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过表达环状RNA孤儿核受体4A1(circNR4A1/Hsa-circ-0026352)抑制MCF-7乳腺癌细胞增殖并促进其凋亡
被引量：
2
1
作者
张旭
纳玮
+5 位作者
田进海
黄琦
于晶晶
王嘉
马荣
王立斌
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1109-1117,共9页
目的环状RNA Hsa-circ-0026352(circNR4A1)在乳腺癌患者组织、外周血、细胞系中的相对表达及其对细胞增殖、凋亡的影响。方法通过人circRNA芯片筛选在乳腺癌组织及癌旁组织中差异表达的circRNA,通过实时定量PCR验证circNR4A1在15对乳腺...
目的环状RNA Hsa-circ-0026352(circNR4A1)在乳腺癌患者组织、外周血、细胞系中的相对表达及其对细胞增殖、凋亡的影响。方法通过人circRNA芯片筛选在乳腺癌组织及癌旁组织中差异表达的circRNA,通过实时定量PCR验证circNR4A1在15对乳腺癌组织及癌旁正常组织、40例患者及40例健康人群外周血以及MCF-7、HCC-1937、MDA-MB-231、T-47D人乳腺癌细胞及MCF-10A人乳腺上皮细胞的表达。使用circPrimer 1.2软件绘制circRNA结构图,使用环状RNA交互作用组(Circular RNA interactome)数据库预测circRNA结合的miRNA和RNA-蛋白结合位点,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库进行circRNA生物学功能预测。构建circNR4A1过表达载体并转染MCF-7细胞,采用CCK-8法和克隆形成实验检测乳腺癌细胞增殖、Hoechst33258染色结合流式细胞技术检测细胞凋亡和细胞周期,实时定量PCR检测癌细胞丝裂原激活蛋白激酶激酶/细胞外信号调节激酶(MEK/ERK)信号通路因子K-RAS、MEK、ERK,凋亡相关基因B细胞白血病/淋巴瘤因子2(Bcl2)、B细胞白血病/淋巴瘤因子2关联凋亡因子X(BAX)、B细胞白血病/淋巴瘤因子2细胞死亡激活子(BAD)、胱天蛋白酶3(caspase-3)等mRNA水平,Western blot法检测MEK、ERK、Bcl2、BAD、caspase-3蛋白水平。结果circNR4A1(Hsa-circ-0026352)在乳腺癌组织、外周血、乳腺癌细胞系中表达显著低于癌旁组织、健康人群外周血、人乳腺上皮细胞。在MCF-7细胞中过表达circNR4A1能够抑制癌细胞增殖,促进细胞凋亡,阻滞细胞周期于G1/S期,并抑制MEK、ERK、Bcl2蛋白表达,促进BAD、caspase-3蛋白表达。结论circNR4A1/Hsa-circ-0026352在乳腺癌细胞中低表达,过表达circNR4A1能够显著抑制MCF-7细胞增殖,诱导细胞凋亡。
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关键词
环状RNA
乳腺癌
环状RNA孤儿核受体4A1(circNR4A1)
细胞增殖
细胞凋亡
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职称材料
脊柱结核椎间盘LncRNA表达差异性分析及潜在诊断标志物筛选
被引量：
1
2
作者
林剑文
王立楠
+5 位作者
张旭
王辉
郭乐
师志云
杨宗强
牛宁奎
《中国脊柱脊髓杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期841-851,共11页
目的:应用表达谱芯片检测脊柱结核(spinal tuberculosis,STB)患者椎间盘中差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)及mRNA,并筛选有诊断标志物潜力的LncRNA。方法:从2018年9月~2020年12月于宁夏医科大学附属总医院脊柱骨...
目的:应用表达谱芯片检测脊柱结核(spinal tuberculosis,STB)患者椎间盘中差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)及mRNA,并筛选有诊断标志物潜力的LncRNA。方法:从2018年9月~2020年12月于宁夏医科大学附属总医院脊柱骨科就诊的患者中选取STB患者(实验组)及脊柱退变患者(对照组)各28例。收集两组患者病变椎间盘并提取总RNA,两组各挑选3例合格标本通过Arraystar人类LncRNA V5.0版芯片进行检测并进行芯片数据处理计算各RNA的差异倍数(fold change,FC),其中FC≥2的LncRNA及mRNA为差异表达的RNA(P<0.05)。将差异表达的LncRNA邻近的差异表达的mRNA视为cis-靶基因,将LncRNA可能结合的蛋白质视为trans-靶蛋白,并对mRNA、cis-靶基因、trans-靶蛋白进行基因功能注释分析。从差异表达的LncRNA中选取cis-靶基因与STB发病可能相关的LncRNA用剩余各25例标本进行RT-PCR验证,筛选有诊断标志物潜力的LncRNA并进行基因功能注释分析。结果:基于两组间芯片数据的差异共筛选出444个差异表达的LncRNA、186个差异表达的mRNA。基因功能注释分析提示差异表达的LncRNA的cis-靶基因主要参与对转录、翻译、剪接、免疫反应、自然杀伤细胞介导的细胞毒性等生物学过程的调控及信号通路的传递;trans-靶蛋白主要参与对RNA的剪接、加工、转运等基因表达过程的调控;差异表达的mRNA主要参与对转录、翻译、剪接、炎症反应、免疫反应等生物学过程的调控及信号通路的传递。RT-PCR验证发现LINC01128-201、Lnc-DNALI1-205在STB患者中存在明显下调表达,与芯片检测结果一致,且这两个LncRNA可能通过调控ISG15、SNIP1、HES4表达量在STB发病过程中发挥重要作用。结论:STB患者与脊柱退变患者椎间盘的LncRNA及mRNA存在较大的表达差异,其中下调表达的LINC01128-201、Lnc-DNALI1-205可能在STB发病过程中发挥重要作用,且有成为诊断标志物的潜力。
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关键词
脊柱结核
长链非编码RNA
诊断标志物
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职称材料
题名
过表达环状RNA孤儿核受体4A1(circNR4A1/Hsa-circ-0026352)抑制MCF-7乳腺癌细胞增殖并促进其凋亡
被引量：
2
1
作者
张旭
纳玮
田进海
黄琦
于晶晶
王嘉
马荣
王立斌
机构
宁夏
医科
大学
总
医院
生物芯片
北京
国家工程研究中心
宁夏
分
中心
宁夏
医科
大学
临床医学院
银川市疾病预防控制
中心
微
生物
检验科
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1109-1117,共9页
基金
国家自然科学基金(81560474)
宁夏自然科学基金(2018AAC03156)
+2 种基金
宁夏科技创新领军人才项目(KJT2019003)
宁夏自治区重点研发计划项目(2019BFH02012)
宁夏高等学校一流学科建设(宁夏医科大学国内一流学科临床医学)资助(NXYLXK2017A05)
文摘
目的环状RNA Hsa-circ-0026352(circNR4A1)在乳腺癌患者组织、外周血、细胞系中的相对表达及其对细胞增殖、凋亡的影响。方法通过人circRNA芯片筛选在乳腺癌组织及癌旁组织中差异表达的circRNA,通过实时定量PCR验证circNR4A1在15对乳腺癌组织及癌旁正常组织、40例患者及40例健康人群外周血以及MCF-7、HCC-1937、MDA-MB-231、T-47D人乳腺癌细胞及MCF-10A人乳腺上皮细胞的表达。使用circPrimer 1.2软件绘制circRNA结构图,使用环状RNA交互作用组(Circular RNA interactome)数据库预测circRNA结合的miRNA和RNA-蛋白结合位点,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库进行circRNA生物学功能预测。构建circNR4A1过表达载体并转染MCF-7细胞,采用CCK-8法和克隆形成实验检测乳腺癌细胞增殖、Hoechst33258染色结合流式细胞技术检测细胞凋亡和细胞周期,实时定量PCR检测癌细胞丝裂原激活蛋白激酶激酶/细胞外信号调节激酶(MEK/ERK)信号通路因子K-RAS、MEK、ERK,凋亡相关基因B细胞白血病/淋巴瘤因子2(Bcl2)、B细胞白血病/淋巴瘤因子2关联凋亡因子X(BAX)、B细胞白血病/淋巴瘤因子2细胞死亡激活子(BAD)、胱天蛋白酶3(caspase-3)等mRNA水平,Western blot法检测MEK、ERK、Bcl2、BAD、caspase-3蛋白水平。结果circNR4A1(Hsa-circ-0026352)在乳腺癌组织、外周血、乳腺癌细胞系中表达显著低于癌旁组织、健康人群外周血、人乳腺上皮细胞。在MCF-7细胞中过表达circNR4A1能够抑制癌细胞增殖,促进细胞凋亡,阻滞细胞周期于G1/S期,并抑制MEK、ERK、Bcl2蛋白表达,促进BAD、caspase-3蛋白表达。结论circNR4A1/Hsa-circ-0026352在乳腺癌细胞中低表达,过表达circNR4A1能够显著抑制MCF-7细胞增殖,诱导细胞凋亡。
关键词
环状RNA
乳腺癌
环状RNA孤儿核受体4A1(circNR4A1)
细胞增殖
细胞凋亡
Keywords
circular RNA
breast cancer
circNR4A1
proliferation
apoptosis
分类号
Q279 [生物学—细胞生物学]
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
脊柱结核椎间盘LncRNA表达差异性分析及潜在诊断标志物筛选
被引量：
1
2
作者
林剑文
王立楠
张旭
王辉
郭乐
师志云
杨宗强
牛宁奎
机构
宁夏
医科
大学
临床医学院
福建省福清市
医院
骨科
宁夏医科大学总医院生物芯片北京国家工程研究中心宁夏中心
宁夏
医科
大学
临床医学院
宁夏
临床病原微
生物
重点实验室
宁夏
医科
大学
总
医院
医学实验
中心
宁夏
医科
大学
总
医院
脊柱骨科
出处
《中国脊柱脊髓杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期841-851,共11页
基金
国家自然科学基金项目(编号:81860395)
宁夏自然科学基金(编号:2020AAC03391)
+1 种基金
自治区卫生健康系统科研课题(编号:2019-NW-011)
宁夏高等学校一流学科建设(宁夏医科大学国内一流建设学科临床医学)资助项目(编号:NXYLXK2017A05)。
文摘
目的:应用表达谱芯片检测脊柱结核(spinal tuberculosis,STB)患者椎间盘中差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)及mRNA,并筛选有诊断标志物潜力的LncRNA。方法:从2018年9月~2020年12月于宁夏医科大学附属总医院脊柱骨科就诊的患者中选取STB患者(实验组)及脊柱退变患者(对照组)各28例。收集两组患者病变椎间盘并提取总RNA,两组各挑选3例合格标本通过Arraystar人类LncRNA V5.0版芯片进行检测并进行芯片数据处理计算各RNA的差异倍数(fold change,FC),其中FC≥2的LncRNA及mRNA为差异表达的RNA(P<0.05)。将差异表达的LncRNA邻近的差异表达的mRNA视为cis-靶基因,将LncRNA可能结合的蛋白质视为trans-靶蛋白,并对mRNA、cis-靶基因、trans-靶蛋白进行基因功能注释分析。从差异表达的LncRNA中选取cis-靶基因与STB发病可能相关的LncRNA用剩余各25例标本进行RT-PCR验证,筛选有诊断标志物潜力的LncRNA并进行基因功能注释分析。结果:基于两组间芯片数据的差异共筛选出444个差异表达的LncRNA、186个差异表达的mRNA。基因功能注释分析提示差异表达的LncRNA的cis-靶基因主要参与对转录、翻译、剪接、免疫反应、自然杀伤细胞介导的细胞毒性等生物学过程的调控及信号通路的传递;trans-靶蛋白主要参与对RNA的剪接、加工、转运等基因表达过程的调控;差异表达的mRNA主要参与对转录、翻译、剪接、炎症反应、免疫反应等生物学过程的调控及信号通路的传递。RT-PCR验证发现LINC01128-201、Lnc-DNALI1-205在STB患者中存在明显下调表达,与芯片检测结果一致,且这两个LncRNA可能通过调控ISG15、SNIP1、HES4表达量在STB发病过程中发挥重要作用。结论:STB患者与脊柱退变患者椎间盘的LncRNA及mRNA存在较大的表达差异,其中下调表达的LINC01128-201、Lnc-DNALI1-205可能在STB发病过程中发挥重要作用,且有成为诊断标志物的潜力。
关键词
脊柱结核
长链非编码RNA
诊断标志物
Keywords
Spinal tuberculosis
LncRNA
Diagnostic markers
分类号
R529.2 [医药卫生—内科学]
R446.7 [医药卫生—诊断学]
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1
过表达环状RNA孤儿核受体4A1(circNR4A1/Hsa-circ-0026352)抑制MCF-7乳腺癌细胞增殖并促进其凋亡
张旭
纳玮
田进海
黄琦
于晶晶
王嘉
马荣
王立斌
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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职称材料
2
脊柱结核椎间盘LncRNA表达差异性分析及潜在诊断标志物筛选
林剑文
王立楠
张旭
王辉
郭乐
师志云
杨宗强
牛宁奎
《中国脊柱脊髓杂志》
CAS
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