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基于生物信息学研究探讨参芪抑瘤方联合顺铂对肝癌模型小鼠相关免疫基因及免疫功能的影响
1
作者
马兰
杨玉萍
+2 位作者
冯鑫
段永强
张治宁
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2025年第6期1721-1733,共13页
目的本研究旨在基于生物信息学研究参芪抑瘤方联合顺铂对肝癌模型小鼠相关免疫基因及免疫功能的影响。方法从TCGA和GEO数据库下载肝癌患者的基因表达谱和临床数据,并与ImmPort数据库下载的免疫相关基因取交集筛选免疫表达基因。计算免...
目的本研究旨在基于生物信息学研究参芪抑瘤方联合顺铂对肝癌模型小鼠相关免疫基因及免疫功能的影响。方法从TCGA和GEO数据库下载肝癌患者的基因表达谱和临床数据,并与ImmPort数据库下载的免疫相关基因取交集筛选免疫表达基因。计算免疫相关基因对系数(IRGPI)以构建IRGP预后模型。根据ROC曲线分析确定肝癌患者1年总生存率的IRGPI的最佳cut-off值,并将肝癌患者分为高、低免疫风险组,使用Kaplan-Meier法及Log-Rank检验分析两组患者的生存状态。接着通过网络药理学技术筛选参芪抑瘤方治疗肝癌的有效成分和基因靶点,并获得参芪抑瘤方与疾病的交集基因,然后通过R软件“VennDiagram”提取肝癌相关免疫基因和参芪抑瘤方与疾病的交集基因的交集,并通过动物模型验证参芪抑瘤方联合顺铂对肝癌模型小鼠肿瘤组织中相关免疫基因及免疫功能的影响。结果在2483个相关免疫基因中,有84对免疫相关基因与实验组OS显著相关(P<0.001),以cut-off值-0.258将患者分为高、低免疫风险组中,高免疫风险组的总生存率明显低于低免疫风险组(P<0.001)。单因素Cox分析显示,IRGP模型风险值与肿瘤T分期临床特征对预后有影响。多因素Cox分析显示,IRGP模型风险值与肿瘤T分期可以作为独立预后因素。通过网络药理学技术筛选出266个参芪抑瘤方与肝癌的交集基因,进一步与84对免疫相关基因取交集得8个基因。动物实验结果显示,与模型组相比,各治疗组小鼠瘤质量均有下降(P<0.05);小鼠脾指数和胸腺指数均升高(P<0.05);小鼠血清和脾脏组织中CD4+/CD8+比值均降低;小鼠肿瘤组织中ICAM1、FABP5、IGF2、CDK4、NR1、ADRB2、AR、NR3C2 mRNA的表达均下降(P<0.05),且联合组治疗效果显著(P<0.01)。结论本研究预测了肝癌相关的关键免疫基因以及免疫相关基因的预后分析,实验研究验证了参芪抑瘤方能够有效降低肿瘤组织中相关免疫基因的表达,并能改善肝癌模型小鼠脾脏组织中相关免疫细胞比例以及提高小鼠免疫功能。
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关键词
原发性肝癌
免疫相关基因(IRG)
参芪抑瘤方
免疫功能
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职称材料
题名
基于生物信息学研究探讨参芪抑瘤方联合顺铂对肝癌模型小鼠相关免疫基因及免疫功能的影响
1
作者
马兰
杨玉萍
冯鑫
段永强
张治宁
机构
宁夏
医科
大学
总医院
甘肃中
医药
大学
基础医学院
宁夏医科大学宁夏少数民族医药现代化教育部重点实验室
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2025年第6期1721-1733,共13页
基金
宁夏自然科学基金一般项目(联合基金单位)(2023AAC03595):基于PI3K/Akt/mTOR介导糖酵解研究参芪抑瘤方对HepG2/DDP肝癌裸鼠顺铂耐药的逆转作用及分子机制
负责人:马兰。
文摘
目的本研究旨在基于生物信息学研究参芪抑瘤方联合顺铂对肝癌模型小鼠相关免疫基因及免疫功能的影响。方法从TCGA和GEO数据库下载肝癌患者的基因表达谱和临床数据,并与ImmPort数据库下载的免疫相关基因取交集筛选免疫表达基因。计算免疫相关基因对系数(IRGPI)以构建IRGP预后模型。根据ROC曲线分析确定肝癌患者1年总生存率的IRGPI的最佳cut-off值,并将肝癌患者分为高、低免疫风险组,使用Kaplan-Meier法及Log-Rank检验分析两组患者的生存状态。接着通过网络药理学技术筛选参芪抑瘤方治疗肝癌的有效成分和基因靶点,并获得参芪抑瘤方与疾病的交集基因,然后通过R软件“VennDiagram”提取肝癌相关免疫基因和参芪抑瘤方与疾病的交集基因的交集,并通过动物模型验证参芪抑瘤方联合顺铂对肝癌模型小鼠肿瘤组织中相关免疫基因及免疫功能的影响。结果在2483个相关免疫基因中,有84对免疫相关基因与实验组OS显著相关(P<0.001),以cut-off值-0.258将患者分为高、低免疫风险组中,高免疫风险组的总生存率明显低于低免疫风险组(P<0.001)。单因素Cox分析显示,IRGP模型风险值与肿瘤T分期临床特征对预后有影响。多因素Cox分析显示,IRGP模型风险值与肿瘤T分期可以作为独立预后因素。通过网络药理学技术筛选出266个参芪抑瘤方与肝癌的交集基因,进一步与84对免疫相关基因取交集得8个基因。动物实验结果显示,与模型组相比,各治疗组小鼠瘤质量均有下降(P<0.05);小鼠脾指数和胸腺指数均升高(P<0.05);小鼠血清和脾脏组织中CD4+/CD8+比值均降低;小鼠肿瘤组织中ICAM1、FABP5、IGF2、CDK4、NR1、ADRB2、AR、NR3C2 mRNA的表达均下降(P<0.05),且联合组治疗效果显著(P<0.01)。结论本研究预测了肝癌相关的关键免疫基因以及免疫相关基因的预后分析,实验研究验证了参芪抑瘤方能够有效降低肿瘤组织中相关免疫基因的表达,并能改善肝癌模型小鼠脾脏组织中相关免疫细胞比例以及提高小鼠免疫功能。
关键词
原发性肝癌
免疫相关基因(IRG)
参芪抑瘤方
免疫功能
Keywords
Primary hepatocellular carcinoma
Immune-related gene(IRG)
Ginseng qi tumor-suppressing formula
Immunity
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
基于生物信息学研究探讨参芪抑瘤方联合顺铂对肝癌模型小鼠相关免疫基因及免疫功能的影响
马兰
杨玉萍
冯鑫
段永强
张治宁
《世界科学技术-中医药现代化》
北大核心
2025
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