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基于16S rRNA测序分析CRE定植对ICU患者肠道微生物的影响
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作者 康佳 赵志军 贾伟 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1239-1245,共7页
目的 采用16S rRNA测序方法分析耐碳青霉烯类肠杆菌(CRE)定植对重症监护病房(ICU)患者肠道微生物的影响。方法 收集ICU患者新鲜粪便或肛拭子标本,接种于含有2μg/mL厄他培南的MacConkey平板上培养。采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质... 目的 采用16S rRNA测序方法分析耐碳青霉烯类肠杆菌(CRE)定植对重症监护病房(ICU)患者肠道微生物的影响。方法 收集ICU患者新鲜粪便或肛拭子标本,接种于含有2μg/mL厄他培南的MacConkey平板上培养。采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对菌株进行鉴定,纸片扩散法对菌株进行药敏分析,采用聚合酶链式反应(PCR)对初步筛查出的CRE菌株进行16S rDNA片段扩增,采用微量肉汤稀释法进一步确定CRE。最后,分别提取CRE定植组与非定植组患者的粪便或肛拭子标本基因组DNA在HiSeq平台进行16S rRNA测序分析。结果 共收集ICU患者粪便或肛拭子标本241份,其中CRE阳性标本17份。16S扩增子V3~V4区测序共分离到726 OTUs, CRE未定植组有631 OTUs, CRE定植组有480 OTUs,两组间共有385 OTUs。这些共有OTUs绝大多数属于厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、疣微菌门及放线菌门。在纲水平上,CRE定植前后γ-变形菌纲(W=193.000,P<0.001,FDR=0.004)和互营养菌(W=37.500,P=0.001,FDR=0.018)相对丰度差异有统计学意义。在种水平上,两组间肺炎克雷伯菌(W=195.000,P<0.001)、解糖肠球菌(W=153.000,P=0.038)及弯曲杆菌(W=63.500,P=0.050)比较差异有统计学意义。未发现肠道CRE定植对ICU患者肠道微生物KEGG功能通路有显著影响。结论 CRE定植会降低ICU患者肠道微生物的多样性,CRE定植组在肺炎克雷伯菌、解糖肠球菌及弯曲杆菌的丰度上与非定植组存在显著差异。 展开更多
关键词 肠道微生物 CRE 定植 16S rRNA测序 重症监护病房 ICU
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宁夏某三甲医院28例尿路感染耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌分子流行特征及耐药性分析
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作者 闫丽新 朱晨宇 +3 位作者 陶佳 洪炜 胡欣欣 贾伟 《中国抗生素杂志》 北大核心 2025年第7期816-824,共9页
目的探讨宁夏医科大学总医院尿路感染碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)的分子流行特点及其耐药性和同源性,为其治疗提供参考依据。方法收集2013年12月—2022年11月住院患者尿路感染CRE28株,使... 目的探讨宁夏医科大学总医院尿路感染碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)的分子流行特点及其耐药性和同源性,为其治疗提供参考依据。方法收集2013年12月—2022年11月住院患者尿路感染CRE28株,使用WHONET 5.6软件统计菌株分布、耐药性;应用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法检4种碳青霉烯酶基因(blaKPC、blaNDM、blaOXA-48和blaIMP);应用Sanger测序分析亚型;应用多克隆序列位点测定(multilocus sequence typing,MLST)方法检测菌株克隆型别;通过接合试验验证耐药基因转移性。结果尿路感染的28株CRE主要为肺炎克雷伯菌11株(39.30%)和大肠埃希菌9株(32.14%),主要分离自急诊科住院患者。药敏结果显示对多种常见抗生素耐药率≥50%,检出耐药基因为blaNDM和blaKPC,以blaNDM-5(77.27%)型为主。质粒接合试验结果显示携带blaNDM-5基因的7株大肠埃希菌和3株肺炎克雷伯菌可以成功地将其对碳青霉烯类耐药表型转移到受体菌大肠埃希菌EC600菌株中。11株肺炎克雷伯菌和9株大肠埃希菌MLST结果显示共有18种ST型别,提示克隆类型多样化,聚类分析显示同一病房菌株亲缘关系较近。结论该院尿路感染CRE菌株多为肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌,对碳青霉烯类药物的耐药机制主要是产NDM-5型碳青霉烯酶。blaNDM-5基因可通过质粒进行水平播散,应引起临床高度重视,密切监测CRE菌株防止耐药基因的进一步传播,以防医院内暴发流行。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌 尿路感染 NDM-5 多位点序列分型 质粒接合
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北京和宁夏地区2家医院临床分离气单胞菌属的临床分布和耐药性分析
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作者 陶佳 陈素明 +7 位作者 王文 李刚 王欢 王亮 马婷婷 曲芬 贾伟 王利茹 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1107-1113,共7页
目的了解北京和宁夏地区2家医院(解放军总医院第五医学中心和宁夏医科大学总医院)临床分离气单胞菌属的分布特点及耐药性,为临床治疗和防控气单胞菌属感染提供参考。方法回顾性分析2013—2022年间2家医院临床分离气单胞菌属感染患者的... 目的了解北京和宁夏地区2家医院(解放军总医院第五医学中心和宁夏医科大学总医院)临床分离气单胞菌属的分布特点及耐药性,为临床治疗和防控气单胞菌属感染提供参考。方法回顾性分析2013—2022年间2家医院临床分离气单胞菌属感染患者的年龄、性别、菌种分布、标本类型分布和耐药率等,使用Whonet5.6软件和Graphpad Prism 8软件进行统计分析。结果10年间2家医院分离气单胞菌属细菌共541株,分别为198株和343株,感染患者均是男性多于女性,年龄多为50岁以上的中老年人。2家医院检出的气单胞菌属中均以嗜水气单胞菌为主,其次为豚鼠气单胞菌、维隆气单胞菌温和亚种,其他检出的菌种包括维隆气单胞菌维隆亚种、杀鲑气单胞菌和斑点气单胞菌。541株气单胞菌的标本来源主要为胆汁和血液,分别占31.98%和19.78%,其他标本类型包括痰液、引流液、分泌物等。2家医院气分离单胞菌属的标本类型有统计学差异,解放军总医院第五医学中心前五位的标本类型为血液、粪便、腹水、胆汁和引流液,宁夏医科大学总医院的标本类型主要为胆汁、痰液、分泌物、引流液、血液。气单胞菌属对碳青霉烯类、氨基糖苷类、喹诺酮类抗菌药物的耐药率均较低,3种气单胞菌均未检测到阿米卡星耐药的菌株。豚鼠气单胞菌对头孢类及单环类抗菌药物的耐药率在宁夏医科大学总医院明显高于解放军总医院第五医学中心。结论2家医院检出的气单胞菌属的菌种组成类似,但在临床分布及耐药性间均存在差异性,每个医院都需要监测本地区气单胞菌的流行情况及耐药性,为气单胞菌的诊疗提供参考。 展开更多
关键词 气单胞菌属 菌种分布 临床分布 耐药性
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1987—2023年中国区域犬感染弓形虫的空间流行病学分析 被引量:1
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作者 苏雅静 林雪 +2 位作者 梁小燕 张晨 薛頔 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第2期121-128,共8页
目的 刚地弓形虫是一种全球广泛分布的胞内原生动物病原体,犬类被认为是人类感染弓形虫的潜在危险因素。本研究旨在系统分析1987—2023年中国区域犬弓形虫感染的流行病学特征,以期为我国刚地弓形虫的预防和控制提供科学依据。方法 通过P... 目的 刚地弓形虫是一种全球广泛分布的胞内原生动物病原体,犬类被认为是人类感染弓形虫的潜在危险因素。本研究旨在系统分析1987—2023年中国区域犬弓形虫感染的流行病学特征,以期为我国刚地弓形虫的预防和控制提供科学依据。方法 通过PubMed、中国知网(CNKI)、万方数据库和百度学术数据库检索1987—2023年中国区域犬弓形虫流行病学数据,并利用Excel建立数据库。ArcGIS 10.2软件对犬弓形虫流行病学数据进行可视化展现。统计分析采用SPSS 26.0软件,采用χ2检验进行组间差异的比较,以P<0.05为差异有统计学意义。结果 1987—2023年,中国犬感染弓形虫的血清阳性率总体呈平稳趋势,犬弓形虫血清抗体总阳性率为13.97%。其中,云南省的犬弓形虫血清阳性率居全国之首,高达27.65%,而陕西省的犬弓形虫血清阳性率则较低,仅为0.56%,各省份间差异具有统计学意义(P<0.05)。全国34个省级行政区中,部分地区未见犬弓形虫流行病学数据。西南地区的犬弓形虫血清阳性率显著高于其他地区(P<0.05)。对比1987—2004年和2005—2023年2个时期的犬弓形虫血清阳性率,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 犬弓形虫感染在我国分布广泛,流行周期稳定。应采相应防控措施,加强相关疫情监测,提高公众对弓形虫病的防控知识普及,以降低弓形虫病的传播风险,保障公共健康安全。 展开更多
关键词 弓形虫 空间流行病学 动态 GIS技术
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宁夏细菌耐药监测网2015年细菌耐药监测数据分析 被引量:6
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作者 赵梅 李莎莎 +4 位作者 周晓燕 王文 马红 伏慧 李刚 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期541-547,共7页
目的对宁夏细菌耐药监测网成员单位2015年度临床分离细菌分布及耐药情况进行统计分析,为本省临床合理使用抗菌药物提供理论依据。方法各成员单位临床分离菌株,采用标准纸片扩散法或自动化仪器检测法,按照统一技术方案测定监测药物对细... 目的对宁夏细菌耐药监测网成员单位2015年度临床分离细菌分布及耐药情况进行统计分析,为本省临床合理使用抗菌药物提供理论依据。方法各成员单位临床分离菌株,采用标准纸片扩散法或自动化仪器检测法,按照统一技术方案测定监测药物对细菌的敏感性,依据CLSI 2014年标准,用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果共有30家医院参加了2015年度细菌耐药监测工作,其中数据基本合格纳入分析的共20家。按患者首次分离菌株进行统计分析,共收集细菌25234株,其中革兰阴性菌18412株(72.97%),革兰阳性菌6822株(27.03%)。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌(MRCNS)的检出率分别为38.6%和77.3%,未发现万古霉素和利奈唑胺不敏感的葡萄球菌。万古霉素耐药粪肠球菌和屎肠球菌分别为1.7%和1.2%。按非颅内感染的折点判断,耐青霉素肺炎链球菌比例为8%。革兰阴性菌中分离率前3位分别为大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和鲍曼不动杆菌,分别为5469株(21.67%)、4609株(18.26%)和1843株(7.3%)。大肠埃希菌耐药比较突出,对喹诺酮类耐药率在50.0%以上,肠杆菌科细菌对碳青霉烯类抗菌药物总耐药率低于10.0%。铜绿假单胞菌对碳青霉烯类、氨基糖苷类、哌拉西林/三唑巴坦、头孢吡肟、头孢哌酮/舒巴坦和头孢他啶的耐药率低于15.0%,鲍曼不动杆菌对包括碳青霉烯类在内的大多数监测药物耐药率超过50.0%,亚胺培南的耐药率为65%。结论我省细菌耐药整体较全国水平较低,但多重耐药和广泛耐药菌株检出仍对临床治疗造成严重威胁,应充分利用本地细菌耐药监测结果进行感控管理,促进抗菌药物合理使用。 展开更多
关键词 细菌耐药性监测 耐药率 细菌感染
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Camp在小鼠肺癌进展中的作用及TGF-β/Smad通路介导EMT的分子机制研究
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作者 吴军录 李亚然 +1 位作者 王林云 李锋 《中国病理生理杂志》 北大核心 2025年第5期861-870,共10页
目的:研究cathelicidin相关抗菌肽(Camp)基因在小鼠肺肿瘤中的作用,揭示其在调控上皮-间充质转化(EMT)及TGF-β/Smad信号通路中的分子机制。方法:采用Camp基因敲除的Kras^(G12D)自发肺癌小鼠模型,通过组织学检测和生存分析来评估Camp对... 目的:研究cathelicidin相关抗菌肽(Camp)基因在小鼠肺肿瘤中的作用,揭示其在调控上皮-间充质转化(EMT)及TGF-β/Smad信号通路中的分子机制。方法:采用Camp基因敲除的Kras^(G12D)自发肺癌小鼠模型,通过组织学检测和生存分析来评估Camp对小鼠肺肿瘤结节数量、体积和生存率的影响。在细胞水平,构建A549^(-Camp)和H1975-Camp细胞株,运用软琼脂集落形成实验、细胞划痕愈合实验和Transwell侵袭实验来评估Camp对肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响,并进行血管形成实验以评估血管生成情况。在分子水平上,利用qRT-PCR检测血管生成相关因子VEGF、bFGF及TGF-β的表达;Western blot检测EMT相关蛋白(E-cadherin、N-cadherin及Snail)和TGF-β/Smad信号通路相关蛋白(TGF-β、p-TGF-β、Smad3和Smad7)的表达。结果:Camp基因敲除显著抑制小鼠肺肿瘤的生长,减少肿瘤结节的数量和体积,并提高小鼠的生存率。体外实验显示,Camp过表达促进了肺腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭。分子机制研究表明,Camp通过调节TGF-β/Smad信号通路,影响了EMT相关蛋白的表达。结论:Camp基因能促进肺肿瘤进展,其通过调节TGF-β/Smad信号通路和EMT过程,增强肺腺癌细胞的恶性行为。 展开更多
关键词 cathelicidin相关抗菌肽 上皮-间充质转化 肺癌 血管生成
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犬细小病毒宁夏株的分离与鉴定
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作者 杨丽 段相国 +4 位作者 刘宏鹏 徐广贤 郭文伟 张议心 赵瑾 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2015年第11期55-57,共3页
本试验采集宁夏地区疑似犬细小病毒感染病犬的粪便拭子,经过预处理后同步接种胎猫肾细胞(FK81),盲传3代后发现FK81细胞出现明显的细胞毒性改变(CPE)。冻融收获病毒后,对分离出来的病毒进行电镜观察、间接免疫荧光试验(IFA)检测、特异性... 本试验采集宁夏地区疑似犬细小病毒感染病犬的粪便拭子,经过预处理后同步接种胎猫肾细胞(FK81),盲传3代后发现FK81细胞出现明显的细胞毒性改变(CPE)。冻融收获病毒后,对分离出来的病毒进行电镜观察、间接免疫荧光试验(IFA)检测、特异性PCR鉴定及VP2全基因序列扩增分析,成功分离培养出1株犬细小病毒(CPV)。 展开更多
关键词 犬细小病毒 分离鉴定 FK81 VP2基因
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弓形虫RH株ROP16 I蛋白通过JAK-STAT3途径对MH-S细胞增殖及细胞周期影响的研究
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作者 李佳铭 党甜甜 +1 位作者 殷荷 赵志军 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第2期113-120,共8页
目的 探究I型弓形虫RH株ROP16蛋白对小鼠肺泡巨噬细胞株MH-S细胞增殖及细胞周期的影响和机制。方法 将ROP16 I过表达慢病毒感染MH-S细胞后经嘌呤霉素筛选获得稳定表达ROP16 I的过表达细胞株。RT-qPCR和Western-blot验证过表达效果,cck-... 目的 探究I型弓形虫RH株ROP16蛋白对小鼠肺泡巨噬细胞株MH-S细胞增殖及细胞周期的影响和机制。方法 将ROP16 I过表达慢病毒感染MH-S细胞后经嘌呤霉素筛选获得稳定表达ROP16 I的过表达细胞株。RT-qPCR和Western-blot验证过表达效果,cck-8检测细胞增殖活性,流式细胞术检测细胞周期变化。Western-blot及RT-qPCR检测p53、p21、CDK6、Cyclin D1、STAT3、p-STAT3(Y705)及JAK1蛋白或基因的表达水平,免疫荧光检测ROP16 I与p-STAT3(Y705)在MH-S细胞中的亚细胞共定位。结果 ROP16 I过表达慢病毒感染MH-S细胞后可检测到ROP16 I蛋白及基因表达。cck-8检测发现ROP16 I可促进MH-S细胞增殖(P<0.01),提升细胞活力。流式细胞术检测发现ROP16 I过表达可使MH-S细胞细胞周期G0/G1期降低,G2期、S期升高。相较于MH-S细胞组、MH-S-vector组,MH-S-ROP16细胞组p53及p21蛋白表达降低,CDK6、Cyclin D1、p-STAT3(Y705)及JAK1蛋白表达升高,p53及p21 mRNA表达降低,CDK6及Cyclin D1 mRNA表达升高(均P<0.01)。免疫荧光检测发现ROP16 I与p-STAT3(Y705)共同定位于细胞核及其周围细胞质中。结论 I型弓形虫RH株ROP16蛋白可激活JAK-STAT3途径,诱导细胞周期G0/G1期缩短,G2/S期延长,促进细胞增殖,为揭示弓形虫的免疫逃避机制提供了理论依据,为弓形虫肺炎防治研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 ROP16蛋白 MH-S细胞 细胞周期 STAT3 p-STAT3(Y705)
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碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的耐药性及毒力特征的分子生物学研究 被引量:11
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作者 师志云 马苗 +8 位作者 尹晓丽 王良方 侯晓慧 张玉英 李刚 王文 陶佳 李莎莎 贾伟 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期725-731,共7页
目的了解宁夏医科大学总医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及毒力特征。方法收集2015年1月—2019年12月分离的CRKP 103株,采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合EDTA改良碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测产碳青霉烯酶表... 目的了解宁夏医科大学总医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及毒力特征。方法收集2015年1月—2019年12月分离的CRKP 103株,采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合EDTA改良碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测产碳青霉烯酶表型,PCR分子生物学技术检测碳青霉烯酶等耐药基因以及荚膜血清型、毒力基因,多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对碳青霉烯类耐药高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)进行同源性分析。结果103株CRKP对临床常见抗菌药物表现为不同程度的耐药,mCIM联合eCIM试验结果显示94株CRKP产碳青霉烯酶,其中67.0%产金属酶,33.0%产丝氨酸碳青霉烯酶。耐药基因检出率依次为blaNDM 50.5%(52/103)、bla_(KPC)33.0%(34/103)、bla_(OXA-48)22.3%(23/103)、bla_(IMP)10.7%(11/103)。18种ST型中以ST11型35.3%(36/102)及ST76型22.5%(23/102)为主。CR-hvKP 10株,其中仅4株为荚膜血清K1型、10株均为菌毛黏附基因fim-H和铁载体相关基因ent-B携带者。10株CRhvKP菌株PFGE同源性分析显示以D族群居多,亲缘性接近;未发现同一病区同一时间段的暴发流行。结论该院CRKP菌株以产NDM-5型碳青霉烯酶为主,ST11型为优势流行株。已发现9.7%的CRKP为CR-hvKP菌株,应当引起临床和院感相关部门的重视,防止暴发流行。 展开更多
关键词 碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌 耐药机制 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 毒力特征
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2011—2020年宁夏医科大学总医院临床分离5种常见革兰阴性杆菌耐药性监测 被引量:9
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作者 王文 杨丹 +5 位作者 陶佳 王亮 李刚 赵梅 刘文淼 贾伟 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期356-363,共8页
目的回顾分析2011—2020年宁夏医科大学总医院临床分离5种常见革兰阴性杆菌的分布和耐药性。方法收集十年间宁夏医科大学总医院临床分离的革兰阴性杆菌药敏试验结果资料,采用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果十年间共分离革兰阴性杆菌5... 目的回顾分析2011—2020年宁夏医科大学总医院临床分离5种常见革兰阴性杆菌的分布和耐药性。方法收集十年间宁夏医科大学总医院临床分离的革兰阴性杆菌药敏试验结果资料,采用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果十年间共分离革兰阴性杆菌59312株,居前5位的分别为大肠埃希菌(25.4%)、肺炎克雷伯菌(17.8%)、鲍曼不动杆菌(15.7%)、铜绿假单胞菌(13.3%)和阴沟肠杆菌(6.4%)。菌株的样本来源主要为呼吸道样本(48.6%)、尿液(9.7%)、伤口脓液(9.0%)、血液(7.6%)、胆汁(6.2%)等。上述5种细菌对亚胺培南的耐药率分别为0~1.9%、0.1%~7.6%、54.6%~85.0%、14.6%~26.6%、1.0%~12.6%。大肠埃希菌、铜绿假单胞菌对多数抗菌药物的耐药率有降低趋势,肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、阴沟肠杆菌的耐药率基本保持稳定。不同样本来源的同种细菌对抗菌药物的耐药率有差异。结论历年碳青霉烯类耐药的革兰阴性杆菌检出率有上升趋势,给临床治疗带来困难,进一步加强抗菌药物的合理应用和管理,提高细菌耐药监测力度,以防止医院感染的发生。 展开更多
关键词 革兰阴性杆菌 抗菌药物 细菌耐药性 耐药监测
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犬咬伤后罕见病原菌致伤口感染1例 被引量:5
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作者 郭睿 周晓燕 +3 位作者 赵梅 殷国民 贾伟 李刚 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期89-91,共3页
犬咬伤可导致软组织损伤,由于犬口腔内细菌含量较高,咬伤后易引起伤口化脓性感染,形成蜂窝织炎,致皮下、筋膜下和肌间等处的疏松结缔组织的弥漫性化脓性炎症,严重者可危及生命[1]。本院微生物实验室于2019年2月6日从犬咬伤患者伤口分泌... 犬咬伤可导致软组织损伤,由于犬口腔内细菌含量较高,咬伤后易引起伤口化脓性感染,形成蜂窝织炎,致皮下、筋膜下和肌间等处的疏松结缔组织的弥漫性化脓性炎症,严重者可危及生命[1]。本院微生物实验室于2019年2月6日从犬咬伤患者伤口分泌物中同时分离出动物溃疡伯杰菌、羊链球菌和口腔巴斯德菌3种临床罕见菌株,并对目前国内外以上3种菌株感染案例报道进行汇总,以提高对3种菌株及其感染特征的认识,为临床诊断及治疗提供参考。 展开更多
关键词 动物咬伤 动物溃疡伯杰菌 口腔巴斯德菌 羊链球菌
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2017年宁夏医科大学总医院细菌耐药性监测 被引量:4
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作者 王文 陶佳 +3 位作者 李刚 赵梅 刘文淼 贾伟 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期534-540,共7页
目的对2017年宁夏医科大学总医院细菌分布及耐药情况进行统计、分析,为临床合理使用抗菌药物提供实验室依据。方法对临床分离菌株,采用标准纸片扩散法或自动化仪器检测法,测定细菌对临床常用抗菌药物的敏感性。依据CLSI 2017年标准,用WH... 目的对2017年宁夏医科大学总医院细菌分布及耐药情况进行统计、分析,为临床合理使用抗菌药物提供实验室依据。方法对临床分离菌株,采用标准纸片扩散法或自动化仪器检测法,测定细菌对临床常用抗菌药物的敏感性。依据CLSI 2017年标准,用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果共收集细菌9 122株,其中革兰阴性菌6 747株(74.0%),革兰阳性菌2 375株(26.0%)。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和凝固酶阴性葡萄球菌(MRCNS)分别占各自菌的30.3%和87.4%。发现2株万古霉素耐药屎肠球菌。肺炎链球菌非脑膜炎分离株中青霉素敏感株(PSSP)的比例成人为97.8%,儿童为100%。碳青霉烯类耐药大肠埃希菌(CR-ECO)、肺炎克雷伯菌(CR-KPN)、鲍曼不动杆菌(CRABA)、铜绿假单胞菌(CR-PAE)分别占各自菌1.6%、5.1%、82.4%、18.0%。肠杆菌科细菌对亚胺培南、阿米卡星、哌拉西林-他唑巴坦较敏感,耐药率均低于10%。鲍曼不动杆菌对大多抗菌药物的耐药率较高,在50%以上。铜绿假单胞菌比较敏感,耐药率在20%以下。流感嗜血杆菌中β内酰胺酶阳性率为25.2%。结论该院细菌耐药整体较全国水平低,但碳青霉烯类耐药革兰阴性菌比例不断上升,给临床治疗带来了挑战。应加强抗菌药物的管理,做好细菌耐药的监测工作,防止细菌耐药性的传播。 展开更多
关键词 细菌耐药性监测 甲氧西林耐药葡萄球菌 万古霉素耐药肠球菌 青霉素耐药肺炎链球菌 碳青霉烯类耐药革兰阴性菌
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基于生物信息学探讨弓形虫ROP16_Ⅰ对A549细胞表达谱的影响 被引量:3
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作者 苏雅静 乔霞 +3 位作者 刘学雷 杨宁爱 贾伟 赵志军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期957-963,972,共8页
目的采用生物信息学对ROP16 Ⅰ基因转染的A549细胞株的表达谱芯片结果进行数据挖掘,寻找影响Ⅰ型弓形虫疾病的差异表达基因,为揭示Ⅰ型弓形虫疾病的发病机制提供依据。方法通过生物信息学方法对过表达ROP16 Ⅰ的A549细胞株的表达谱进行... 目的采用生物信息学对ROP16 Ⅰ基因转染的A549细胞株的表达谱芯片结果进行数据挖掘,寻找影响Ⅰ型弓形虫疾病的差异表达基因,为揭示Ⅰ型弓形虫疾病的发病机制提供依据。方法通过生物信息学方法对过表达ROP16 Ⅰ的A549细胞株的表达谱进行研究,从中筛选差异表达基因。将得到的数据导入在线分析工具ToppGene和STRING中对差异表达基因进行筛选,同时进行GO 分析及KEGG分析。结果本研究共获得了483个差异表达基因,其中上调的基因共有252个,下调的基因共有231个。ToppGene最终筛选得到CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等14个Ι型弓形虫相关的基因。GO分析和KEGG分析发现,这些候选基因与白介素IL-10、IL-4、IL-13信号通路,细胞因子-细胞因子受体相互作用通路及Toll样受体信号通路等相关。在蛋白-蛋白互作网络中,这14个候选基因恰好处于网络的最核心位置。结论Ι型弓形虫疾病的发生可能与CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等基因密切相关。 展开更多
关键词 ROP16 弓形虫 表达谱 生物信息
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宁夏地区纹带棒杆菌感染临床特点及耐药性分析
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作者 李刚 刘俊枫 +5 位作者 王文 马红 赵梅 姚琳芳 顾常梅 贾伟 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1091-1095,共5页
目的分析宁夏地区纹带棒杆菌(Corynebacterium striatum)感染的临床特点及耐药情况。方法收集宁夏医科大学总医院2019年4月—2020年6月临床标本中分离的纹带棒杆菌,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)鉴定到种,采用... 目的分析宁夏地区纹带棒杆菌(Corynebacterium striatum)感染的临床特点及耐药情况。方法收集宁夏医科大学总医院2019年4月—2020年6月临床标本中分离的纹带棒杆菌,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)鉴定到种,采用美国临床和实验室标准协会(CLSI)推荐的微量肉汤稀释法测定12种抗菌药物的最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)值,并回顾性分析感染患者临床特点。结果65例纹带棒杆菌感染男性42例(64.6%),≥60岁23例(35.4%),感染主要集中在肺部(50例,76.9%),以神经科(37例,56.9%)和烧伤整形科(12例,18.5%)为主;多数有肺部感染(61例,93.8%)和神经系统(49例,75.3%)基础疾病;进行机械通气、气管插管有创操作60例(92.3%);对青霉素、头孢曲松、美罗培南、红霉素、环丙沙星、克林霉素耐药率在92.3%~100%;对利福平和复方磺胺甲恶唑耐药率在32.3%~47.7%;四环素与庆大霉素的耐药率较低,仅为10.8%和4.6%;对万古霉素、利奈唑胺均敏感。结论纹带棒杆菌感染多发生于有肺部感染和神经系统疾病的男性患者,进行机械通气、气管插管操作易促成该菌感染,万古霉素、利奈唑胺对其仍具有很好的抗菌活性。 展开更多
关键词 纹带棒杆菌感染 临床特点 耐药性
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中国地区家猫弓形虫流行病学特征及空间聚集性研究 被引量:2
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作者 苏雅静 林雪 +2 位作者 张晨 薛頔 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期913-921,共9页
目的了解我国家猫弓形虫感染状况和空间分布特征,以期为刚地弓形虫的预防和控制提供科学依据。方法本研究基于PubMed、中国知网CNKI、万方数据库及百度学术数据库选择性文献调查检索,检索截至2023年12月31日发表的关于中国地区家猫弓形... 目的了解我国家猫弓形虫感染状况和空间分布特征,以期为刚地弓形虫的预防和控制提供科学依据。方法本研究基于PubMed、中国知网CNKI、万方数据库及百度学术数据库选择性文献调查检索,检索截至2023年12月31日发表的关于中国地区家猫弓形虫血清流行率的调查研究。应用地理信息系统(Geographical information systems,GIS)对中国地区家猫弓形虫感染状况进行空间定位与表达。采用SPSS 26.0软件统计分析。结果本研究共纳入1984年至2023年间发表的86项符合条件的研究,涵盖28个省级行政区,涉及20722只猫。ArcGIS分级统计结果显示,我国家猫弓形虫血清抗体总阳性率为14.78%(3080/20836,95%CI:14.07%~15.03%)。西藏自治区、天津市、海南省、香港特别行政区、澳门特别行政区和台湾省至今尚未见猫弓形虫流行病学调查研究。猫弓形虫血清抗体阳性率最高的地区是山西省(60%,54/90,95%CI:49.82%~70.18%),其次是河北省(57.33%,43/75,95%CI:46.07%~68.59%)、河南省(45.53%,173/380,95%CI:40.52%~50.54%)和云南省(43.64%,24/55,95%CI:30.49%~56.79%),而弓形虫血清抗体阳性率最低的地区是江西省(2.47%,2/81,95%CI:-0.90%~5.90%)。我国北方地区的猫弓形虫血清抗体阳性率为14.12%(2044/14481,95%CI:12.34%~15.90%),而南方地区的阳性率为16.30%(1036/6355,95%CI:15.40%~17.20%),两者间有统计学差异(χ^(2)=16.60,P<0.05)。此外,时间分布结果显示,1984-2023年我国猫弓形虫血清抗体阳性率总体呈下降趋势。结论弓形虫在我国家猫中广泛传播,流行周期稳定且不同地区之间差异很大。由于宠物猫在我国日益流行,以及这些猫与人类之间的亲密关系可能会带来重大的暴露风险。因此,养猫与人类弓形虫感染之间的联系,以及如何减少人类通过猫接触弓形虫和猫弓形虫卵囊污染环境,需要进一步研究。 展开更多
关键词 弓形虫 流行病学 中国 GIS技术
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弓形虫ROP16Ⅰ/Ⅲ蛋白激活STAT3磷酸化调节THP-1细胞周期、增殖及凋亡 被引量:1
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作者 殷荷 马磊 +4 位作者 党甜甜 李佳铭 田婷婷 马珊妮 赵志军 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期1115-1121,1127,共8页
目的探讨弓形虫ROP16Ⅰ/Ⅲ蛋白通过激活STAT3磷酸化对THP-1细胞周期、增殖及凋亡的影响。方法将ROP16空载体及重组慢病毒过表达载体分别转染至THP-1细胞,观察细胞荧光表达强度并验证过表达效果;通过Western blotting检测过表达ROP16Ⅰ/... 目的探讨弓形虫ROP16Ⅰ/Ⅲ蛋白通过激活STAT3磷酸化对THP-1细胞周期、增殖及凋亡的影响。方法将ROP16空载体及重组慢病毒过表达载体分别转染至THP-1细胞,观察细胞荧光表达强度并验证过表达效果;通过Western blotting检测过表达ROP16Ⅰ/Ⅲ的THP-1细胞中STAT3及P-STAT3蛋白的表达;利用STAT3磷酸化抑制剂-Stattic干预细胞,分为THP-1组、THP-1+Stattic组、THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ组及THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ+Stattic组;通过流式细胞术和CCK-8法检测各组细胞周期、增殖曲线以及凋亡率的改变;Western blotting检测细胞凋亡相关蛋白Bax、Cleaved Caspase3、Caspase9及Bcl-2蛋白表达水平。结果ROP16重组慢病毒过表达载体转染THP-1细胞后观察到强荧光信号,ROP16 mRNA及蛋白表达水平均显著升高(FmRNA=314.1,F蛋白=758.7,均P<0.001),表明细胞稳转株构建成功,且THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ组细胞中P-STAT3蛋白的表达水平较THP-1组升高(F=606.1,P<0.001)。流式细胞术和CCK-8结果显示,与THP-1组比较,THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ组细胞周期被阻滞在G1期,细胞增殖能力降低(tⅠ组=19.2,tⅢ组=24.0,均P<0.01)、凋亡率增加(tⅠ组=175.1,tⅢ组=205.2,均P<0.001)。Western blotting结果显示,与THP-1组比较,THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ组细胞内促凋亡蛋白Bax、Cleaved Caspases3、Caspase9的表达均显著升高(tBaxⅠ组=15.8,tBaxⅢ组=11.1,tCaspase9Ⅰ组=9.1,tCaspase9Ⅲ组=10.2,tCleaved Caspase3Ⅰ组=16.5,tCleaved Caspase3Ⅲ组=12.9,均P<0.001),抗凋亡蛋白Bcl-2表达明显降低(tⅠ组=18.4,tⅢ组=26.2,均P<0.001)。但在Stattic干预后,THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ+Stattic组细胞周期、增殖能力、凋亡率及凋亡相关蛋白的表达均恢复至接近原水平。结论弓形虫ROP16Ⅰ/Ⅲ蛋白通过激活STAT3磷酸化进而将THP-1细胞周期阻滞在G1期、抑制细胞增殖并促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 ROP16蛋白 THP-1细胞 细胞周期 细胞增殖 细胞凋亡
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抗幽门螺杆菌UreB重组全人源化单域抗体的基因工程表达及分子改造
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作者 王雪芳 赵阳 +3 位作者 刘竹青 郭乐 仲飞亮 罗学刚 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期666-672,共7页
为了构建针对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)脲酶的单域抗体的基因工程表达系统。首先利用Pymol、ITASSER和ClussPro2等AI辅助工具分析比较了不同抗体与Hp脲酶亚单位B(UreB)之间的分子间作用力,确定了VL全人源化单域抗体UreBAb作... 为了构建针对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)脲酶的单域抗体的基因工程表达系统。首先利用Pymol、ITASSER和ClussPro2等AI辅助工具分析比较了不同抗体与Hp脲酶亚单位B(UreB)之间的分子间作用力,确定了VL全人源化单域抗体UreBAb作为重点研究对象。根据大肠埃希菌密码子偏好性优化了UreBAb基因序列,并将其分别插入pET28a、pE-SUMO等表达载体,转化大肠埃希菌Rosetta(DE3)获得了重组表达菌株,通过IPTG诱导制备重组抗体蛋白,并利用提取的Hp脲酶作为抗原,分析验证了重组表达抗体的活性。SDS-PAGE检测结果显示UreBAb和SUMO-UreBAb均获得了正确的表达,纯化后的蛋白产率分别为0.34和0.41 mg/mL。单向免疫扩散实验结果证实这两种重组表达抗体均与Hp UreB抗原具有良好的亲和力,对脲酶的抑制率分别为51.27%和74.07%。进而,结合AlphaFold2、cluspro2、mCSM-AB、OSPREY和FoldX等人工智能工具,评估分析了影响抗原-抗体复合物稳定性的关键位点及其突变策略,随后进一步构建了9个UreBAb进化突变体表达菌株,活性分析结果显示,这些突变体与抗原的结合活性均得到了提高,其中以I107W突变体的活性提升最为显著,相较于野生型UreBAb,提高了24.95%。本研究为Hp全人源化单域抗体的开发奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 脲酶 全人源化单域抗体 基因工程 AI辅助分子改造
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产吲哚金黄杆菌感染患者的临床特征及耐药分析
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作者 郭琴琴 续超 +2 位作者 伏慧 李刚 贾伟 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期579-583,共5页
目的分析本院送检标本培养出产吲哚金黄杆菌患者的临床特征及药物敏感情况,为产吲哚金黄杆菌临床治疗提供科学依据。方法收集我院2016年1月-2022年12月收治的36例产吲哚金黄杆菌,分析感染患者的临床特征、细菌学特征及药敏情况,并进行... 目的分析本院送检标本培养出产吲哚金黄杆菌患者的临床特征及药物敏感情况,为产吲哚金黄杆菌临床治疗提供科学依据。方法收集我院2016年1月-2022年12月收治的36例产吲哚金黄杆菌,分析感染患者的临床特征、细菌学特征及药敏情况,并进行统计学分析。结果36例患者中,有94.4%的人在送检前使用过广谱抗生素,50%的人进行过有创性操作。产吲哚金黄杆菌从呼吸道标本中分离最多为38.9%。药敏试验显示该菌对复方磺胺甲恶唑的敏感性最高(88.9%),对其他抗生素的敏感性分别为左氧氟沙星(69.5%)、环丙沙星(50%)、哌拉西林/他唑巴坦(47.2%),对其他抗菌药物(40.0%)以下。结论产吲哚金黄杆菌为多重耐药菌株,主要引起呼吸道感染,尤其常见于有基础疾病及长期使用广谱抗生素的患者中,临床应密切关注。 展开更多
关键词 产吲哚金黄杆菌 耐药率 抗生素
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临床分离大肠埃希菌多重耐药菌株与外膜蛋白的相关研究 被引量:7
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作者 董辉 钟利 +2 位作者 林茹 赵慧峥 赵志军 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期369-373,共5页
目的了解临床分离大肠埃希菌对临床常用抗菌药物的耐药情况,并探讨其外膜蛋白与耐药性的相关性。方法收集2013年全年宁夏医科大学总医院及其分院患者标本中分离的大肠埃希菌共1058株,统计分析其标本来源和科室构成,纸片扩散法测定6种常... 目的了解临床分离大肠埃希菌对临床常用抗菌药物的耐药情况,并探讨其外膜蛋白与耐药性的相关性。方法收集2013年全年宁夏医科大学总医院及其分院患者标本中分离的大肠埃希菌共1058株,统计分析其标本来源和科室构成,纸片扩散法测定6种常用抗菌药物(头孢曲松、氨曲南、左氧氟沙星、环丙沙星、庆大霉素、阿米卡星)的药敏性,荧光定量PCR法检测Omp A、Omp F、Omp C m RNA表达水平,蛋白垂直电泳检测Omp A、Omp F和Omp C蛋白的表达水平。结果 1058株大肠埃希菌耐药情况为头孢曲松(67%)、环丙沙星(65.9%)、左氧氟沙星(61.9%)、庆大霉素(50.3%)、氨曲南(48.1%)、阿米卡星(3.7%)、单药耐药(31.0%)、双药耐药(30.9%)和多重耐药(27.9%),在多重耐药株中呈现Omp C m RNA和Omp C蛋白的高表达。结论大肠埃希菌外膜蛋白Omp C表达的强弱与细菌耐药有关,可能是导致细菌耐药的原因之一。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 多重耐药 外膜蛋白
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烧伤病区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的耐药性及同源性分析 被引量:2
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作者 刘文淼 王文 +3 位作者 马红 李莎莎 赵梅 李刚 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期566-569,共4页
目的研究烧伤病区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的耐药性及同源性,为控制MRSA的院内传播提供依据。方法烧伤病区9名患者分离到的MRSA,用VITEK 2-Compact微生物鉴定系统进行菌种鉴定和药敏,以DiversiLab分型系统进行同源性分析。结果除... 目的研究烧伤病区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的耐药性及同源性,为控制MRSA的院内传播提供依据。方法烧伤病区9名患者分离到的MRSA,用VITEK 2-Compact微生物鉴定系统进行菌种鉴定和药敏,以DiversiLab分型系统进行同源性分析。结果除MRSA-9外,其余8株MRSA对11种抗菌药物具有相同药敏谱,且为多重耐药株,但不存在万古霉素和利奈唑胺耐药株;DiversiLab系统也显示该8株菌为同一组,MRSA-9为一组。结论烧伤病区MRSA院内感染较为严重,应采取有效的预防与控制措施。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 耐药性 DiversiLab系统 同源性
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