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hsa-miR-130家族生物信息分析及在SLE中差异表达分析
1
作者
栾鹏飞
周少岚
+3 位作者
党洁
贾维
马占兵
霍正浩
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第19期2305-2311,共7页
目的:通过生物信息学方法预测hsa-miR-130家族靶基因及其功能机制。方法:检索PubMed有关hsa-miR130家族的研究报道并进行相关分析;检索miRbase获取hsa-miR-130家族序列;通过miRanda、TargetScan、PicTar数据库交叉预测靶基因,对其进行...
目的:通过生物信息学方法预测hsa-miR-130家族靶基因及其功能机制。方法:检索PubMed有关hsa-miR130家族的研究报道并进行相关分析;检索miRbase获取hsa-miR-130家族序列;通过miRanda、TargetScan、PicTar数据库交叉预测靶基因,对其进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。RT-qPCR验证hsa-miR-130a-3p在系统性红斑狼疮(SLE)患者PBMC中的表达情况。结果:hsa-miR-130家族成熟序列在各物种间高度保守;多数据库联合预测获得的285个靶基因存在于细胞的多个组分,主要包括调控细胞周期、信号转导、DNA合成调控等分子功能;并富集于雌激素膜受体信号转导等其他信号通路;hsa-miR-130a-3p在SLE患者中表达下调。结论:hsa-miR-130家族靶基因功能富集于多个生物学过程,并通过调控免疫相关靶基因参与SLE疾病过程,可作为潜在疾病研究标志物。
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关键词
hsa-miR-130家族
生物信息
系统性红斑狼疮
表达分析
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职称材料
失活X染色体基因逃逸与系统性红斑狼疮的性别二态性
被引量:
1
2
作者
马茜
周少岚
+2 位作者
党洁
霍正浩
马占兵
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期18-33,共16页
X染色体失活可平衡女性中两条X染色体的基因剂量。越来越多的证据表明,失活X染色体上存在许多能够逃逸失活的基因。逃逸的机制涉及到DNA、RNA、组蛋白的表观修饰以及众多的调控蛋白和染色质的空间结构。失活X染色体基因逃逸的研究为人...
X染色体失活可平衡女性中两条X染色体的基因剂量。越来越多的证据表明,失活X染色体上存在许多能够逃逸失活的基因。逃逸的机制涉及到DNA、RNA、组蛋白的表观修饰以及众多的调控蛋白和染色质的空间结构。失活X染色体基因逃逸的研究为人类疾病(特别是自身免疫性疾病)性别二态性的研究开辟了新的途径。目前已证实包括TLR7、CD40L、IRAK-1、CXCR3、CXorf21等失活X染色体基因逃逸是系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)女性好发的重要原因。本文主要综述了失活X染色体上基因逃逸以及与SLE性别二态性形成的分子机制。阐明SLE性别二态性形成的分子机制,不仅对疾病的诊断、治疗具有重要意义,而且对深入揭示人类免疫系统的发育及调控机理也有重要的理论意义。
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关键词
失活X染色体
基因
逃逸
性别二态性
系统性红斑狼疮
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职称材料
题名
hsa-miR-130家族生物信息分析及在SLE中差异表达分析
1
作者
栾鹏飞
周少岚
党洁
贾维
马占兵
霍正浩
机构
宁夏
医科
大学
基础
医学院
医学
遗传学
系
与细胞
生物学系
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第19期2305-2311,共7页
基金
国家自然科学基金(81960306,31960195)资助。
文摘
目的:通过生物信息学方法预测hsa-miR-130家族靶基因及其功能机制。方法:检索PubMed有关hsa-miR130家族的研究报道并进行相关分析;检索miRbase获取hsa-miR-130家族序列;通过miRanda、TargetScan、PicTar数据库交叉预测靶基因,对其进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。RT-qPCR验证hsa-miR-130a-3p在系统性红斑狼疮(SLE)患者PBMC中的表达情况。结果:hsa-miR-130家族成熟序列在各物种间高度保守;多数据库联合预测获得的285个靶基因存在于细胞的多个组分,主要包括调控细胞周期、信号转导、DNA合成调控等分子功能;并富集于雌激素膜受体信号转导等其他信号通路;hsa-miR-130a-3p在SLE患者中表达下调。结论:hsa-miR-130家族靶基因功能富集于多个生物学过程,并通过调控免疫相关靶基因参与SLE疾病过程,可作为潜在疾病研究标志物。
关键词
hsa-miR-130家族
生物信息
系统性红斑狼疮
表达分析
Keywords
hsa-miR-130 family
Bioinformatics
SLE
Expression analysis
分类号
R394 [医药卫生—医学遗传学]
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职称材料
题名
失活X染色体基因逃逸与系统性红斑狼疮的性别二态性
被引量:
1
2
作者
马茜
周少岚
党洁
霍正浩
马占兵
机构
宁夏
大学
生命科学
学院
宁夏医科大学基础医学院医学遗传学与细胞生物学系
宁夏
医科
大学
总医院风湿免疫科
宁夏
医科
大学
教育部生育力保持重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期18-33,共16页
基金
国家自然科学基金项目(编号:82060301,81960306)
宁夏自然科学基金项目(编号:22KJB180014,2020AAC03116)资助。
文摘
X染色体失活可平衡女性中两条X染色体的基因剂量。越来越多的证据表明,失活X染色体上存在许多能够逃逸失活的基因。逃逸的机制涉及到DNA、RNA、组蛋白的表观修饰以及众多的调控蛋白和染色质的空间结构。失活X染色体基因逃逸的研究为人类疾病(特别是自身免疫性疾病)性别二态性的研究开辟了新的途径。目前已证实包括TLR7、CD40L、IRAK-1、CXCR3、CXorf21等失活X染色体基因逃逸是系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)女性好发的重要原因。本文主要综述了失活X染色体上基因逃逸以及与SLE性别二态性形成的分子机制。阐明SLE性别二态性形成的分子机制,不仅对疾病的诊断、治疗具有重要意义,而且对深入揭示人类免疫系统的发育及调控机理也有重要的理论意义。
关键词
失活X染色体
基因
逃逸
性别二态性
系统性红斑狼疮
Keywords
inactive X chromosome
gene
escape
sexual dimorphism
systemic lupus erythematosus
分类号
R593.241 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
hsa-miR-130家族生物信息分析及在SLE中差异表达分析
栾鹏飞
周少岚
党洁
贾维
马占兵
霍正浩
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
在线阅读
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职称材料
2
失活X染色体基因逃逸与系统性红斑狼疮的性别二态性
马茜
周少岚
党洁
霍正浩
马占兵
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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职称材料
已选择
0
条
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统计分析
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