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云南水稻种质资源的遗传多样性分析
被引量：
16
1
作者
邓伟
吕莹
+14 位作者
董阳均
徐雨然
杨华涛
张锦文
张建华
奎丽梅
涂建
相罕章
管俊娇
董维
谷安宇
安华
杨丽萍
张笑
李小林
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期624-635,共12页
利用基因芯片GSR40K评估了135份来自云南不同海拔地区水稻种质资源的遗传多样性和群体结构。结果显示云南不同海拔地区水稻种质资源具有较丰富的遗传多样性,利用SNP标记进行籼粳特性分型,将种质资源分为籼稻类型、偏籼类型、中间类型、...
利用基因芯片GSR40K评估了135份来自云南不同海拔地区水稻种质资源的遗传多样性和群体结构。结果显示云南不同海拔地区水稻种质资源具有较丰富的遗传多样性,利用SNP标记进行籼粳特性分型,将种质资源分为籼稻类型、偏籼类型、中间类型、粳稻类型和偏粳类型;利用单倍型标记和功能标记鉴定了与育种相关的82个基因,结果表明135份材料都含有非落粒性相关的基因,接近70%的水稻品种含有稻瘟病抗性基因,含有抗虫基因及香味基因的品种数量较少;利用聚类和主成分分析将135份材料分成7个亚群,通过遗传分化指数GST值评估每一个标记位点在7个亚群之间的分化程度,结果表明7个亚群间存在高度的遗传分化,且135份水稻品种基因组区域上至少有0.09%的区域是完全不一样的,而有0.08%的区域是频繁交流和固定的,因此不同亚群间的基因交流频率极低。利用亚群间海拔高度的差异,分析群体间的差异基因组区域,推测可能是与海拔适应性相关。本研究结果为云南地方水稻资源的有效保护和高效利用提供科学依据。
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关键词
遗传多样性
群体结构
基因芯片
SNP标记
遗传分化
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职称材料
题名
云南水稻种质资源的遗传多样性分析
被引量：
16
1
作者
邓伟
吕莹
董阳均
徐雨然
杨华涛
张锦文
张建华
奎丽梅
涂建
相罕章
管俊娇
董维
谷安宇
安华
杨丽萍
张笑
李小林
机构
云南省
农业
科学院粮食作物研究所
云南省主要农作物种子加工工程技术研究
中心
云南省稻作遗传改良重点实验室
水富
县
种子管理站
孟连县勐马镇农业综合服务中心
孟连
县
农业
技术推广
中心
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期624-635,共12页
基金
云南省重大科技专项计划(202102AE090016)
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-01-102)
+2 种基金
云南省科技创新平台建设计划(2015DH012)
粮食安全种业支撑专项(530000210000000013809)
云南省科技人才与平台计划(202105AE160009)。
文摘
利用基因芯片GSR40K评估了135份来自云南不同海拔地区水稻种质资源的遗传多样性和群体结构。结果显示云南不同海拔地区水稻种质资源具有较丰富的遗传多样性,利用SNP标记进行籼粳特性分型,将种质资源分为籼稻类型、偏籼类型、中间类型、粳稻类型和偏粳类型;利用单倍型标记和功能标记鉴定了与育种相关的82个基因,结果表明135份材料都含有非落粒性相关的基因,接近70%的水稻品种含有稻瘟病抗性基因,含有抗虫基因及香味基因的品种数量较少;利用聚类和主成分分析将135份材料分成7个亚群,通过遗传分化指数GST值评估每一个标记位点在7个亚群之间的分化程度,结果表明7个亚群间存在高度的遗传分化,且135份水稻品种基因组区域上至少有0.09%的区域是完全不一样的,而有0.08%的区域是频繁交流和固定的,因此不同亚群间的基因交流频率极低。利用亚群间海拔高度的差异,分析群体间的差异基因组区域,推测可能是与海拔适应性相关。本研究结果为云南地方水稻资源的有效保护和高效利用提供科学依据。
关键词
遗传多样性
群体结构
基因芯片
SNP标记
遗传分化
Keywords
genetic diversity
population structure
gene chip
SNP markers
genetic differentiation
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
云南水稻种质资源的遗传多样性分析
邓伟
吕莹
董阳均
徐雨然
杨华涛
张锦文
张建华
奎丽梅
涂建
相罕章
管俊娇
董维
谷安宇
安华
杨丽萍
张笑
李小林
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
16
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