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单细胞转录组测序在头颈部鳞状细胞癌研究中的应用进展
1
作者
刘海岩
马坚
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期1042-1048,共7页
头颈部鳞状细胞癌是最常见的头颈部恶性肿瘤,该疾病异质性显著,病因至今仍未明确。单细胞转录组测序可以在单个细胞水平上,通过无偏、高通量和高分辨率的转录组测序获得相关数据并进行信息分析,已成为了解头颈部鳞状细胞癌发生的分子机...
头颈部鳞状细胞癌是最常见的头颈部恶性肿瘤,该疾病异质性显著,病因至今仍未明确。单细胞转录组测序可以在单个细胞水平上,通过无偏、高通量和高分辨率的转录组测序获得相关数据并进行信息分析,已成为了解头颈部鳞状细胞癌发生的分子机制,制定预防和治疗新策略的有力工具。本文概述了单细胞转录组测序在肿瘤微环境的表征、肿瘤侵袭和转移、人乳头状瘤病毒(human papilloma virus,HPV)与非HPV感染头颈部鳞状细胞癌和免疫治疗方面的研究成果及应用进展,旨在为头颈部鳞状细胞癌的研究与诊疗提供新思路。
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关键词
单细胞转录组测序
头颈部鳞状细胞癌
肿瘤微环境
人乳头状瘤病毒
肿瘤免疫
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职称材料
口腔鳞状细胞癌预后相关的长链非编码RNA筛选及验证
2
作者
刘絮影
李锦存
+3 位作者
翟堃
胡晨
董文
马坚
《口腔医学研究》
北大核心
2025年第2期109-117,共9页
目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer ge...
目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)和基因表达综合数据库(gene expression omnibus database,GEO)中筛选出TCGA-OSCC、GSE23558和GSE30784数据集,进行表达谱分析,筛选出差异表达lncRNA和mRNA,并进行生存分析、基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,确定其与OSCC预后的相关性。利用starBase、miRTarBase数据库预测关键lncRNA及mRNA的共同靶标miRNA,以此构建竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)检测这些关键lncRNA在OSCC细胞系和肿瘤组织中表达水平。结果:表达谱分析鉴定出23个差异表达lncRNA,其中有6个lncRNA与OSCC患者预后相关;mRNA的表达分析鉴定出282个差异表达mRNA,主要富集在三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)酶激活剂活性、核苷酸结合寡聚化域(nucletide-binding oligomerization domain,NOD)样受体等信号通路,其中10个差异表达的mRNA与OSCC预后相关。ceRNA网络构建了包括6个lncRNA、10个mRNA和靶向预测的26个miRNA分子网络。qRT-PCR结果显示包含LINC01980在内的5个lncRNA在OSCC细胞中高表达,而MIR99AHG低表达。在OSCC组织中,LINC01980表达水平明显升高,而MIR99AHG表达水平降低。结论:本研究筛选的LINC01980和MIR99AHG与OSCC进展和预后相关,可作为OSCC的生物学标志物进一步探讨。
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关键词
口腔鳞状细胞癌
长链非编码RNA
预后
LINC01980
MIR99AHG
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职称材料
腭裂治疗中有限元方法的应用进展
3
作者
张萌
马坚
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期679-683,共5页
腭裂是人类常见的口腔颌面部先天性畸形。腭裂的治疗主要以外科手术修复为主,现行腭裂手术术式虽多,但是术后仍有部分患者出现腭瘘、上颌骨发育不足及腭咽闭合不全等并发症。有限元方法应用于腭裂,通过模拟手术和力学分析的方式来预测...
腭裂是人类常见的口腔颌面部先天性畸形。腭裂的治疗主要以外科手术修复为主,现行腭裂手术术式虽多,但是术后仍有部分患者出现腭瘘、上颌骨发育不足及腭咽闭合不全等并发症。有限元方法应用于腭裂,通过模拟手术和力学分析的方式来预测临床预后、改良手术术式。本文就有限元方法在腭裂治疗中的应用进展,从腭裂治疗的现状、有限元的应用原理及其在腭裂手术模拟和手术预后评价中的应用进行综述,以期为有限元方法在腭裂治疗中的进一步应用提供帮助。
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关键词
腭裂
有限元分析
手术模拟
上颌骨
腭咽闭合不全
腭瘘
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职称材料
题名
单细胞转录组测序在头颈部鳞状细胞癌研究中的应用进展
1
作者
刘海岩
马坚
机构
宁夏
医科大学口腔医学院
宁夏颅颌面畸形研究重点实验室
宁夏
医科大学总医院口腔医院
出处
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期1042-1048,共7页
基金
宁夏自然科学基金项目(编号:2022AAC03473)。
文摘
头颈部鳞状细胞癌是最常见的头颈部恶性肿瘤,该疾病异质性显著,病因至今仍未明确。单细胞转录组测序可以在单个细胞水平上,通过无偏、高通量和高分辨率的转录组测序获得相关数据并进行信息分析,已成为了解头颈部鳞状细胞癌发生的分子机制,制定预防和治疗新策略的有力工具。本文概述了单细胞转录组测序在肿瘤微环境的表征、肿瘤侵袭和转移、人乳头状瘤病毒(human papilloma virus,HPV)与非HPV感染头颈部鳞状细胞癌和免疫治疗方面的研究成果及应用进展,旨在为头颈部鳞状细胞癌的研究与诊疗提供新思路。
关键词
单细胞转录组测序
头颈部鳞状细胞癌
肿瘤微环境
人乳头状瘤病毒
肿瘤免疫
Keywords
single-cell RNA sequencing
head and neck squamous cell carcinoma
tumor micro-environment
human papilloma virus
cancer immunotherapy
分类号
R739.91 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
口腔鳞状细胞癌预后相关的长链非编码RNA筛选及验证
2
作者
刘絮影
李锦存
翟堃
胡晨
董文
马坚
机构
宁夏
医科大学口腔医学院
广西壮族自治区南溪山医院口腔科
宁夏
医科大学总医院口腔
颌面
外科
宁夏颅颌面畸形研究重点实验室
出处
《口腔医学研究》
北大核心
2025年第2期109-117,共9页
基金
宁夏回族自治区自然科学基金(编号:2020AAC03413、2022AAC03473)
宁夏回族自治区教育厅高等学校科学研究项目资助(编号:NYG2024155)
宁夏医科大学口腔医学院一流学科二期建设(编号:0019110104)。
文摘
目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)和基因表达综合数据库(gene expression omnibus database,GEO)中筛选出TCGA-OSCC、GSE23558和GSE30784数据集,进行表达谱分析,筛选出差异表达lncRNA和mRNA,并进行生存分析、基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,确定其与OSCC预后的相关性。利用starBase、miRTarBase数据库预测关键lncRNA及mRNA的共同靶标miRNA,以此构建竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)检测这些关键lncRNA在OSCC细胞系和肿瘤组织中表达水平。结果:表达谱分析鉴定出23个差异表达lncRNA,其中有6个lncRNA与OSCC患者预后相关;mRNA的表达分析鉴定出282个差异表达mRNA,主要富集在三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)酶激活剂活性、核苷酸结合寡聚化域(nucletide-binding oligomerization domain,NOD)样受体等信号通路,其中10个差异表达的mRNA与OSCC预后相关。ceRNA网络构建了包括6个lncRNA、10个mRNA和靶向预测的26个miRNA分子网络。qRT-PCR结果显示包含LINC01980在内的5个lncRNA在OSCC细胞中高表达,而MIR99AHG低表达。在OSCC组织中,LINC01980表达水平明显升高,而MIR99AHG表达水平降低。结论:本研究筛选的LINC01980和MIR99AHG与OSCC进展和预后相关,可作为OSCC的生物学标志物进一步探讨。
关键词
口腔鳞状细胞癌
长链非编码RNA
预后
LINC01980
MIR99AHG
Keywords
oral squamous cell carcinoma
lncRNA
prognosis
LINC01980
MIR99AHG
分类号
R739.8 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
腭裂治疗中有限元方法的应用进展
3
作者
张萌
马坚
机构
宁夏
医科大学口腔医学院
宁夏
医科大学总医院口腔医院
宁夏颅颌面畸形研究重点实验室
出处
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期679-683,共5页
基金
宁夏重点研发项目(编号:2022BEG03159)。
文摘
腭裂是人类常见的口腔颌面部先天性畸形。腭裂的治疗主要以外科手术修复为主,现行腭裂手术术式虽多,但是术后仍有部分患者出现腭瘘、上颌骨发育不足及腭咽闭合不全等并发症。有限元方法应用于腭裂,通过模拟手术和力学分析的方式来预测临床预后、改良手术术式。本文就有限元方法在腭裂治疗中的应用进展,从腭裂治疗的现状、有限元的应用原理及其在腭裂手术模拟和手术预后评价中的应用进行综述,以期为有限元方法在腭裂治疗中的进一步应用提供帮助。
关键词
腭裂
有限元分析
手术模拟
上颌骨
腭咽闭合不全
腭瘘
Keywords
cleft palate
finite element method
surgical simulation
maxilla
velopharyngeal insufficiency
palatal fistula
分类号
R782.22 [医药卫生—口腔医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单细胞转录组测序在头颈部鳞状细胞癌研究中的应用进展
刘海岩
马坚
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
口腔鳞状细胞癌预后相关的长链非编码RNA筛选及验证
刘絮影
李锦存
翟堃
胡晨
董文
马坚
《口腔医学研究》
北大核心
2025
0
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职称材料
3
腭裂治疗中有限元方法的应用进展
张萌
马坚
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
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