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脂多糖活化巨噬细胞的数字基因表达谱分析
被引量:
2
1
作者
宣荣荣
陈海敏
《中国药理学与毒理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期971-977,共7页
目的研究巨噬细胞经脂多糖(LPS)处理后基因表达谱的变化。方法 LPS 0.01 mg·L-1作用RAW264.7细胞24 h,应用数字基因表达谱(DGE)技术筛选差异表达基因,分析差异基因富集的Gene ontology(GO)功能和Kyoto encyclopoedia of genes and ...
目的研究巨噬细胞经脂多糖(LPS)处理后基因表达谱的变化。方法 LPS 0.01 mg·L-1作用RAW264.7细胞24 h,应用数字基因表达谱(DGE)技术筛选差异表达基因,分析差异基因富集的Gene ontology(GO)功能和Kyoto encyclopoedia of genes and genomes(KEGG)信号通路,并通过定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果 LPS处理后,共有1959个基因差异表达,其中上调974个,下调985个。GO分析显示,差异表达基因主要发挥蛋白结合和催化活性等分子功能,以及调节细胞过程、对环境刺激的反应和免疫系统等生物学功能。信号通路分析显示,显著富集的途径与炎症、免疫系统和癌症等疾病密切相关。结论 DGE技术验证了LPS介导炎症反应的NF-κB、丝裂原激活蛋白激酶和Jak-STAT 3条主要的信号转导途径,发现了细胞周期、细胞凋亡和细胞外识别等新的途径。
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关键词
脂多糖
巨噬细胞
数字基因表达谱
炎症
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题名
脂多糖活化巨噬细胞的数字基因表达谱分析
被引量:
2
1
作者
宣荣荣
陈海敏
机构
宁波大学
医学院附属医院
宁波大学应用海洋生物工程重点实验室
出处
《中国药理学与毒理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期971-977,共7页
基金
浙江省医药卫生科技计划项目(2013KYB238)
国家自然科学基金(81370532)
宁波市自然科学基金(2013A610220)~~
文摘
目的研究巨噬细胞经脂多糖(LPS)处理后基因表达谱的变化。方法 LPS 0.01 mg·L-1作用RAW264.7细胞24 h,应用数字基因表达谱(DGE)技术筛选差异表达基因,分析差异基因富集的Gene ontology(GO)功能和Kyoto encyclopoedia of genes and genomes(KEGG)信号通路,并通过定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果 LPS处理后,共有1959个基因差异表达,其中上调974个,下调985个。GO分析显示,差异表达基因主要发挥蛋白结合和催化活性等分子功能,以及调节细胞过程、对环境刺激的反应和免疫系统等生物学功能。信号通路分析显示,显著富集的途径与炎症、免疫系统和癌症等疾病密切相关。结论 DGE技术验证了LPS介导炎症反应的NF-κB、丝裂原激活蛋白激酶和Jak-STAT 3条主要的信号转导途径,发现了细胞周期、细胞凋亡和细胞外识别等新的途径。
关键词
脂多糖
巨噬细胞
数字基因表达谱
炎症
Keywords
lipopolysaccharides
macrophages
digital gene expression profiling
inflammation
分类号
R392.1 [医药卫生—免疫学]
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作者
出处
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被引量
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1
脂多糖活化巨噬细胞的数字基因表达谱分析
宣荣荣
陈海敏
《中国药理学与毒理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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