seq技术,分别对榧树雌株和雄株混池进行测序分析。【结果】获得了1751232个Contig,其中长度大于1 MB的Contig合计有5796个。根据不同性别测序结果中Contig的对比分析,锁定部分性别关联位点并设计16对引物。引物分别来源于9个不同的Contig,其特异性位点突变序列长度为4~10 bp,PCR扩增产物长度预期为61~180 bp,最终筛选出与榧树雄株(含雌雄同株)性别紧密连锁的引物XF1754,其扩增产物长度仅为97 bp。进一步优化PCR循环条件,将循环数量设为17~22。琼脂糖凝胶电泳分析结果表明,仅需17个循环即可获得清晰可见的扩增条带。在ABI 3730荧光毛细管电泳检测平台上对XF1754扩增产物进行分析,结果显示,仅榧树雄株(含雌雄同株)样本能够扩增出单一且清晰的峰,与预期产物片段大小一致。因此,XF1754适用于荧光定量PCR仪和遗传分析仪等高通量检测平台。随机选择70份榧树不同性别种质自然群体进行分型与表型验证,结果表明使用XF1754可将榧树试材清晰地划分为2簇,分别代表雄株(含雌雄同株)群体与雌株种质群体,与实际的性别表型完全一致。【结论】筛选获得的XF1754标记可用于榧树种质资源性别性状的早期快速鉴定。
关键词
榧树
雌雄
性别
分子标记
Keywords
Torreya grandis
male and female
gender
molecular marker
分类号
S603 [农业科学—园艺学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于BSA-seq的榧树雌雄性别分子标记筛选与应用
邬玉芬
田海丹
汪佞元
焦云
《经济林研究》
北大核心
2025
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